|
疾病本体(DO):解剖实体疾病(显示信息)
表型本体与基因本体论(GO)一样,表型本体论通过将单个术语视为节点及其与父项(允许多个父项)的关系视为有向边,将基因突变/空表型信息从顶部非常一般的术语分类并组织到有向无环图(DAG)中更具体的术语。要导航此层次结构,我们显示所有亲本表型项按与当前项的最短距离排序的当前感兴趣的表型项。也,仅直接儿童表型术语列出了当前表型术语的。我们纳入的表型本体如下:
- 疾病本体(DO)DO通过DO术语到MeSH、ICD、NCI同义词库、SNOMED和OMIM的广泛交叉映射,在语义上整合了疾病和医学词汇。
- 人类表型(HP)本体(HP)HP捕获OMIM中描述的表型异常以及相应的致病基因。它包括三个互补的生物学概念:遗传模式(MI)、ONset_and_clinical_curse(ON)和表型异常(PA)。
- 小鼠表型(MP)本体(MP)MP描述了特定基因被遗传破坏后小鼠的表型。利用它,小鼠基因组信息学(MGI)为小鼠提供了高覆盖率的基因水平表型。
- 蠕虫表型本体WP对秀丽隐杆线虫和其他线虫的表型描述进行分类和组织。使用它,WormBase为秀丽线虫的表型注释提供了主要资源。
- 酵母表型本体酵母基因组数据库(SGD)基于YP,YP是子囊菌表型本体的主要贡献者,为酵母基因组中的每个基因提供单一突变表型。
- 苍蝇表型本体FP指FlyBase控制的词汇表。具体来说,FlyBase中的等位基因注释(针对其诱变剂等)使用结构化受控词汇。
- 蝇类解剖本体FA是黑腹果蝇解剖结构的结构化受控词汇,用于描述表型和基因表达的位置。
- 斑马鱼解剖学本体ZA使用标准解剖学术语和受影响的基因显示斑马鱼的解剖学术语。
- 爪蟾解剖学本体XA代表青蛙(非洲爪蟾和热带爪蟾)的组织谱系和发育时间。它用于注释爪蟾基因表达模式以及突变和变体表型。
- 拟南芥植物本体(AP)作为描述植物解剖和形态结构(AN)以及生长发育阶段(DE)的植物本体的主要贡献者,拟南芥信息资源(TAIR)为模式高等植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)提供了拟南芥子植物本体注释。
- 酶委员会(EC)本体(EC)每个酶都有一个四位数的EC编号,前三位数定义了催化的反应,第四位数是唯一的标识符(序列号)。每种酶都有一个系统名称,唯一地定义了所催化的反应。
- DrugBank ATC(DB)本体(DB)在解剖治疗化学(ATC)分类系统中,药物根据作用的器官或系统(第一级,解剖主要组)及其治疗(第二级,治疗亚组)、药理(第三级,药理亚组)分为五个不同级别的组和化学性质(第4级,化学亚组;第5级,化学物质)。只考虑DrugBank中的药物。
- UniProtKB关键字(KW)本体UniProtKB中的关键字是受控词汇表,提供条目内容的摘要,并用于基于10个类别(此处不包括“技术术语”类别)索引UniProtKB/Swiss-Prot条目。每个关键字都手动归属于UniProtKB/Swiss-Prot条目,并自动归属于UniProtKB/TrEMBL条目(根据特定的注释规则)。
- UniProtKB UniPathway(UP)本体UP是一个完全手动管理的资源,用于表示和注释代谢途径,在UniProtKB中用作路径注释的受控词汇。
结构域表型本体及其注释蛋白质结构分类(SCOP)将进化相关域划分为超级家族水平和家庭级别。利用上述表型本体,我们生成了以域为中心的表型注释,并进一步确定了注释SCOP域信息最丰富的表型术语。有希望的是,以结构域为中心的表型注释可以作为探索基因型-表型关系的替代起点。我们为下载提供了几个相关文件,包括每个表型本体的注释和相应的本体。
超域表型本体及其注释虽然以域为中心的注释在描述独立域的表型性质方面有很大的希望,但大多数域本身可能不只是单独工作。在多域蛋白质中,它们可以结合在一起形成不同的域结构。现有结构域的重组被认为是表型多样性的主要驱动力之一。作为扩展,我们还生成了超域表型本体及其注释。与以域为中心的表型本体论和注释(SCOP域超级家族水平和家庭级别),此版本仅关注超域和单个SCOP域超级家族级别。此外,就单个超家族而言,以域为中心版本的注释可能与超域版本的注释不同。根据您的关注点,前者应用于考虑超级家族水平和家庭级别,否则如果您对域组合感兴趣,则应使用后者。此外,我们还为下载提供了几个相关文件,包括每个表型本体的注释和相应的本体。
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
根:DO层次结构(马里兰大学疾病本体)
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
超级家族(显示详细信息)
注释到此DO术语的超家族域(不在SDDO中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
家庭(显示详细信息)
注释到此DO术语的家族域(不在SDDO中)
以灰色突出显示的是FDR_all>0.001的那些
在系统发育树上为超级家族和/或家庭由该表型术语注释的域
|
将树绘制为:
| | 下载Newick格式树:
|
(显示帮助)
树木依据树向量
使用蛋白质域生成存在/缺失矩阵超级家族中所有基因组的结构数据。这个PAUP公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,这些数据是从单个一棵大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
跳转到[顶部·表型层次·超级家族·家庭·超域]
超域(包括单个超家族)(显示详细信息)
注释到此DO术语的超域(不在SPDO中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
(显示详细信息)
注释到此DO术语的超域(不在SPDO中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
47005,52777 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
53300,69179 5.33万-vWA类 69179 -整合素域 | 0 | 直接 |
57424,50494 57424 -LDL受体样模块 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
49265,56112 49265 -纤维连接蛋白III型 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
50729,50156 50729 -PH类域 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
57630,57196 57630 -GLA-域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
52025,53187 52025 -PA域 53187 -锌依赖性外肽酶 | 0 | 直接 |
57889,49562 57889 -富含半胱氨酸结构域 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
51230,47005 51230个-单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚基结合结构域 | 0 | 直接 |
57196,57535 57196 -EGF/层粘连蛋白 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0 | 直接 |
90188,90188 90188 -生长激素B结构域 90188 -生长激素B结构域 | 0 | 直接 |
57603,82895 57603 -类FnI域 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
52540,-7 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 -7 -CATH公司 | 0 | 直接 |
51445,51445 51445 -(反式)糖苷酶 51445 -(反式)糖苷酶 | 0 | 直接 |
49417,47719 49417 -p53类转录因子 47719 -p53四聚结构域 | 0 | 直接 |
63737,55486 63737 -白三烯A4水解酶N末端结构域 55486个-金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 | 0 | 直接 |
57196,69687 57196 -EGF/层粘连蛋白 69687 -整合素β尾结构域 | 0 | 直接 |
