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GST C末端类域超家族

SCOP分类
根: SUPERFAMILY中的SCOP层次结构[ 0] (11)
类别: 所有α蛋白[ 46456] (284)
折叠: GST C-末端结构域样[ 47615]
超级家族:   GST C-末端结构域样[ 47616] (2)
家庭: 谷胱甘肽S-转移酶(GST),C末端结构域[ 47617] (18)
  Arc1p N端类域[ 158491]


超级家庭统计
基因组学(1,855) Uniprot 2018_03基因组 PDB链(SCOP1.75)
28520个 150,484 104
蛋白质 28,241 149,697 104


功能注释
一般类别 概述
详细类别 小分子结合

文件:
SCOP结构域超家族的功能注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEO水平注释(直接或继承)
酶委员会(EC)异构酶类0.6406信息最少继承
酶委员会(EC)裂解酶1信息最少继承
酶委员会(EC)氧化还原酶类1信息最少继承
酶委员会(EC)作用于硫供体组0.00000003662信息量适中直接
酶委员会(EC)分子内氧化还原酶0.3581信息量适中继承
酶委员会(EC)转移甲基以外的烷基或芳基1信息量适中继承
酶委员会(EC)谷胱甘肽转移酶0高度信息化直接
酶委员会(EC)其他分子内氧化还原酶0.000000000000002558高度信息化直接

文件:SCOP域的EC注释

疾病本体论

(显示详细信息)
DO术语FDR(全部)SDDO级别注释(直接或继承)
疾病本体论造血系统疾病0.08835信息量适中继承
疾病本体论胃肠系统疾病0.4683信息量适中继承
疾病本体论先天性溶血性贫血0.000007168高度信息化直接
疾病本体论巴雷特食管0.0009754高度信息化直接

文件:SCOP域的DO注释

人类表型(HP)

(显示详细信息)
HP术语FDR(全部)SDHP水平注释(直接或继承)
表型异常(PA)骨骼形态异常0.08811信息最少继承
表型异常(PA)神经系统生理异常0.2033信息最少继承
表型异常(PA)运动异常0.016信息量适中继承
表型异常(PA)神经发育异常0.04934信息量适中继承
表型异常(PA)高级心理功能异常0.2835信息量适中继承
表型异常(PA)脊柱异常0.4315信息量适中继承
表型异常(PA)步态障碍0.0003298信息直接
表型异常(PA)脊柱侧凸0.1113信息继承
表型异常(PA)智力残疾0.4537信息继承
表型异常(PA)脊柱后凸0.01316高度信息化继承

文件:SCOP域的HP注释

蠕虫表型(WP)

(显示详细信息)
WP术语FDR(全部)SDWP水平注释(直接或继承)
蠕虫表型(WP)生物环境刺激反应变异体0.000004257信息最少直接
蠕虫表型(WP)生物代谢过程变体0.0342信息最少继承
蠕虫表型(WP)生物体应激反应变异体0.00002064信息量适中直接
蠕虫表型(WP)身体区域形态变异1信息量适中继承
蠕虫表型(WP)金属响应变量0.0003043信息直接
蠕虫表型(WP)化学过敏0.004332信息继承
蠕虫表型(WP)细胞周成分形态变异0.01342信息继承
蠕虫表型(WP)生物体温度响应变异体0.8773信息继承
蠕虫表型(WP)酶活性降低0高度信息化直接
蠕虫表型(WP)镉过敏0.00009609高度信息化直接
蠕虫表型(WP)生物体热反应变异体0.003591高度信息化继承

文件:SCOP域的WP注释

酵母表型(YP)

(显示详细信息) 文件:SCOP域的YP注释

斑马鱼解剖学(ZA)

(显示详细信息) 文件:SCOP域的ZA注释

爪蟾解剖学(XA)

(显示详细信息)
XA术语FDR(全部)SDXA级别注释(直接或继承)
爪蟾非原子实体(XAN)皮肤系统0.0002425信息直接

文件:SCOP域的XA注释

拟南芥植物本体(AP)

(显示详细信息)
AP术语FDR(全部)SDAP级别注释(直接或继承)
植物非原子实体(PAN)整个工厂1信息最少继承
植物非原子实体(PAN)血管组织的一部分0.0004909信息直接
植物非原子实体(PAN)韧皮部0.0003047高度信息化直接
工厂结构开发阶段(PDE)种子发育阶段0.0005655信息直接

