关于生物导体
生物导体项目的任务是开发、支持和传播免费开放源码软件，促进严格和当前和新兴生物检测数据的可重复性分析。我们致力于建立多元化、协作性和欢迎性的开发人员和数据科学家社区。
科学,技术和社区咨询委员会提供项目监督。
发布和核心开发
生物导体发布版本已更新每年两次，适合大多数用户。还有一个开发版本、新功能和包是在发布之前添加的。A大型数量元数据包提供通路、生物体、微阵列和其他注释。
生物传导项目始于2001年，由核心团队.A型社区咨询委员会和a技术咨询委员会关键参与者的每月召开会议，通过协调支持生物导体任务培训和外联活动，制定战略以确保长期核心基础设施的技术适用性，以及识别和启用长期生存能力的融资策略。一个科学咨询委员会包括外部专家提供年度指导和问责。
该项目的关键引文包括Huber等人，2015年自然方法12:115-121和Gentleman等人，2004年基因组生物学5:R80
生物导体封装
大多数生物导体组件分布为R（右）包装。的功能范围生物导体封装包括DNA微阵列、序列、流、SNP和其他基因的分析或基因组数据。
项目目标
生物导体项目的主要目标是：
- 提供广泛的强大统计数据基因组数据分析的图形方法。
- 促进在分析基因组数据，例如PubMed的文献数据Entrez基因。
- 提供一个通用的软件平台，实现快速开发以及可扩展、可扩展和互操作软件的部署。
- 通过生产高质量产品来加深科学认识文档和可再生研究。
- 收件人火车计算和基因组数据分析的统计方法。
项目主要特点
统计计算R项目。使用R（右）提供了广泛的优势生物导体项目，包括：
- 易于快速原型化的高级解释语言新的计算方法。
- 一个完善的系统，用于将软件与文档。
- 一个面向对象的框架，用于解决多样性和计算生物学和生物信息学问题的复杂性。
- 获取在线计算生物学和生物信息学数据。
- 支持丰富的统计模拟和建模活动。
- 先进的数据和模型可视化功能。
- 由专门的研究人员团队积极开发致力于良好的文档和软件设计。
文件和可复制研究
每个生物导体组件包含一个或多个小插曲，提供软件包功能的文本、面向任务的描述。幻影有几种形式。许多是“HowTo”，可以证明如何使用该软件包的软件完成特定任务。其他人提供了更全面的包概述或讨论一般与包相关的问题。
统计和图解方法
生物导体项目提供了强大的统计和图形方法，用于基因组数据分析。分析包地址工作流用于分析寡核苷酸阵列，序列分析，流式细胞术。和其他高通量基因组数据。这个R包装系统它本身为广泛的最先进的统计和图形技术，包括线性和非线性建模、聚类分析、预测、，重采样、生存分析和时间序列分析。
注释
生物导体项目提供了用于关联微阵列和其他基因组的软件实时数据与来自网络数据库（如GenBank、Entrez genes）的生物元数据和PubMed(注释包装）。还提供了用于合并结果的功能HTML报告中的统计分析，链接到注释web资源。软件工具可用于组装和处理来自GenBank等数据库的基因组注释数据，基因本体联盟、Entrez基因、UniGene、UCSC人类基因组项目(注释Dbi包装）。注释数据包分布以提供不同探测之间的映射标识符（例如Affy ID、Entrez基因、PubMed）。定制的还可以组装注释库。
生物导体短期课程
生物导体项目开发了的程序短期课程关于软件和基因组数据分析的统计方法。课程已经面向具有生物学或统计学背景的观众。全部课程材料（讲座和计算机实验室）可在此网站上找到。还有一个生物导体教学委员会巩固以生物导体为重点培训材料并建立生物导体培训师社区。
开放源代码
生物导体项目承诺开放源码规程，通过公共git发布（版本控制）服务器。几乎所有捐款都存在于开源许可证。开放有很多不同的原因源软件有助于分析微阵列数据和对于一般的计算生物学。原因包括：
- 提供对算法及其实现的完全访问
- 通过错误修复和软件促进软件改进延伸
- 通过以下方式鼓励良好的科学计算和统计实践提供适当的工具和指导
- 提供一个工具工作台，允许研究人员探索和扩展用于分析生物数据的方法
- 确保国际科学界拥有开展研究所需的软件工具
- 领导并鼓励这些工具的商业支持和开发成功的
- 通过提供开放和易用的工具来促进可再生研究进行研究（可重复研究是不同的来自独立验证）
开放式开发
鼓励用户成为开发人员，或者通过贡献生物导体兼容封装或文档。此外，生物导体为将具有共同目标的不同群体联系在一起，以促进软件上的协作，通常是在共享开发级别上。
快速统计
有关该项目的统计数据选择。
快速统计信息
上次更新时间"2023-12-18"
总计3691发布包
45546715不同2023年的软件下载
18999活跃支持站点成员在过去的一年里
550激活松弛成员
122000谷歌学者结果
请求更新统计信息来源：maintainer@bioconductor.org
行为准则
请参阅生物导体行为准则
请联系生物管道公司@gmail.com
