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p53类转录因子超家族

根：	SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别：	所有β蛋白[ 48724] (174)
折叠：	白喉毒素/转录因子/细胞色素f的常见折叠[49379人] (10)
超级家族:	p53类转录因子[ 49417] (7)
家庭：	p53 DNA结合域样[ 81314] (2)
	Rel/Dorsal转录因子，DNA-结合域[ 81315] (6)
	T形盒[ 81316] (2)
	STAT DNA-结合域[ 81317] (3)
	RUNT域[ 81318]
	NDT80的DNA结合域[ 81992]
	DNA结合蛋白LAG-1（CSL）[ 110080]

超级家庭统计

	基因组学(367)	Uniprot 2018_03基因组	PDB链（SCOP1.75)
域	6,320	19,251	53
蛋白质	6,210	18948年	53

功能注释

一般类别	法规
详细类别	DNA绑定

文档：SCOP结构域超家族的功能注释

疾病本体论

(显示详细信息)

	DO术语	FDR（全部）	SDDO级别	注释（直接或继承）
疾病本体论	器官系统癌	0.1041	信息最少	继承
疾病本体论	血液肿瘤	0.001442	信息量适中	继承
疾病本体论	传染源性疾病	0.004839	信息量适中	继承
疾病本体论	胃肠系统疾病	0.01041	信息量适中	继承
疾病本体论	良性肿瘤	0.0246	信息量适中	继承
疾病本体论	头颈部癌	0.0000002789	信息	直接
疾病本体论	炎症性肠病	0.000002655	信息	直接
疾病本体论	结缔组织癌	0.00009375	信息	直接
疾病本体论	身体紊乱	0.001156	信息	继承
疾病本体论	淋巴瘤	0.007302	信息	继承
疾病本体论	乳腺癌	0.008714	信息	继承
疾病本体论	细胞型良性肿瘤	0.01092	信息	继承
疾病本体论	呼吸系统癌	0.1016	信息	继承
疾病本体论	病毒性传染病	0.2672	信息	继承
疾病本体论	结肠炎	0.000000088	高度信息化	直接
疾病本体论	伯基特淋巴瘤	0.00002723	高度信息化	直接
疾病本体论	流行性腮腺炎	0.00006612	高度信息化	直接
疾病本体论	巴雷特食管	0.00007312	高度信息化	直接
疾病本体论	胃炎	0.0002504	高度信息化	直接
疾病本体论	慢性白血病	0.0004027	高度信息化	直接
疾病本体论	百日咳	0.0004157	高度信息化	直接
疾病本体论	进行性多灶性白质脑病	0.000514	高度信息化	直接
疾病本体论	喉癌	0.0005401	高度信息化	直接
疾病本体论	血管瘤	0.0005585	高度信息化	直接
疾病本体论	涎腺腺样囊性癌	0.0007397	高度信息化	直接
疾病本体论	大肠癌	0.007613	高度信息化	继承

文档：SCOP域的DO注释

人类表型（HP）

(显示详细信息)

	HP术语	FDR（全部）	SDHP水平	注释（直接或继承）
表型异常（PA）	神经系统形态异常	0.15	信息最少	继承
表型异常（PA）	心血管系统异常	0.159	信息最少	继承
表型异常（PA）	骨骼形态异常	0.6078	信息最少	继承
表型异常（PA）	肢体异常	0.7513	信息最少	继承
表型异常（PA）	呼吸系统异常	0.0001419	信息量适中	直接
表型异常（PA）	心血管系统形态异常	0.01523	信息量适中	继承
表型异常（PA）	内分泌系统异常	0.1936	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血液和造血组织异常	0.2245	信息量适中	继承
表型异常（PA）	血管系统异常	0.2261	信息量适中	继承
表型异常（PA）	肢体骨形态异常	0.2971	信息量适中	继承
表型异常（PA）	上肢异常	0.4031	信息量适中	继承
表型异常（PA）	垂体前叶异常	0.002433	信息	继承
表型异常（PA）	白细胞形态异常	0.01451	信息	继承
表型异常（PA）	四肢发育不全/发育不全	0.05465	信息	继承
表型异常（PA）	胸部异常	0.2836	信息	继承
表型异常（PA）	前部垂体功能减退	0.0006479	高度信息化	直接
表型异常（PA）	白细胞减少症	0.0007182	高度信息化	直接
表型异常（PA）	胸部骨骼发育不全/发育不全	0.02197	高度信息化	继承
表型异常（PA）	手骨发育不全	0.2284	高度信息化	继承