文件:SCOP域的AP注释

酶委员会(EC)

(显示详细信息)
EC术语FDR(全部)SDEC级注释(直接或继承)
酶委员会(EC)氧化还原酶类1信息最少继承
酶委员会(EC)裂解酶1信息最少继承
酶委员会(EC)异构酶类0.4758信息量适中继承
酶委员会(EC)连接酶类1信息量适中继承
酶委员会(EC)作用于硫供体组0.000000000000001017信息直接
酶委员会(EC)分子内氧化还原酶0.2333信息继承
酶委员会(EC)形成碳氧键0.847信息继承
酶委员会(EC)转移烷基或芳基,甲基除外1信息继承
酶委员会(EC)其他分子内氧化还原酶0高度信息化直接

文件:SCOP域的EC注释

UniProtKB关键字(KW)

(显示详细信息)
KW术语FDR(全部)SDKW电平注释(直接或继承)
翻译后修改转移酶5.551e-16号机组信息量适中直接
翻译后修改眼睛晶状体蛋白0信息直接

文件:SCOP域的KW注释

InterPro注释
交叉引用 知识产权010987 SSF47616不锈钢 蛋白质匹配
摘要

在真核生物中,谷胱甘肽S-转移酶(GSTs)通过催化反应性亲电化合物与谷胱甘苷的结合来参与其解毒。GST是鱿鱼S-crystallins中的一个结构域,以及不具有已知GST活性的蛋白质,例如真核延长因子1-gamma和应激相关蛋白的HSP26家族,其中包括植物中的生长素调节蛋白和大肠杆菌中的严格饥饿蛋白。头足类的主要晶状体多肽也是GST[公共医学9074797]. 已知功能的细菌GST通常在生物降解代谢中具有特定的生长支持作用:环氧化物开环和四氯氢醌还原脱卤是这些细菌GST催化的反应的两个例子。一些调节蛋白,如严格饥饿蛋白,也属于GST家族[公共医学9045797]. 古生菌似乎不存在GST,其中γ-谷氨酰半胱氨酸取代谷胱甘肽作为主要硫醇。

谷胱甘肽S-转移酶形成同型二聚体,但在真核生物中也可以形成A1和A2或YC1和YC2亚单位的异二聚体。同二聚体酶显示出保守的结构折叠。每个单体由一个不同的N端亚结构域和一个C端全螺旋亚结构域组成,前者采用硫氧还蛋白折叠,后者采用4螺旋束折叠。此条目是C终端域。

谷胱甘肽还蛋白2(Grx2)是谷胱甘肽依赖性二硫化物氧化还原酶,在结构上与谷胱甘肽还蛋白类似,尽管它们缺乏任何序列相似性。Grx2也由N和C端子域组成。据认为,Grx2的主要功能是催化蛋白质与谷胱甘肽在细胞氧化还原调节(包括对氧化应激的反应)中的可逆谷胱甘苷酰化。Grx2与其他谷胱甘肽不同,除了含有保守的活性位点残基[公共医学14713336].


InterPro数据库


关于配体、序列和结构基序的PDBeMotif信息
交叉引用 PDB条目
配体结合统计
核酸结合统计
二级结构元素的出现
小型三维结构图案的出现

PDBeMotif资源

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内部数据库链接

浏览此超家族的基因组分配。SUPERFAMILY隐马尔可夫模型库用于在超家族水平上将SCOP结构域分配给所有基因组。


序列对齐146种型号单击上面的“Alignments”图标即可访问此超级系列中的。PDB序列一致性低于40%默认情况下显示,但可以对齐任何其他序列。选择PDB序列、基因组序列,或者粘贴或上传您自己的序列。


浏览和查看基因组中具有包括GST C末端类域的不同域组合。


检查域超家族或家族在主要分类王国或王国内基因组中的分布。这给人一个直接的印象,即超级家族是如何被限制在某些生命王国中的。


探索域发生网络,其中节点表示基因组,边缘是包含感兴趣超家族的域架构(基因组之间共享)。

有146个隐马尔可夫模型代表GST C末端类域超家族。关于如何构建模型的信息,以及显示疏水性,匹配发射概率插入/删除概率可以检查。


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