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AffiXcan公司

一种实现基因调控表达的函数方法


生物导体版本:释放(3.19)

使用基于总结合亲和力(TBA)的方法,为样本个体中的一组基因计算GReX(基因调控表达)。用于插补GReX的统计模型可以使用已知实际总表达式值的训练数据集进行训练。

作者:亚历山德罗·卢萨纳[aut,cre]

维护人员:Alessandro Lussana<Alessandro Lussana在protonmail.com>

引文(从R中输入引文(“AffiXcan”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“AffiXcan”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“附加扫描”)
AffiXcan公司 HTML格式 R脚本
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新闻 文本

细节

生物视图 尺寸缩减,基因表达式,基因调控,主要组件,回归,软件,转录
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 R(>=3.6),总结性实验
进口 多重分析实验,生物并行,蜡笔
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 附件_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 AffiXcan_1.22.0.zip附件
macOS二进制(x86_64) 附件_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) 附件_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/AffiXcan
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/AffiXcan网站/
包短Url https://bioductor.org/packages/AffiXcan/
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