文档：SCOP域的HP注释

小鼠表型（MP）

(显示详细信息)

	MP术语	FDR（全部）	SDMP级别	注释（直接或继承）
哺乳动物表型（MP）	生长/大小/身体部位表型	0.000001613	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	死亡率/老龄化	0.000002072	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	细胞表型	0.0001991	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	心血管系统表型	0.0003387	信息最少	直接
哺乳动物表型（MP）	造血系统表型	0.006084	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫系统表型	0.00757	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	神经系统表型	0.027	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	异常内稳态	0.1983	信息最少	继承
哺乳动物表型（MP）	血细胞形态/发育异常	0.000000009842	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	白细胞生理异常	0.0000004954	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	骨骼形态异常	0.0000008399	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	表皮表型	0.00000123	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	胚胎表型	0.000001871	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	呼吸系统表型	0.000005384	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	腺体形态异常	0.000009362	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	颅面形态异常	0.000009631	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	异常单核细胞形态	0.00002864	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	血细胞形态异常	0.00008684	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	肝脏/胆道系统表型	0.0008506	信息量适中	直接
哺乳动物表型（MP）	异常炎症反应	0.001434	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫血清蛋白生理异常	0.003571	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	细胞异常死亡	0.005867	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	心血管系统生理异常	0.01525	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	免疫系统器官形态异常	0.01999	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	造血细胞数异常	0.03041	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	肿瘤	0.03167	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	血管形态异常	0.03407	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常髓细胞形态	0.0484	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	心脏形态异常	0.0545	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	胎儿生长至断奶期间的致死率	0.0582	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	产前致死率	0.08255	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	消化系统形态异常	0.1005	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	蛋白质水平异常	0.1339	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常的专业抗原呈递细胞生理学	0.4805	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	激素水平异常	0.7243	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	异常行为	1	信息量适中	继承
哺乳动物表型（MP）	白细胞介素水平异常	0.00000001067	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	感染敏感性增加	0.0000003063	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	肝脏生理异常	0.000003189	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	胸腺形态异常	0.00001343	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	异常涂层外观	0.00002017	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	T细胞分化异常	0.00002985	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	流体调节异常	0.00004723	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	正常表型	0.00006634	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	异常B细胞增殖	0.0001193	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	出血	0.0001351	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	肿瘤病理改变	0.0003112	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	白细胞数量增加	0.0004405	信息	直接
哺乳动物表型（MP）	软骨形态异常	0.002027	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常体液免疫反应	0.003854	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常适应性产热	0.004057	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	脊髓形态异常	0.008815	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	表皮层形态异常	0.01021	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	循环细胞因子水平异常	0.01213	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常腺体生理	0.02284	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	B淋巴细胞抗原呈递异常	0.02882	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	淋巴结形态异常	0.04135	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	头部形态异常	0.04153	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	干扰素水平异常	0.07086	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	乳腺形态异常	0.07522	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	阑尾骨骼形态异常	0.07944	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	胸腔形态异常	0.241	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常自然杀伤细胞介导的细胞毒性	0.2425	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	胃形态异常	0.3273	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	溶血磷脂系统肿瘤发病率增加	0.3512	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	癌症发病率增加	0.3811	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常自愿运动	0.4831	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	红系细胞形态异常	0.5382	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	脊椎形态异常	0.6989	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	异常派耶斑块形态	0.8938	信息	继承
哺乳动物表型（MP）	B细胞增殖减少	0.000006213	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	乳腺上皮生理异常	0.000009099	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	呼吸系统炎症	0.000009657	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	贯穿胎儿生长发育的致命性，完全外显率	0.00002637	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	异常的继发腭发育	0.00006071	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	椎间盘形态异常	0.0001097	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	树突状细胞数量减少	0.00012	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	适应性产热受损	0.0001287	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	颈椎寰椎形态异常	0.0001553	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	胃上皮形态异常	0.0001704	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	腭裂	0.0002123	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	表面II类分子水平异常	0.0002749	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	胸腺髓质形态异常	0.0003089	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	心脏发育异常	0.0003219	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	循环胰岛素样生长因子I水平异常	0.0005441	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	腺癌发病率增加	0.0006211	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	粒细胞数异常	0.0006533	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	乳腺小泡形态异常	0.0008596	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	椎弓形态异常	0.0008597	高度信息化	直接
哺乳动物表型（MP）	脊髓白质形态异常	0.008997	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	IgG2a水平异常	0.01023	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	头部异常运动	0.01327	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	白血病发病率增加	0.01366	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	异常骨髓细胞形态/发育	0.01868	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	器官发生过程中的胚胎致死	0.0599	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	派尔斑大小异常	0.1245	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	外周淋巴结形态异常	0.1485	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	棘层表皮形态异常	0.2192	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	异常脑颅形态	0.2649	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	IgG水平增加	0.356	高度信息化	继承
哺乳动物表型（MP）	胸骨形态异常	0.8426	高度信息化	继承