103647,103647 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 | 0 | 直接 |
57196,50494 57196 -EGF/层粘连蛋白 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
103647,49899 103647 -TSP类型-3重复 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
47473,57850 47473 -结构域 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
81324,81327 81324 -电压门控钾通道 81327 -小电导钾通道 | 0 | 直接 |
57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193年-陷波域 | 0 | 直接 |
49410,50242 49410 -α-巨球蛋白受体结构域 50242 -类TIMP | 0 | 直接 |
49758,47473 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
54001,49758 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) | 0 | 直接 |
57362,57362 57362 -类似BPTI 57362 -类似BPTI | 0 | 直接 |
102712,-7 102712 -JAB1/MPN域 -7 -CATH公司 | 0 | 直接 |
57184,100895 57184 -生长因子受体结构域 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
82109,100909 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
48552,48552 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 | 0 | 直接 |
53850,53850 53850 -周质结合蛋白样II 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
57184,57603 57184 -生长因子受体结构域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
49503,49503 49503 -铜氧还蛋白类 49503 -铜氧还蛋白类 | 0 | 直接 |
53187,47672 53187个-锌依赖性外肽酶 47672 -转铁蛋白受体样二聚结构域 | 0 | 直接 |
57414,57440 57414 -包含类域的发夹环 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
50494,50156 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
57924,57924 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 | 0 | 直接 |
100895,100895 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
54534,54534 54534 -类FKBP 54534 -类FKBP | 0 | 直接 |
51445,54556 51445 -(反式)糖苷酶 54556 -几丁质酶插入域 | 0 | 直接 |
90188,53649 90188 -生长激素B结构域 53649 -碱性磷酸酶样 | 0 | 直接 |
100920,100934 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 100934个-热休克蛋白70kD(HSP70),C末端亚结构域 | 0 | 直接 |
47576,48065 47576 -钙粘蛋白同源结构域 48065 -DBL同源域(DH-domain) | 0 | 直接 |
53822,53850 53822 -周质结合蛋白样I 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
52980,47781 52980 -限制性内切酶样 47781 -RuvA域2类 | 0 | 直接 |
57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
81324,53850 81324 -电压门控钾通道 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
82109,82109 82109 -MIR域 82109 -MIR域 | 0 | 直接 |
57196,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54452,48726 54452 -MHC抗原识别域 48726 -免疫球蛋白 | 0.0003557 | 直接 |
57535,57535 57535 -补充控制模块/SCR域 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0.0007682 | 直接 |
49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.001479 | 继承自:脱髓鞘病||多发性硬化 |
57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.002575 | 继承自:大疱性类天疱疮||水疱性皮肤病||凝血病||交界性大疱性表皮松解||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.004201 | 继承自:脱髓鞘病||大疱性类天疱疮||连接||多发性硬化||颅缝骨化||急性肾衰竭||肌肉骨骼系统疾病||免疫系统疾病 |
57716,48508 57716 -糖皮质激素受体样(DNA-结合域) 48508 -核受体配体结合域 | 0.004784 | 继承自:胆囊疾病 |
90123,52540 90123 -ABC转运蛋白跨膜区 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0.005562 | 继承自:脑部疾病||支气管扩张||肾上腺脑白质营养不良||硬化性胆管炎||胆道疾病||肝内胆汁淤积||腹泻||超敏反应病||脑白质营养不良||原发性胆汁性肝硬化 |
69179,69179 69179 -整合素域 69179人-整合素域 | 0.006278 | 继承自:不育 |
69318,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 | 0.006278 | 继承自:不育 |
57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0.01416 | 继承自:血管疾病||动脉疾病||牛磺酸病||阿尔茨海默病 |
63380,52343 63380 -核黄素合酶域样 52343 -铁氧还蛋白还原酶样,C末端NADP-连接域 | 0.0193 | 继承自:吞噬细胞杀菌功能障碍||原发性免疫缺陷病 |
57440,50494 57440 -类似Kringle 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0.0193 | 继承自:女性生殖系统疾病||血管疾病||肝脏疾病||过敏反应Ⅱ型疾病||动脉粥样硬化||下呼吸道疾病||动脉疾病||凝血病||心血管系统疾病||动脉硬化性心血管疾病||脑变性||中枢神经系统疾病||肺部疾病||牙周病||子宫内膜异位症||脑白质营养不良||心肌梗死||牙齿疾病 |
54001,49309 54001个-半胱氨酸蛋白酶 49309 -谷氨酰胺转胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承自:疱疹样皮炎||表皮系统疾病||大疱性皮肤病||皮肤和结缔组织自身免疫病||皮肤病 |
81296,54001 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 | 0.03044 | 继承自:疱疹样皮炎||表皮系统疾病||大疱性皮肤病||皮肤和结缔组织自身免疫病||皮肤病 |
