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InterPro注释
Serpins(血清蛋白酶抑制剂)[14705960,2690952,8417965]属于MEROPS抑制剂家族I4,家族ID。Serpins是一种主要被称为不可逆丝氨酸蛋白酶抑制剂的蛋白质,对S1、S8和C14肽酶具有活性。细胞外和细胞内都有蛇毒蛋白,除了真菌外,在所有生物体中都能找到[11116082,12411597]. 与“刚性”蛋白酶抑制剂(如Kunitz或Kazal家族的蛋白酶抑制剂)相比,蛇蛋白是亚稳蛋白(活性蛋白),它与底物相互作用,在主要构象变化时不可逆地捕获酰基中间体[11116079]; 它们最好被描述为自杀底物抑制剂。这些蛋白质的共同结构是一个多域折叠,包含一束8或9个α螺旋和一个由3个β片组成的β三明治。反应中心环(RCL)位于这些蛋白质的C末端。
Serpins及其同系物是一组高分子量(40至50kDa)结构相关的蛋白质,参与许多基本生物过程,如凝血、补体激活、纤溶、血管生成、炎症、肿瘤抑制和激素转运。所有已知的蛇蛋白被分为16个分支和10个孤儿序列;脊椎动物蛇可以方便地分为六个亚类[11116082]. 在人类血浆中,它们约占总蛋白的2%,其中70%是α-1-抗胰蛋白酶。基于强烈的序列相似性已知的抑制活性也属于该家族,包括:血管紧张素原、皮质类固醇结合球蛋白和甲状腺素结合球蛋白[12824063].
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浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。
序列对齐38款单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列的相同性小于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。
浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质包括Serpins域的不同域组合。
检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。
探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。
有38个隐马尔可夫模型代表Serpins超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。
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