文档：SCOP域的MP注释

蠕虫表型（WP）

(显示详细信息)

	WP术语	FDR（全部）	SDWP水平	注释（直接或继承）
蠕虫表型（WP）	器官系统形态变异	0.02242	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞发育变异体	0.04947	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	生物代谢过程变体	0.08677	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞生理变异	0.131	信息最少	继承
蠕虫表型（WP）	细胞分裂变体	0.08251	信息量适中	继承
蠕虫表型（WP）	转基因表达变体的模式	1	信息量适中	继承
蠕虫表型（WP）	发育形态变异	0.0006114	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	基因表达水平降低	0.0007862	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	消化系统形态变异	0.0008484	高度信息化	直接
蠕虫表型（WP）	异位表达转基因	0.0008928	高度信息化	直接

文档：SCOP域的WP注释

苍蝇表型（FP）

(显示详细信息)

	FP术语	FDR（全部）	SDFP级别	注释（直接或继承）
苍蝇表型（FP）	尺寸有缺陷	0.0007515	信息	直接

文档：SCOP域的FP注释

飞行解剖学（FA）

(显示详细信息)

	FA术语	FDR（全部）	SDFA级别	注释（直接或继承）
飞行解剖学（FA）	有机体细分	0.004231	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	器官系统细分	0.008166	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	成人	0.008401	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	细胞	0.0168	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	幼虫	0.0387	信息最少	继承
飞行解剖学（FA）	成人节段	0.005454	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	成人表皮系统	0.007744	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	胸部	0.008551	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	珠被区	0.01294	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	感觉系统	0.01757	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	成人标记	0.06063	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	胚胎	0.09529	信息量适中	继承
飞行解剖学（FA）	机械传感系统	0.000251	信息	直接
飞行解剖学（FA）	胚胎/幼虫循环系统	0.0003048	信息	直接
飞行解剖学（FA）	查埃塔	0.001088	信息	继承
飞行解剖学（FA）	解剖空间	0.001861	信息	继承
飞行解剖学（FA）	机械感查埃塔	0.00004374	高度信息化	直接
飞行解剖学（FA）	头部中胚层来源的胚胎血细胞	0.0001682	高度信息化	直接
飞行解剖学（FA）	胸中间皮	0.0003916	高度信息化	直接

文档：SCOP域的FA注释

斑马鱼解剖学（ZA）

(显示详细信息)