49309,49309 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承自:疱疹样皮炎||表皮系统疾病||大疱性皮肤病||皮肤和结缔组织自身免疫病||皮肤病 |
46579,64593 46579 -前折叠素 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 | 0.03044 | 继承自:表皮系统疾病 |
53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920个-热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0.03044 | 继承自:血管疾病 |
57196,57184 57196个-EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0.04597 | 继承自:紫癜||凝血病||出血性疾病||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
49265,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0.04777 | 继承自:心脏病||心血管系统疾病||心肌病||固有性心肌病 |
48092,47655 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 | 0.04777 | 继承自:结肠炎||肾炎||肠道疾病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||炎症性肠病||哮喘||肾小球肾炎||干燥综合征 |
47986,47986 47986人-死亡域 47986人-死亡域 | 0.04777 | 继承自:下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||免疫系统疾病||皮肤病 |
49417,55550 49417 -p53类转录因子 55550个-SH2域 | 0.04777 | 继承自:结肠炎||肾炎||肠道疾病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||炎症性肠病||哮喘||肾小球肾炎||干燥综合征 |
64593,64593 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 | 0.04777 | 继承自:掌跖角化病||皮肤病 |
47655,49417 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 | 0.04777 | 继承自:结肠炎||肾炎||肠道疾病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||炎症性肠病||哮喘||肾小球肾炎||干燥综合征 |
53300,53300 53300 -类似vWA 53300 -vWA类 | 0.04777 | 继承自:肌肉疾病||肌营养不良||肌肉组织病 |
57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0.06011 | 继承自:紫癜||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
46966,46966 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 | 0.06011 | 继承自:肌肉疾病||肌肉组织病 |
57184,52058 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0.07547 | 继承自:神经病 |
49723,48484 49723 -脂肪酶/脂肪加氧酶结构域(PLAT/LH2结构域) 48484 -脂氧化酶 | 0.07547 | 继承自:表皮系统疾病||鱼鳞病||张力障碍||阿尔茨海默病||皮肤病 |
52058,57184 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0.07547 | 继承自:神经病 |
55550,56112 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0.08063 | 继承自:血小板病||血小板增多||严重联合免疫缺陷 |
57184,57196 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.08327 | 继承自:骨发育疾病 |
57424,57184 57424 -LDL受体样模块 57184 -生长因子受体结构域 | 0.1175 | 继承自:牛磺酸病||阿尔茨海默病 |
57944,56436 57944 -C型凝集素的三螺旋结构域 56436 -C型凝集素样 | 0.1175 | 继承自:过敏性鼻炎||鼻腔疾病||鼻部疾病||间质性肺病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||肺部疾病||上呼吸道疾病||哮喘 |
57184,63825 57184 -生长因子受体结构域 63825 -YWTD域 | 0.1175 | 继承自:动脉粥样硬化||动脉硬化||动脉硬化性心血管疾病||牛磺酸病||阿尔茨海默病 |
53474,49723 53474 -α/β水解酶类 49723 -脂肪酶/脂氧合酶结构域(PLAT/LH2结构域) | 0.1175 | 继承自:胰腺炎||动脉粥样硬化||动脉硬化||胰腺疾病||心脏病||动脉硬化性心血管疾病||冠状动脉疾病||内分泌系统疾病||心肌梗死 |
49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0.1947 | 继承自:视网膜炎||色素性视网膜炎||视网膜变性 |
55486,57552 55486 -金属蛋白酶(“zincins”),催化结构域 57552 -凝血抑制剂(去整合素) | 0.1958 | 继承自:动脉粥样硬化||动脉疾病||动脉硬化性心血管疾病 |
47473,47473 47473 -结构域 47473 -结构域 | 0.2383 | 继承自:肌营养不良||杜氏肌营养不良 |
56436,56436 56436 -C型凝集素样 56436 -C型凝集素样 | 0.2383 | 继承自:肾脏疾病||慢性肾脏病||泌尿系统疾病||肾小球肾炎 |
47090,55486 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 | 0.2789 | 继承自:支气管扩张||女性生殖系统疾病||骨炎性疾病||胃肠系统疾病||川崎病||生殖系统疾病||腹主动脉瘤||动脉粥样硬化||下呼吸道疾病||口腔疾病||肌炎||动脉疾病||主动脉疾病||皮肌炎||淋巴结疾病||呼吸系统疾病||动脉硬化性心血管疾病||近视||巴雷特食管||硬皮病||肺部疾病||肌肉骨骼系统疾病||关节炎||折射误差||固有性心肌病||牙齿疾病 |
63712,90112 63712 -烟碱受体配体结合域样 90112 -神经递质门控离子通道跨膜孔 | 0.3175 | 继承自:脑部疾病||早期肌阵挛性脑病||路易体痴呆||额叶癫痫||神经系统疾病 |
55486,50923 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0.3394 | 继承自:女性生殖系统疾病||胃肠系统疾病||川崎病||生殖系统疾病||动脉粥样硬化||口腔疾病||淋巴结疾病||动脉硬化性心血管疾病||淋巴系统疾病||扩张型心肌病||巴雷特食管||肺部疾病||牙齿疾病 |
54928,54928 54928个-RNA-结合域 54928 -RNA结合结构域 | 0.4032 | 继承自:短暂性脑缺血 |
49417,81296 49417 -p53类转录因子 81296 -E集合域 | 0.412 | 继承自:结肠炎 |
48371,48371 48371 -ARM重复 48371 -ARM重复 | 0.4132 | 继承自:共济失调毛细血管扩张||外周血管疾病||遗传性共济失调||常染色体隐性小脑共济失调||毛细血管扩张 |
52833,47616 52833 -类硫氧还蛋白 47616 -GST C终端域类 | 0.448 | 继承自:阻塞性肺病||血红蛋白病||正常细胞性贫血||巴雷特食管||先天性溶血性贫血 |
48726,49265 48726个-免疫球蛋白 49265 -III型纤连蛋白 | 0.4507 | 继承自:心肌病||急性肾衰竭||固有性心肌病 |
