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胱氨酸结细胞因子超家族

根：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	小蛋白质[ 56992] (90)
折叠：	胱氨酸结细胞因子[ 57500]
超级家族:	胱氨酸结细胞因子[ 57501] (7)
家庭：	血小板衍生生长因子样[57502个] (3)
	转化生长因子（TGF）-β[ 57507] (7)
	诺金[ 82904]
	神经营养素[ 57520] (4)
	促性腺激素/福利曲平[ 57528] (3)
	白介素17F、白介素-17F[ 69955]
	凝血原[ 57531]

超级家庭统计

	基因组学(146)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	6,332	28,686	40
蛋白质	6,300	28,546	40

功能注释

一般类别	流程_IC
详细类别	细胞周期，细胞凋亡

文档：SCOP结构域超家族的功能注释

疾病本体论

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体论	器官系统癌	0.1633	信息最少	继承
疾病本体论	神经系统疾病	0.6498	信息最少	继承
疾病本体论	良性肿瘤	0.00000002116	信息量适中	直接
疾病本体论	下呼吸道疾病	0.00007406	信息量适中	直接
疾病本体论	感觉系统疾病	0.0126	信息量适中	继承
疾病本体论	皮肤病	0.06586	信息量适中	继承
疾病本体论	血液肿瘤	0.2149	信息量适中	继承
疾病本体论	结缔组织病	0.3505	信息量适中	继承
疾病本体论	造血系统疾病	0.4025	信息量适中	继承
疾病本体论	胃肠系统疾病	0.8014	信息量适中	继承
疾病本体论	哮喘	0.00004335	信息	直接
疾病本体论	前列腺癌	0.0001575	信息	直接
疾病本体论	髓样肿瘤	0.003336	信息	继承
疾病本体论	关节病	0.008618	信息	继承
疾病本体论	器官系统良性肿瘤	0.07643	信息	继承
疾病本体论	侵袭性系统性肥大细胞增多症	0.00008742	高度信息化	直接
疾病本体论	横纹肌肉瘤	0.0005001	高度信息化	直接
疾病本体论	胆脂瘤	0.0009469	高度信息化	直接
疾病本体论	内耳疾病	0.009663	高度信息化	继承

文档：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
表型异常（PA）	肢体异常	0.1795	信息最少	继承
表型异常（PA）	骨骼形态异常	0.9045	信息最少	继承
表型异常（PA）	脊柱异常	0.04361	信息量适中	继承
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.2068	信息量适中	继承
表型异常（PA）	关节形态异常	0.2705	信息量适中	继承
表型异常（PA）	上肢异常	0.2847	信息量适中	继承
表型异常（PA）	骨骼生理异常	0.2907	信息量适中	继承
表型异常（PA）	肢体骨形态异常	0.5413	信息量适中	继承
表型异常（PA）	下肢异常	0.8885	信息量适中	继承
表型异常（PA）	下肢骨形态异常	0.1253	信息	继承
表型异常（PA）	下肢关节异常	0.2353	信息	继承
表型异常（PA）	脊椎形态异常	0.3274	信息	继承
表型异常（PA）	手指指骨形态异常	0.9059	信息	继承
表型异常（PA）	痰异常	0.000975	高度信息化	直接
表型异常（PA）	五指指骨形态异常	0.00144	高度信息化	继承
表型异常（PA）	关节滑膜炎	0.03678	高度信息化	继承

文档：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	生长/大小/身体部位表型	0.003153	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	心血管系统表型	0.03976	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫系统表型	0.1308	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	神经系统表型	0.1682	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞表型	0.23	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	异常内稳态	0.3296	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	颅面形态异常	0.0001027	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	肾/泌尿系统形态异常	0.0001409	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	胚胎表型	0.005322	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常肌肉形态	0.01424	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常炎症反应	0.0504	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞形态异常	0.0556	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常体细胞神经系统形态	0.07694	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	消化系统形态异常	0.08801	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	听力/前庭/耳表型	0.135	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	激素水平异常	0.1795	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	心脏形态异常	0.1909	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞异常死亡	0.2296	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	生殖系统形态异常	0.2831	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	腺体形态异常	0.2908	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	眼睛形态异常	0.6718	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	骨骼形态异常	0.7431	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	男性内生殖器形态异常	0.00001563	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	头部形态异常	0.001318	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	垂体激素水平异常	0.002517	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	肢体形态异常	0.005629	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	生殖细胞形态异常	0.01106	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	骨骼发育异常	0.05458	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常胚外组织形态	0.07223	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	内脏甲状腺炎形态异常	0.07422	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	心室形态异常	0.1169	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	女性生殖腺形态异常	0.1672	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	脊椎形态异常	0.1958	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	眼前段形态异常	0.454	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	女性内生殖器形态异常	0.8402	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	卵泡刺激素水平异常	0.0000007464	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	腭裂	0.000001942	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	循环促性腺激素水平异常	0.0000159	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	下颌冠状突形态异常	0.00003715	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	异常数字形态	0.0001509	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	卵母细胞数异常	0.0002906	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	小鼻骨	0.0006105	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	尿囊缺失	0.0006589	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	椎弓形态异常	0.00074	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	自主神经系统形态异常	0.0007404	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	肾单位数减少	0.0008609	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	房室瓣形态异常	0.0009549	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	切牙形态异常	0.0009549	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	角膜形态异常	0.0067	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	异常胚胎-胚外边界形态	0.01077	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	右心室形态异常	0.01572	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	心房形态异常	0.0174	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	中耳形态异常	0.01776	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	数字发育异常	0.01957	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	肌肉重量异常	0.04686	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	心室增大	0.07931	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	背根神经节形态异常	0.08266	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	卵巢大小异常	0.09972	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	异常脑颅形态	0.2649	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	上颌骨形态异常	0.361	高度信息化	继承

