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胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶超家族

SCOP分类
根目录: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: 所有β蛋白[ 48724] (174)
折叠: 胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶[ 50493]
超级家族:   胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶[ 50494] (4)
家庭: 原核蛋白酶[ 50495](15)
  真核蛋白酶[ 50514](47)
  病毒蛋白酶[50596个] (4)
  胰蛋白酶折叠的病毒半胱氨酸蛋白酶[ 50603] (3)


超级家庭统计
基因组学(3,102) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
36,499 247,001 291
蛋白质 34,150 234,619 291


功能注释
一般类别 流程_IC
详细类别 蛋白酵素

文件:
SCOP结构域超家族的功能注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEO水平注释(直接或继承)
酶委员会(EC)核苷酸转移酶0信息最少直接
酶委员会(EC)作用于肽键(肽水解酶)0信息最少直接
酶委员会(EC)作用于酸酐0.2689信息最少继承
酶委员会(EC)转移单碳基团1信息最少继承
酶委员会(EC)在含磷酸酐中0信息量适中直接
酶委员会(EC)丝氨酸内肽酶0信息量适中直接
酶委员会(EC)半胱氨酸内肽酶0信息量适中直接
酶委员会(EC)作用于酸酐;参与细胞an0.000000001469信息量适中直接
酶委员会(EC)ω肽酶1信息量适中继承
酶委员会(EC)甲基转移酶0.3112信息量适中继承
酶委员会(EC)mRNA(核苷2'-O-)-甲基转移酶0信息直接
酶委员会(EC)RNA定向RNA聚合酶0信息直接
酶委员会(EC)mRNA(鸟嘌呤-N(7)-)-甲基转移酶0信息直接
酶委员会(EC)核苷三磷酸酶0信息直接
酶委员会(EC)弗拉维林0.000000000001561信息直接
酶委员会(EC)SARS冠状病毒主要蛋白酶0.0000000476信息直接
酶委员会(EC)小核糖核酸3C零点零零零零零零零零零零零零零一一零一高度信息化直接
酶委员会(EC)赫帕西韦林0.000000000468高度信息化直接
酶委员会(EC)多卡维林0.000000008498高度信息化直接
酶委员会(EC)小核糖核酸2A0.00000001621高度信息化直接
酶委员会(EC)核内含物-内肽酶0.0000000476高度信息化直接
酶委员会(EC)凝血因子Xa0.0000008542高度信息化直接
酶委员会(EC)卡利西韦林0.00002318高度信息化直接
酶委员会(EC)辅助成分蛋白酶0.0000507高度信息化直接
酶委员会(EC)凝血因子IXa0.00008367高度信息化直接
酶委员会(EC)血浆蛋白0.0001015高度信息化直接
酶委员会(EC)蛋白质C(活化)0.0001485高度信息化直接
酶委员会(EC)T型纤溶酶原激活剂0.0002633高度信息化直接

文件:SCOP域的EC注释

疾病本体(DO)

(显示详细信息)
DO术语FDR(全部)SDDO级别注释(直接或继承)
疾病本体(DO)造血系统疾病0.000139信息量适中直接
疾病本体(DO)皮肤病0.00697信息量适中继承
疾病本体(DO)遗传性凝血病0.0009167信息直接

文件:SCOP域的DO注释

人类表型(HP)

(显示详细信息)
HP术语FDR(全部)SDHP水平注释(直接或继承)
表型异常(PA)心血管系统异常0.1699信息最少继承
表型异常(PA)代谢/体内平衡异常0.3545信息最少继承
表型异常(PA)泌尿生殖系统异常0.6044信息最少继承
表型异常(PA)头部异常0.9696信息最少继承
表型异常(PA)肌肉组织异常1信息最少继承
表型异常(PA)骨骼形态异常1信息最少继承
表型异常(PA)血液和造血组织异常0.0000004419信息量适中直接
表型异常(PA)泌尿系统生理异常0.1423信息量适中继承
表型异常(PA)内分泌系统异常0.1839信息量适中继承
表型异常(PA)上尿路异常0.2188信息量适中继承
表型异常(PA)心血管系统生理异常0.2193信息量适中继承
表型异常(PA)免疫系统生理异常0.3812信息量适中继承
表型异常(PA)关节形态异常0.4965信息量适中继承
表型异常(PA)生殖系统形态异常0.6506信息量适中继承
表型异常(PA)口腔形态异常1信息量适中继承
表型异常(PA)骨骼肌形态异常1信息量适中继承
表型异常(PA)补体系统异常0.0001978信息直接
表型异常(PA)血液循环异常0.01288信息继承
表型异常(PA)口腔粘膜形态异常0.01554信息继承
表型异常(PA)肾脏生理异常0.02521信息继承
表型异常(PA)月经周期异常0.1166信息继承
表型异常(PA)混凝级联异常0.1637信息继承
表型异常(PA)异常出血0.2982信息继承
表型异常(PA)牙列异常0.5692信息继承
表型异常(PA)鼻子异常0.7463信息继承
表型异常(PA)关节出血0.000000006776高度信息化直接
表型异常(PA)凝血酶原时间延长0.00002086高度信息化直接
表型异常(PA)肌肉内血肿0.00002422高度信息化直接
表型异常(PA)自身免疫性0.00002759高度信息化直接
表型异常(PA)尿量减少0.0001184高度信息化直接
表型异常(PA)鼻出血0.0004014高度信息化直接
表型异常(PA)牙龈异常0.002202高度信息化继承
表型异常(PA)糖尿病0.6134高度信息化继承
表型异常(PA)溶血性贫血1高度信息化继承