50729,50729 50729 -PH类域 50729 -PH类域 | 0.5544 | 继承自:性腺疾病||高雄激素血症||性别分化病 |
49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.7911 | 继承自:天疱疮||少毛症 |
N到C端子顺序的超域(双工) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
47005,52777 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
53300,69179 53300 -vWA类 69179人-整合素域 | 0 | 直接 |
57424,50494 57424个-LDL受体样模块 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
49265,56112 49265 -纤维连接蛋白III型 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
50729,50156 50729 -PH类域 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
57630,57196 57630 -GLA-域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
52025,53187 52025 -PA域 53187 -锌依赖性外肽酶 | 0 | 直接 |
57889,49562 57889 -富含半胱氨酸结构域 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
51230,47005 51230 -单杂交图案 47005年-2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 | 0 | 直接 |
57196,57535 57196 -表皮生长因子/层粘连蛋白 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0 | 直接 |
90188,90188 90188 -生长激素B结构域 90188 -生长激素B结构域 | 0 | 直接 |
57603,82895 57603 -类FnI域 82895 -TSP-1 1型重复 | 0 | 直接 |
52540,-7 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 -7 -CATH公司 | 0 | 直接 |
51445,51445 51445 -(反式)糖苷酶 51445 -(反式)糖苷酶 | 0 | 直接 |
49417,47719 49417 -p53类转录因子 47719 -p53四聚结构域 | 0 | 直接 |
63737,55486 63737 -白三烯A4水解酶N-末端结构域 55486 -金属蛋白酶(“zincins”),催化结构域 | 0 | 直接 |
57196,69687 57196个-EGF/层粘连蛋白 69687 -整合素β尾结构域 | 0 | 直接 |
103647,103647 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 | 0 | 直接 |
57196,50494 57196 -EGF/层粘连蛋白 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
103647,49899 103647 -TSP类型-3重复 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
47473,57850 47473 -结构域 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
81324,81327 81324 -电压门控钾通道 81327 -小电导率钾通道 | 0 | 直接 |
57196,90193 57196 -表皮生长因子/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
49410,50242 49410人-α-巨球蛋白受体结构域 50242 -类TIMP | 0 | 直接 |
49758,47473 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) 47473 -结构域 | 0 | 直接 |
90193,90193 90193 -陷波域 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
54001,49758 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49758 -钙蛋白酶大亚单位,中间结构域(结构域III) | 0 | 直接 |
57362,57362 57362 -类似BPTI 57362 -类似BPTI | 0 | 直接 |
102712,-7 102712 -JAB1/MPN域 -7 -CATH公司 | 0 | 直接 |
57184,100895 57184人-生长因子受体结构域 2008年-Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
82109,100909 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
75399,75399 75399 -Plakin重复 75399 -Plakin重复 | 0 | 直接 |
48552,48552 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 | 0 | 直接 |
53850,53850 53850 -周质结合蛋白样II 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
57184,57603 57184 -生长因子受体结构域 57603 -类FnI域 | 0 | 直接 |
49503,49503 49503 -铜氧还蛋白类 49503 -铜氧还蛋白类 | 0 | 直接 |
53187,47672 53187 -锌依赖性外肽酶 47672人-转铁蛋白受体样二聚结构域 | 0 | 直接 |
57414,57440 57414 -包含类域的发夹环 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
50494,50156 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 第50156页-PDZ域类 | 0 | 直接 |
57924,57924 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 | 0 | 直接 |
100895,100895 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
54534,54534 54534 -类FKBP 54534 -类FKBP | 0 | 直接 |
51445,54556 51445 -(反式)糖苷酶 54556 -几丁质酶插入域 | 0 | 直接 |
90188,53649 90188 -生长激素B结构域 53649 -碱性磷酸酶样 | 0 | 直接 |
100920,100934 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合结构域 100934 -热休克蛋白70kD(HSP70),C端亚结构域 | 0 | 直接 |
47576,48065 47576人-钙粘蛋白同源结构域 48065 -DBL同源域(DH-domain) | 0 | 直接 |
53822,53850 53822 -周质结合蛋白样I 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
52980,47781 52980 -限制性内切酶样 47781 -RuvA域2类 | 0 | 直接 |
57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
81324,53850 81324 -电压门控钾通道 53850 -周质结合蛋白样II | 0 | 直接 |
82109,82109 82109 -MIR域 82109 -MIR域 | 0 | 直接 |
