超级家族2可访问supfam.org。拜托联系我们如果你遇到任何问题。
主页>SCOP层次结构>L类domain超家族
酶委员会(EC)
疾病本体论
人类表型(HP)
小鼠表型(MP)
蠕虫表型(WP)
酵母表型(YP)
飞行解剖学(FA)
斑马鱼解剖学(ZA)
爪蟾解剖学(XA)
拟南芥植物本体(AP)
跳转到[页面顶部·SCOP分类·功能注释·酶委员会(EC)·疾病本体论·人类表型(HP)·小鼠表型(MP)·蠕虫表型(WP)·酵母表型(YP)·飞行解剖学(FA)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)·拟南芥植物本体(AP)·酶委员会(EC)]
浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于在超家族水平上将SCOP结构域分配给所有基因组。
序列对齐50种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。
浏览和查看基因组中具有不同的域组合,包括L类域。
检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。
探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。
有50个隐马尔可夫模型代表L域类超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。
跳转到[页面顶部·SCOP分类·功能注释·酶委员会(EC)·疾病本体论·人类表型(HP)·小鼠表型(MP)·蠕虫表型(WP)·酵母表型(YP)·飞行解剖学(FA)·斑马鱼解剖学(ZA)·爪蟾解剖学(XA)·拟南芥植物本体(AP)·酶委员会(EC)·内部数据库链接]