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基于低平均全基因组测序的绝对拷贝数估计


生物导体版本:释放(3.19)

使用分段拷贝数数据估计肿瘤细胞百分比,并生成拷贝数图,显示绝对拷贝数。

作者:乔斯·波埃尔

维护人员:乔斯·波埃尔(Jos B Poell)<j.Poell at amsterdamumc.nl>

引文(从R中输入引文(“ACE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“ACE”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“ACE”)
ACE渐晕图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 副本编号变化,新闻报道,DNASeq公司,排序,软件,可视化,全基因组
版本 1.22.0
在生物导体中 生物技术3.8(R-3.5)(5.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=3.4)
进口 博科生物,QDNAseq公司,ggplot2,网格,统计,实用程序,方法,grDevices,基因组范围
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/tgac-vumc/ACE
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 ACE_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 ACE_1.22.0.zip标准
macOS二进制(x86_64) 血管紧张素转换酶_1.22.0.tgz
macOS二进制(arm64) ACE_1.22.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ACE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ACE
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ACE/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ACE/
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