57196,49899 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899人-伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
54452,48726 54452 -MHC抗原识别域 48726 -免疫球蛋白 | 0.0003557 | 直接 |
57535,57535 57535 -补充控制模块/SCR域 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0.0007682 | 直接 |
49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.001479 | 继承 |
57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.002575 | 继承 |
48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.004201 | 继承 |
57716,48508 57716 -糖皮质激素受体样(DNA结合域) 48508 -核受体配体结合域 | 0.004784 | 继承 |
90123,52540 90123 -ABC转运蛋白跨膜区 52540 -含P-loop的三磷酸核苷水解酶 | 0.005562 | 继承 |
69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0.006278 | 继承 |
69318,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 | 0.006278 | 继承 |
57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 | 0.01416 | 继承 |
63380,52343 63380 -核黄素合酶域样 52343 -Ferredoxin还原酶样,C-末端NADP连接结构域 | 0.0193 | 继承 |
57440,50494 57440 -类似Kringle 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0.0193 | 继承 |
54001,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309年-转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承 |
81296,54001 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 | 0.03044 | 继承 |
49309,49309 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承 |
46579,64593 46579 -前折叠素 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 | 0.03044 | 继承 |
53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0.03044 | 继承 |
57196,57184 57196个-EGF/层粘连蛋白 57184人-生长因子受体域 | 0.04597 | 继承 |
49265,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0.04777 | 继承 |
48092,47655 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 | 0.04777 | 继承 |
47986,47986 47986 -死亡域 47986 -死亡域 | 0.04777 | 继承 |
49417,55550 49417 -p53类转录因子 55550个-SH2域 | 0.04777 | 继承 |
64593,64593 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 64593 -中间丝蛋白,卷曲螺旋区 | 0.04777 | 继承 |
47655,49417 47655 -统计 49417 -p53类转录因子 | 0.04777 | 继承 |
53300,53300 53300 -vWA类 53300 -vWA类 | 0.04777 | 继承 |
57184,57184 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0.06011 | 继承 |
46966,46966 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 | 0.06011 | 继承 |
57184,52058 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0.07547 | 继承 |
49723,48484 49723 -脂肪酶/脂氧合酶结构域(PLAT/LH2结构域) 48484 -脂氧化酶 | 0.07547 | 继承 |
52058,57184 52058 -L类域名 57184人-生长因子受体域 | 0.07547 | 继承 |
55550,56112 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0.08063 | 继承 |
57184,57196 57184 -生长因子受体域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.08327 | 继承 |
57424,57184 57424 -LDL受体样模块 57184 -生长因子受体结构域 | 0.1175 | 继承 |
57944,56436 57944 -C型凝集素的三螺旋结构域 56436 -C型凝集素样 | 0.1175 | 继承 |
57184,63825 57184 -生长因子受体域 63825 -YWTD域 | 0.1175 | 继承 |
53474,49723 53474 -α/β水解酶 49723 -脂肪酶/脂氧合酶结构域(PLAT/LH2结构域) | 0.1175 | 继承 |
49899,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0.1947 | 继承 |
55486,57552 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 57552 -凝血抑制剂(去整合素) | 0.1958 | 继承 |
47473,47473 47473 -结构域 47473 -结构域 | 0.2383 | 继承 |
56436,56436 56436 -C型凝集素样 56436 -C型凝集素样 | 0.2383 | 继承 |
47090,55486 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 | 0.2789 | 继承 |
63712,90112 63712 -烟碱受体配体结合结构域样 90112 -神经递质门控离子通道跨膜孔 | 0.3175 | 继承 |
55486,50923 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0.3394 | 继承 |
54928,54928 54928 -RNA-结合域 54928 -RNA-结合域 | 0.4032 | 继承 |
49417,81296 49417 -p53类转录因子 81296 -E集合域 | 0.412 | 继承 |
48371,48371 48371 -ARM重复 48371 -ARM重复 | 0.4132 | 继承 |
52833,47616 52833 -类硫氧还蛋白 47616 -GST C-末端结构域样 | 0.448 | 继承 |
48726,49265 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.4507 | 继承 |
50729,50729 50729 -PH类域 50729 -PH类域 | 0.5544 | 继承 |
49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.7911 | 继承 |
(显示详细信息)
注释到此DO术语的超域(不在SPDO中)
以灰色突出显示的是FDR>0.001的那些
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
