SUPERFAMILY 1.75 HMM库和基因组分配服务器

超级家族2可访问supfam.org。拜托联系我们如果你遇到任何问题。


p53 DNA结合域样家族

SCOP分类
根: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: 所有β蛋白[ 48724] (174)
折叠: 白喉毒素/转录因子/细胞色素f的常见折叠[49379人] (10)
超级家族: p53类转录因子[第49417页] (7)
家庭:   p53 DNA结合域样[ 81314] (2)


家庭统计
基因组(101) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
360 1,354 11
蛋白质 359 1,352 11


疾病本体(DO)

(
显示详细信息)
DO术语FDR(全部)SDDO级别注释(直接或继承)
疾病本体(DO)器官系统癌0信息最少直接
疾病本体(DO)神经系统疾病0信息最少直接
疾病本体(DO)传染源性疾病0信息量适中直接
疾病本体(DO)细胞型癌症0信息量适中直接
疾病本体(DO)良性肿瘤0信息量适中直接
疾病本体(DO)心理健康疾病0信息量适中直接
疾病本体(DO)血液系统癌症0信息量适中直接
疾病本体(DO)胃肠系统癌0信息量适中直接
疾病本体(DO)遗传病0信息量适中直接
疾病本体(DO)造血系统疾病0信息量适中直接
疾病本体(DO)胃肠系统疾病0信息量适中直接
疾病本体(DO)细胞型良性肿瘤0信息直接
疾病本体(DO)淋巴母细胞白血病0信息直接
疾病本体(DO)头颈部癌0信息直接
疾病本体(DO)内分泌腺癌0信息直接
疾病本体(DO)肺癌0信息直接
疾病本体(DO)遗传性乳腺卵巢癌综合征0信息直接
疾病本体(DO)肝癌0信息直接
疾病本体(DO)物质依赖性0信息直接
疾病本体(DO)鳞状细胞癌0高度信息化直接
疾病本体(DO)黑色素瘤0高度信息化直接
疾病本体(DO)喉癌0高度信息化直接
疾病本体(DO)腺癌0高度信息化直接
疾病本体(DO)肺腺癌0高度信息化直接
疾病本体(DO)进行性多灶性白质脑病0高度信息化直接

文档:SCOP域的DO注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)异常内稳态0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)死亡率/老龄化0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)内分泌/外分泌腺表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)细胞表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)生长/大小/身体部位表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)免疫系统表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)心血管系统表型0信息最少直接
哺乳动物表型(MP)轴向骨骼形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)异常炎症反应0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)体型异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)生殖系统形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)消化系统形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)肿瘤0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)细胞异常死亡0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)皮肤附件形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)眼睛形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)生殖系统生理异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)颅面形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)产前致死率0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)身体成分异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)头部形态异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)心血管系统生理异常0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)胎儿生长至断奶期间的致死率0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)呼吸系统表型0信息量适中直接
哺乳动物表型(MP)异常行为1信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)脊柱形态异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)异常自愿运动0信息直接
哺乳动物表型(MP)溶血磷脂系统肿瘤发病率增加0信息直接
哺乳动物表型(MP)腺体肿瘤发病率增加0信息直接
哺乳动物表型(MP)肠形态异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)体型缩小0信息直接
哺乳动物表型(MP)总组织质量减少0信息直接
哺乳动物表型(MP)软骨形态异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)卵巢形态异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)过早死亡0信息直接
哺乳动物表型(MP)出血0信息直接
哺乳动物表型(MP)流体调节异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)恶性肿瘤发病率增加0信息直接
哺乳动物表型(MP)肿瘤病理改变0信息直接
哺乳动物表型(MP)乳腺形态异常0信息直接
哺乳动物表型(MP)细胞核形态异常0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)过早老化0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)呼吸系统肿瘤发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)对诱导细胞死亡的敏感性降低0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)消化系统肿瘤发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)椎间盘形态异常0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)白血病发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)肉瘤发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)体重减轻0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)T细胞衍生淋巴瘤发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)乳腺肿瘤发病率增加0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)细胞凋亡减少0高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)腺癌发病率增加0高度信息化直接

文档:SCOP域的MP注释

斑马鱼解剖学(ZA)

(显示详细信息)
ZA术语FDR(全部)SDZA等级注释(直接或继承)
斑马鱼解剖学(ZA)有机体细分0信息最少直接

文档:SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息) 文档:SCOP域的XA注释

跳转到[页面顶部·SCOP分类·疾病本体(DO)·小鼠表型(MP)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)]

内部数据库链接

   
超级家庭级别 家庭层面

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


   
超级家庭级别 家庭层面

序列对齐26种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或粘贴或上传您自己的序列。


超级家庭级别

浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括p53类转录因子结构域。


   
超级家庭级别 家庭层面

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


跳转到[页面顶部·SCOP分类·疾病本体(DO)·小鼠表型(MP)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)·内部数据库链接]