蛋白质BLASTDB是基于添加的

版本5 BLAST(数据库版本5)蛋白质数据库现在是基于存取的。您可以访问这些数据库和我们的FTP站点.

正如我们在上一个帖子,这意味着它们现在含有来自NCBI病原体项目以及其他高吞吐量项目。v5数据库还与具有多字符链标识符的PDB结构中的蛋白质兼容,并将在其他蛋白质系统中可用时包括这些蛋白质。只有最新版本的BLAST+(2.9.0下载)将使用更新的v5数据库,并允许您访问所有最新的蛋白质和核苷酸数据。2019年冬季,我们将停止更新第4版BLAST数据库,并提供v5数据库作为默认下载。

此外,makeblastdb将在2019年10月发布的BLAST 2.10.0中更新,因此默认情况下它会创建dbV5格式的数据库。

有关新数据库版本和BLAST+(2.9.0)的更多信息,请参阅以前的NCBI见解文章以及记录我们最近的网络研讨会。

关于“蛋白质BLASTDB是基于添加的

留下回复