51230,47005,52777 51230 -单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚单位结合域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
57196,57581,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57581个-TB模块/8-cys域 57196个-EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
103647,103647,49899 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57924,57924,57924 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 | 0 | 直接 |
100895,100895,100895 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
57889,57889,49562 57889 -富含半胱氨酸结构域 57889 -富含半胱氨酸结构域 49562个-C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
50729,55550,56112 50729 -PH结构域样 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
57196,57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
53300,53300,53300 53300 -vWA类 53300 -vWA类 53300 -vWA类 | 0 | 直接 |
47986,47986,52129 47986 -死亡域 47986 -死亡域 52129 -类半胱氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57440,57440,50494 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57630,57196,50494 57630 -GLA结构域 57196 -表皮生长因子/层粘连蛋白 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57424,57424,50494 57424个-LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
47576,48065,50729 47576 -钙粘蛋白同源结构域 48065 -DBL同源域(DH-domain) 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
47473,47473,57850 47473 -结构域 47473 -结构域 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
57440,57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
57414,57440,57440 57414 -包含类域的发夹环 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
50044,55550,50044 50044 -SH3-域 55550个-SH2域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
90188,90188,53649 90188 -生长激素B结构域 邮编:90188-生长激素B结构域 53649个-碱性磷酸酶样 | 0 | 直接 |
57184,57196,57184 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0 | 直接 |
48726,49265,48726 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
55550,56112,56112 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
57586,57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
103647,103647,103647 103647个-TSP类型-3重复 103647 -TSP 3型重复 103647 -TSP类型-3重复 | 0 | 直接 |
49899,57196,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
82109,82109,100909 82109 -MIR域 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
52025,53187,47672 52025 -PA域 53187 -锌依赖性外肽酶 47672 -转铁蛋白受体样二聚结构域 | 0 | 直接 |
53067,100920,100934 53067个-类肌动蛋白ATP酶结构域 100920个-热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 100934 -热休克蛋白70kD(HSP70),C端亚结构域 | 0 | 直接 |
48552,48552,48552 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 | 0 | 直接 |
57196,57196,69687 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 69687 -整合素β尾结构域 | 0 | 直接 |
52058,48726,48726 52058 -L类域名 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
49265,48726,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
50729,50156,50156 50729 -PH类域 50156 -PDZ域类 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
48726,49265,56112 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
57535,57535,57535 57535 -补充控制模块/SCR域 57535 -补充控制模块/SCR域 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0.0001831 | 直接 |
69318,69179,69179 69318 -整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0.006278 | 继承自:不育 |
69179,69179,69179 69179 -整合素域 69179人-整合素域 69179 -整合素域 | 0.01416 | 继承自:不育 |
57196,57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.01512 | 继承自:紫癜||水疱性皮肤病||凝血病||交界性大疱性表皮松解||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
57196,57184,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体结构域 | 0.0193 | 继承自:过敏反应Ⅱ型疾病||紫癜||凝血病||出血性疾病||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
57424,57424,57424 57424 -LDL受体样模块 57424个-LDL受体样模块 57424个-LDL受体样模块 | 0.02103 | 继承自:血管疾病||动脉疾病||张力障碍||阿尔茨海默病 |
81296,54001,49309 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承自:疱疹样皮炎||表皮系统疾病||大疱性皮肤病||皮肤和结缔组织自身免疫病||皮肤病 |