文件:SCOP域的HP注释

小鼠表型(MP)

(显示详细信息)
MP术语FDR(全部)SDMP级别注释(直接或继承)
哺乳动物表型(MP)免疫系统表型0.05825信息最少继承
哺乳动物表型(MP)心血管系统表型0.3805信息最少继承
哺乳动物表型(MP)异常内稳态0.9928信息最少继承
哺乳动物表型(MP)肝脏/胆道系统表型0.3806信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)心血管系统生理异常0.5115信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)血管形态异常0.7562信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)呼吸系统表型0.8436信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)眼睛形态异常0.9942信息量适中继承
哺乳动物表型(MP)异常凝血0.0000405信息直接
哺乳动物表型(MP)葡萄膜形态异常0.01707信息继承
哺乳动物表型(MP)血管生理异常0.4893信息继承
哺乳动物表型(MP)异常体液免疫反应0.9443信息继承
哺乳动物表型(MP)诱导脉络膜新生血管敏感性降低0.0001014高度信息化直接
哺乳动物表型(MP)异常补体途径0.0003981高度信息化直接

文件:SCOP域的MP注释

蠕虫表型(WP)

(显示详细信息)
WP术语FDR(全部)SDWP水平注释(直接或继承)
蠕虫表型(WP)细胞周成分发育变异0.000000001647信息量适中直接
蠕虫表型(WP)基底膜重塑变异体0.0000000001914信息直接

文件:SCOP域的WP注释

斑马鱼解剖学(ZA)

(显示详细信息) 文件:SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息)
XA术语FDR(全部)SDXA级别注释(直接或继承)
爪蟾非原子实体(XAN)大旅行箱0.6323信息最少继承
爪蟾非原子实体(XAN)内脏0.04481信息量适中继承
爪蟾非原子实体(XAN)消化系统0.05627信息量适中继承
爪蟾非原子实体(XAN)胰腺0.0001161高度信息化直接

文件:SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息) 文件:SCOP域的AP注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEC级注释(直接或继承)
酶委员会(EC)转移含磷基团0信息最少直接
酶委员会(EC)水解酶类0信息最少直接
酶委员会(EC)核苷酸转移酶0信息量适中直接
酶委员会(EC)作用于肽键(肽酶)0信息量适中直接
酶委员会(EC)作用于酸酐零点零零零零零零零零零零零零零二八零六信息量适中直接
酶委员会(EC)转移单碳基团0.6723信息量适中继承
酶委员会(EC)RNA定向RNA聚合酶0信息直接
酶委员会(EC)丝氨酸内肽酶0信息直接
酶委员会(EC)半胱氨酸内肽酶0信息直接
酶委员会(EC)在含磷酸酐中0信息直接
酶委员会(EC)RNA解旋酶0信息直接
酶委员会(EC)ω肽酶1信息继承
酶委员会(EC)信使核糖核酸(鸟嘌呤-N(7)-)-甲基转移酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)甲基转移酶cap10高度信息化直接
酶委员会(EC)弗拉维林0高度信息化直接
酶委员会(EC)核苷三磷酸磷酸酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)小核糖核酸3C零点零零零零零零零零零零零零零零五零一高度信息化直接
酶委员会(EC)SARS冠状病毒主要蛋白酶0.0000003303高度信息化直接

文件:SCOP域的EC注释

InterPro注释
交叉引用 IPR009003型 SSF50494型 蛋白质匹配
摘要

该特征识别大量丝氨酸和半胱氨酸肽酶(包括原核、真核和病毒),它们共享一个共同的封闭β-桶结构。


InterPro数据库


关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息
交叉引用 PDB条目
配体结合统计
核酸结合统计
二级结构元素的出现
小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于超家族水平上所有基因组的外SCOP域分配。


序列对齐181种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列的相同性小于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看具有以下特征的基因组中的蛋白质不同的结构域组合包括胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶结构域。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。

有181个隐马尔可夫模型代表胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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