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GLA-域超家族

根目录：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	小蛋白质[ 56992] (90)
折叠：	GLA-域[ 57629]
超级家族:	GLA-域[ 57630]
家庭：	GLA-域[57631个] (6)

超级家庭统计

	基因组(71)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	1,073	2,593	18
蛋白质	1,072	2,574	18

功能注释

一般类别	概述
详细类别	概述

文档：SCOP域超家族的功能注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEO水平	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	作用于肽键（肽水解酶）	0	信息最少	直接
酶委员会（EC）	丝氨酸内肽酶	0	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	凝血因子Xa	0	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	凝血因子IXa	0.00000000005175	高度信息化	直接
酶委员会（EC）	蛋白质C（活化）	0.0000000008721	高度信息化	直接

文档：SCOP域的EC注释

疾病本体（DO）

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体（DO）	造血系统疾病	0.00002096	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	综合征	0.0002617	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	泌尿系统疾病	0.000533	信息量适中	直接
疾病本体（DO）	内分泌系统疾病	0.006293	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	动脉疾病	0.4826	信息量适中	继承
疾病本体（DO）	遗传性凝血病	0.00003779	信息丰富	直接
疾病本体（DO）	动脉粥样硬化	0.00004929	信息丰富	直接
疾病本体（DO）	胰腺疾病	0.1591	信息丰富	继承
疾病本体（DO）	心肌梗死	0.911	信息丰富	继承
疾病本体（DO）	白塞病	0.00006451	高度信息化	直接
疾病本体（DO）	胰腺炎	0.0002036	高度信息化	直接

文档：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
表型异常（PA）	心血管系统异常	0	信息最少	直接
表型异常（PA）	神经系统形态异常	0.08099	信息最少	继承
表型异常（PA）	骨骼形态异常	0.2813	信息最少	继承
表型异常（PA）	肌肉组织异常	0.7255	信息最少	继承
表型异常（PA）	心血管系统生理异常	0	信息量适中	直接
表型异常（PA）	血液和造血组织异常	0.001986	信息量适中	继承
表型异常（PA）	关节形态异常	0.0416	信息量适中	继承
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.1673	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血管系统异常	0.179	信息量适中	继承
表型异常（PA）	骨骼肌形态异常	0.3539	信息量适中	继承
表型异常（PA）	混凝级联异常	0.0000000006877	信息丰富	直接
表型异常（PA）	异常出血	0.000003778	信息丰富	直接
表型异常（PA）	脑血管异常	0.00003604	信息丰富	直接
表型异常（PA）	异常血栓形成	0.001328	信息丰富	继承
表型异常（PA）	血液循环异常	0.001666	信息丰富	继承
表型异常（PA）	功能性呼吸异常	0.06208	信息丰富	继承
表型异常（PA）	深静脉血栓形成	0.000000001034	高度信息化	直接
表型异常（PA）	肌内血肿	0.00000001397	高度信息化	直接
表型异常（PA）	关节出血	0.000000181	高度信息化	直接
表型异常（PA）	凝血酶原时间延长	0.000004853	高度信息化	直接
表型异常（PA）	手术后持续出血	0.0008073	高度信息化	直接

文档：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	异常内稳态	0	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	心血管系统表型	0.001703	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	心血管系统生理异常	0.00005618	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	骨骼形态异常	0.8206	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常凝血	0.0000000004396	信息丰富	直接
哺乳动物表型（MP）	出血	0.0000003316	信息丰富	直接
哺乳动物表型（MP）	脂肪组织量异常	0.05039	信息丰富	继承
哺乳动物表型（MP）	骨小梁形态异常	0.05644	信息丰富	继承
哺乳动物表型（MP）	增加的体脂总量	0.0008724	高度信息化	直接

文档：SCOP域的MP注释

斑马鱼解剖学（ZA）

(显示详细信息) 文档：SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息) 文档：SCOP域的XA注释

酶委员会（EC）

(显示详细信息)

	EC术语	FDR（全部）	SDEC水平	注释（直接或继承）
酶委员会（EC）	水解酶类	0	信息最少	直接
酶委员会（EC）	作用于肽键（肽酶）	0	信息量适中	直接
酶委员会（EC）	丝氨酸内肽酶	0	信息丰富	直接

文档：SCOP域的EC注释

InterPro注释

交叉引用 IPR000294型 SSF57630型蛋白质匹配

摘要
该结构域包含许多谷氨酸残基的翻译后修饰，通过维生素K依赖的羧基化形成γ-羧基谷氨酸（Gla）[3106112,2183788].GLA结构域负责钙离子的高亲和力结合。它从成熟形式蛋白质的N末端开始，以一个保守的芳香残基结束；一个保守的Gla-x（3）-Gla-x-Cys基序[3317405]位于羧化酶对底物识别起重要作用的结构域的中间。

Gla域的3D结构已经解决[7713897,8663165]. 钙离子诱导Gla构象变化域和是Gla域正确折叠所必需的。一个普通的功能性Gla结构域的结构特征是N末端的聚集疏水残基变成疏水性斑块，介导与细胞表面膜[8663165].

InterPro数据库

关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息

交叉引用	PDB条目配体结合统计核酸结合统计二级结构元素的出现小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览这个超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。

序列对齐10种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示，但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列，或粘贴或上传您自己的序列。

浏览和查看基因组中具有包括GLA-域的不同域组合。

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象，即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。

探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有10个隐马尔可夫模型代表GLA-域超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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