53067,53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0.03044 | 继承自:血管疾病 |
54001,49309,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承自:疱疹样皮炎||表皮系统疾病||大疱性皮肤病||皮肤和结缔组织自身免疫病||皮肤病 |
82895,82895,82895 82895年-TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0.03129 | 继承自:骨吸收病 |
46966,46966,46966 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 | 0.03877 | 继承自:肌肉疾病||肌肉组织病 |
57184,57196,57196 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.04637 | 继承自:脑血管病 |
48092,47655,49417 48092 -转录因子STAT-4 N-结构域 47655 -斯达 第49417页-p53类转录因子 | 0.04777 | 继承自:结肠炎||肾炎||肠道疾病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||炎症性肠病||哮喘||肾小球肾炎||干燥综合征 |
47655,49417,55550 47655 -斯达 49417 -p53类转录因子 55550个-SH2域 | 0.04777 | 继承自:结肠炎||肾炎||肠道疾病||下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||炎症性肠病||哮喘||肾小球肾炎||干燥综合征 |
49265,49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.06011 | 继承自:特发性间质性肺炎 |
52058,57184,52058 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0.07547 | 继承自:神经病 |
57196,57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 | 0.1113 | 继承自:紫癜||凝血病||出血性疾病||血液自身免疫性疾病||原发性血小板减少 |
48726,48726,48726 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.1143 | 继承自:连接||颅缝骨化||骨骼发育不良 |
57424,57184,63825 57424个-LDL受体样模块 57184人-生长因子受体结构域 63825 -YWTD域 | 0.1827 | 继承自:牛磺酸病||阿尔茨海默病 |
57184,52058,57184 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 | 0.1827 | 继承自:下呼吸道疾病||呼吸系统疾病||周围神经系统疾病||神经病 |
57424,57424,57184 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 57184 -生长因子受体结构域 | 0.1827 | 继承自:牛磺酸病||阿尔茨海默病 |
48726,48726,49265 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 49265 -III型纤连蛋白 | 0.3729 | 继承自:心肌病||急性肾衰竭||固有性心肌病 |
47090,55486,50923 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0.4943 | 继承自:女性生殖系统疾病||胃肠系统疾病||川崎病||生殖系统疾病||动脉粥样硬化||下呼吸道疾病||口腔疾病||淋巴结疾病||动脉硬化性心血管疾病||扩张型心肌病||巴雷特食管||肺部疾病||固有性心肌病||牙齿疾病 |
49313,49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.7911 | 继承自:天疱疮||少毛症 |
N到C端子顺序的超域(三重) |
FDR(全部) |
注释(直接或继承) |
51230,47005,52777 51230个-单杂交图案 47005 -2-氧代酸脱氢酶复合物的外周亚基结合结构域 52777 -辅酶A依赖性酰基转移酶 | 0 | 直接 |
57196,57581,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57581 -TB模块/8-cys域 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0 | 直接 |
103647,103647,49899 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
57924,57924,57924 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 57924 -凋亡抑制因子(IAP)重复 | 0 | 直接 |
100895,100895,100895 2008年-Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 2008年-Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 100895 -Kazal型丝氨酸蛋白酶抑制剂 | 0 | 直接 |
57889,57889,49562 57889 -富含半胱氨酸结构域 57889 -富含半胱氨酸结构域 49562 -C2结构域(钙/脂质结合结构域,CaLB) | 0 | 直接 |
50729,55550,56112 50729 -PH类域 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
57196,57196,90193 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 90193 -陷波域 | 0 | 直接 |
53300,53300,53300 53300 -vWA类 53300 -vWA类 53300 -类似vWA | 0 | 直接 |
47986,47986,52129 47986 -死亡域 47986 -死亡域 52129 -类半胱氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57440,57440,50494 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57630,57196,50494 57630 -GLA-域 57196 -EGF/层粘连蛋白 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
57424,57424,50494 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 50494 -胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶 | 0 | 直接 |
47576,48065,50729 47576 -钙粘蛋白同源结构域 48065 -DBL同源域(DH-domain) 50729 -PH类域 | 0 | 直接 |
47473,47473,57850 47473 -结构域 47473 -结构域 57850 -环/U形盒 | 0 | 直接 |
57440,57440,57440 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
57414,57440,57440 57414 -包含类域的发夹环 57440 -类似Kringle 57440 -类似Kringle | 0 | 直接 |
50044,55550,50044 50044 -SH3结构域 55550个-SH2域 50044 -SH3-域 | 0 | 直接 |
90188,90188,53649 90188 -生长激素B结构域 90188 -生长激素B结构域 53649 -碱性磷酸酶样 | 0 | 直接 |