	ZA术语	FDR（全部）	SDZA等级	注释（直接或继承）
斑马鱼解剖学（ZA）	细胞	0.06261	信息最少	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	心血管系统	0.01495	信息量适中	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	组织的一部分	0.054	信息量适中	继承
斑马鱼解剖学（ZA）	初级胚层	0.0002565	信息	直接

文档：SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学（XA）

(显示详细信息)

	XA术语	FDR（全部）	SDXA级别	注释（直接或继承）
爪蟾非原子实体（XAN）	组织	0.1348	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	胚胎	0.2751	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	头	0.4019	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	神经系统	0.6581	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	空泡复合器官	0.7455	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	大旅行箱	1	信息最少	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	多组织结构	0.0001289	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	感觉系统	0.000166	信息量适中	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	胚胎结构	0.003643	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	肌肉骨骼系统	0.03414	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	内脏	0.7418	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	外胚层	0.7579	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	消化系统	0.7688	信息量适中	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	间充质	0.0000009581	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	咽区	0.000008425	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	解剖方向	0.00001873	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经板	0.00004513	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	颅板	0.0002353	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	中胚层	0.0003196	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	脊索	0.000403	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	心血管系统	0.0005322	信息	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	周围神经系统	0.005021	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	骨骼系统	0.02864	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	表面结构	0.06342	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	结缔组织	0.6003	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	肢	0.6248	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	固体复合器官	0.808	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	肌肉	0.952	信息	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	神经源性广场	0.00001116	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	肢芽	0.00002138	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	前肠	0.0003687	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	芽基	0.000456	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	神经元	0.0008531	高度信息化	直接
爪蟾非原子实体（XAN）	头盖骨	0.001372	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	味觉系统	0.02536	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	鳃弓	0.2188	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	骨盆附件	0.9841	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	边缘地带	1	高度信息化	继承
爪蟾非原子实体（XAN）	颅神经	1	高度信息化	继承
爪蟾发育阶段（XDE）	胚胎后阶段	0.7782	信息最少	继承
爪蟾发育阶段（XDE）	变形前阶段	0.01454	高度信息化	继承

文档：SCOP域的XA注释

InterPro注释

交叉引用 IPR008967型 SSF49417型蛋白质匹配

摘要
该结构域存在于许多转录因子中，包括p53、NFATC、TonEBP、STAT-1和NFkappaB，在这些转录因子中负责DNA结合。这些转录因子在细胞功能的调节中发挥着不同的作用：p53肿瘤抑制剂上调参与细胞周期阻滞和凋亡的基因表达[12826037]; NFATC调节参与协调免疫反应的效应蛋白的产生[8990122]; TonEBP调节渗透胁迫诱导的基因表达并帮助调节细胞生长过程中的细胞内容量[12729611]; STAT-1在B淋巴细胞生长和功能中起重要作用[12855573]; NFkappaB参与炎症反应[12421671]. DNA-结合域作用于钳制DNA靶点，或者在TonEBP的情况下，围绕DNA靶点以稳定蛋白-DNA复合体[11780147]. 蛋白质相互作用也可能有助于稳定蛋白质-DNA复合物，例如在STAT-1二聚体中，每个单体中的SH2（Src同源性2）结构域与DNA结合结构域偶联以增加稳定性[9630226]. DNA结合结构域由具有希腊键拓扑结构的2片9链形成的β三明治组成。这种结构存在于许多转录因子中，通常位于DNA结合域内。

InterPro数据库

关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息

交叉引用	PDB条目配体结合统计核酸结合统计二级结构元素的出现小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于在超家族水平上将SCOP结构域分配给所有基因组。

序列对齐26种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示，但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列，或者粘贴或上传您自己的序列。

浏览和查看基因组中具有不同的结构域组合包括p53类转录因子结构域。

检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象，即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。

探索域发生网络，其中节点表示基因组，边缘是包含感兴趣超家族的域架构（基因组之间共享）。

有26个隐马尔可夫模型代表p53类转录因子超家族。关于如何构建模型的信息，以及显示疏水性,匹配发射概率和插入/删除概率可以检查。

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