文档：SCOP域的MP注释

蠕虫表型（WP）

(显示详细信息)

	WP术语	FDR（全部）	SDWP水平	注释（直接或继承）
蠕虫表型（WP）	器官系统形态变异	0.3971	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞形态变异	0.4137	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	生物环境刺激反应变异体	0.6107	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	神经系统形态变异	0.01161	信息量适中	继承
蠕虫表型（WP）	药物反应变异体	0.09493	信息量适中	继承
蠕虫表型（WP）	生殖系统发育变异	0.1789	信息量适中	继承
蠕虫表型（WP）	锚定细胞侵袭变异体	0.0000946	信息	直接
蠕虫表型（WP）	尼古丁反应变异体	0.0002034	信息	直接
蠕虫表型（WP）	突触形态变异	0.00005628	高度信息化	直接

文档：SCOP域的WP注释

苍蝇表型（FP）

(显示详细信息)

	FP术语	FDR（全部）	SDFP级别	注释（直接或继承）
苍蝇表型（FP）	昼夜节律缺陷	0.0000000002785	信息	直接

文档：SCOP域的FP注释

飞行解剖学（FA）

(显示详细信息)

	FA术语	FDR（全部）	SDFA级别	注释（直接或继承）
飞行解剖学（FA）	器官系统细分	0.05857	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	幼虫	0.1118	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	有机体细分	0.4223	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	上皮	0.1469	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	胚胎	0.2123	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	珠被区	0.7071	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	表皮特化	0.0137	信息	继承
飞行解剖学（FA）	腹段	0.01555	信息	继承
飞行解剖学（FA）	气管系统	0.04049	信息	继承
飞行解剖学（FA）	7期胚胎	0.0004041	高度信息化	直接
飞行解剖学（FA）	上皮沟	0.00147	高度信息化	继承

文档：SCOP域的FA注释

斑马鱼解剖学（ZA）

(显示详细信息)

	ZA术语	FDR（全部）	SDZA等级	注释（直接或继承）
斑马鱼解剖学（ZA）	复合器官	0.1964	信息最少	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	组织的一部分	0.3315	信息量适中	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	解剖簇	0.5422	信息量适中	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	胸膜腹膜区	0.08813	信息	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	雄性生物体	0.0003046	高度信息化	直接
斑马鱼解剖学（ZA）	雌性生物体	0.0006749	高度信息化	直接
斑马鱼解剖学（ZA）	生殖系统	0.002021	高度信息化	继承

文档：SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	胚胎	0.1355	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	组织	0.4371	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	神经系统	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	头	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	大旅行箱	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	空泡复合器官	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	胚胎结构	0.0001161	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	多组织结构	0.0001745	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	肌肉骨骼系统	0.7688	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	外胚层	0.9129	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	消化系统	1	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	内脏	1	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	解剖方向	0.000000003209	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	中胚层	0.0000009237	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	心血管系统	0.000001128	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	内胚层	0.00000115	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	脊索	0.00001113	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	解剖空间	0.00009435	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	间充质	0.0004838	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	动物半球	0.0006124	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	颅板	0.002314	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	咽区	0.003194	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	神经板	0.02754	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	骨骼系统	0.9727	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	肢	1	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	头部间质	0.00000001734	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	芽基	0.0000009796	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	轴向中胚层	0.000001236	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	退化背中胚层	0.000001244	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	头部中胚层	0.000001939	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	骨盆附件	0.000002638	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	眼周区	0.00001143	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经源性广场	0.00004408	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	循环系统	0.00007985	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经管	0.0002054	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经沟	0.0004922	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	植物半球	0.0006122	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	鳃弓	0.1601	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	边缘地带	0.894	高度信息化	继承

文档：SCOP域的XA注释

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探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有43个隐马尔可夫模型代表胱氨酸结细胞因子超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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