57184,57196,57184 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体域 | 0 | 直接 |
48726,49265,48726 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
55550,56112,56112 55550个-SH2域 56112 -蛋白激酶样(PK样) 56112 -蛋白激酶样(PK样) | 0 | 直接 |
57586,57586,57586 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 57586 -TNF受体样 | 0 | 直接 |
103647,103647,103647 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 103647 -TSP类型-3重复 | 0 | 直接 |
49899,57196,49899 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 57196 -EGF/层粘连蛋白 49899 -伴刀豆球蛋白A样凝集素/葡聚糖酶 | 0 | 直接 |
82109,82109,100909 82109 -MIR域 82109 -MIR域 100909 -IP3受体1型结合核心,结构域2 | 0 | 直接 |
52025,53187,47672 52025 -PA域 53187 -锌依赖性外肽酶 47672 -转铁蛋白受体样二聚结构域 | 0 | 直接 |
53067,100920,100934 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 100934 -热休克蛋白70kD(HSP70),C末端亚结构域 | 0 | 直接 |
48552,48552,48552 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 48552 -血清蛋白样 | 0 | 直接 |
57196,57196,69687 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 69687 -整合素β尾结构域 | 0 | 直接 |
52058,48726,48726 5月58日-L类域名 48726 -免疫球蛋白 48726个-免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
49265,48726,48726 49265 -纤维连接蛋白III型 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0 | 直接 |
50729,50156,50156 50729 -PH类域 50156 -PDZ域类 50156 -PDZ域类 | 0 | 直接 |
48726,49265,56112 48726 -免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 56112 -蛋白激酶样(PK-like) | 0 | 直接 |
57535,57535,57535 57535 -补充控制模块/SCR域 57535个-补充控制模块/SCR域 57535 -补充控制模块/SCR域 | 0.0001831 | 直接 |
69318,69179,69179 69318个-整合素αN末端结构域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0.006278 | 继承 |
69179,69179,69179 69179 -整合素域 69179 -整合素域 69179 -整合素域 | 0.01416 | 继承 |
57196,57196,57196 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.01512 | 继承 |
57196,57184,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体结构域 57184 -生长因子受体域 | 0.0193 | 继承 |
57424,57424,57424 57424 -低密度脂蛋白受体样模块 57424 -LDL受体样模块 57424个-LDL受体样模块 | 0.02103 | 继承 |
81296,54001,49309 81296 -E集合域 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承 |
53067,53067,100920 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 53067 -类肌动蛋白ATP酶结构域 100920 -热休克蛋白70kD(HSP70),肽结合域 | 0.03044 | 继承 |
54001,49309,49309 54001 -半胱氨酸蛋白酶 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 49309 -转谷氨酰胺酶,两个C末端结构域 | 0.03044 | 继承 |
82895,82895,82895 82895 -TSP-1 1型重复 82895年-TSP-1 1型重复 82895 -TSP-1 1型重复 | 0.03129 | 继承 |
46966,46966,46966 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 46966 -Spectrin重复 | 0.03877 | 继承 |
57184,57196,57196 57184 -生长因子受体结构域 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 | 0.04637 | 继承 |
48092,47655,49417 48092 -转录因子STAT-4 N域 47655 -斯达 49417 -p53样转录因子 | 0.04777 | 继承 |
47655,49417,55550 47655 -统计 49417 -p53类转录因子 55550个-SH2域 | 0.04777 | 继承 |
49265,49265,49265 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.06011 | 继承 |
52058,57184,52058 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 | 0.07547 | 继承 |
57196,57196,57184 57196 -EGF/层粘连蛋白 57196 -EGF/层粘连蛋白 57184 -生长因子受体域 | 0.1113 | 继承 |
48726,48726,48726 48726个-免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 48726 -免疫球蛋白 | 0.1143 | 继承 |
57424,57184,63825 57424 -LDL受体样模块 57184 -生长因子受体结构域 63825 -YWTD域 | 0.1827 | 继承 |
57184,52058,57184 57184 -生长因子受体结构域 52058 -L类域名 57184 -生长因子受体域 | 0.1827 | 继承 |
57424,57424,57184 57424 -LDL受体样模块 57424 -LDL受体样模块 57184 -生长因子受体域 | 0.1827 | 继承 |
48726,48726,49265 48726 -免疫球蛋白 48726个-免疫球蛋白 49265 -纤维连接蛋白III型 | 0.3729 | 继承 |
47090,55486,50923 47090 -类PGBD 55486 -金属蛋白酶(“锌蛋白”),催化域 50923 -血红素样结构域 | 0.4943 | 继承 |
49313,49313,49313 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 49313 -类钙粘蛋白 | 0.7911 | 继承 |
在系统发育树上为超域(单个/单个)用这个表型术语注释
|
将树绘制为:
| | 下载Newick格式树:
|
(显示帮助)
树木依据树向量
使用蛋白质结构域和超结构域生成存在/缺失矩阵超级家族中的所有基因组。这个RAxML公司软件用于使用启发式简约方法。基因组组合或特定分支可以显示为如果有单株树的话。然而,这些数据是从单个大树。这会产生比生成树时更高质量的拓扑并允许树立即显示。
|
|