序列搜索评分选项

以下是可以选择的两个评分选项：

• 本地/全局选项决定了模型和序列相互匹配。局部是指模型或序列的一部分，而全局是指整体。本地/本地匹配（默认）将发现模型的任何部分与序列。全局/全局匹配将整个序列的分数返回给整个模型。这是当您知道您的查询序列应该正好匹配一个域时非常有用。本地/全局匹配将找到模型的任何部分对整个序列的最佳得分。这对评分顺序很有用碎片。

• 爆炸预研是筛选出明显的高分命中，这些命中不需要针对更敏感但需要计算的命中昂贵的HMM库。此选项可以完全关闭，这在爆炸的情况下可能很有用假高分命中。众所周知，对于包含低复杂度或短重复的序列来说，这是可能的区域。