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生物学
国际标准编号:2059-7983

2020年10月发布

突出显示的插图

封面插图:螺旋系综在分子替换方面优于理想螺旋。使用新的螺旋系综库成员成功运行MR的示例。跨膜结构PDB入口的解决方案第四季度,放置了七份25剩余螺旋系综的副本(顶部);球状结构PDB入口5平方米8,放置了12份15剩余螺旋系综的副本(中间)和线圈-线圈结构PDB入口的解决方案1d7米,带有两份35个残基组合的副本(底部)。在所有三幅图像中,红色链对应于沉积的晶体结构,蓝色链对应于MR放置的系综(仅示出了系综的第一个模型)。搜索模型是透明的,以便于目标结构的可视化。[桑切斯·罗德里格斯等人。(2020),阿克塔·克里斯特。D类76, 962-970].

CCP4型


阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,908-911
https://doi.org/10.107/S2059798320011201
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讨论了等级结构和其他结构之间可能存在的联系,这些结构维持着科学领域的性别差异,并讨论了合作障碍阻碍科学进步的两个例子。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,912-925
https://doi.org/10.107/S205979832001061X
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研究了电子冷冻显微镜对图谱进行密度修改的先决条件,并提出了一种结合基于模型的信息的程序。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,926-937
https://doi.org/10.107/S2059798320011043
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高分子原子B类-值分布已使用移位逆伽马分布的混合来建模。B类-值和分辨率依赖的局部ADP差异也用于验证重原子和配体。

ISDSB2019标准


阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,938-945
https://doi.org/10.107/S2059798320011584
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已经开发了一个晶体安装平台,用于本地SAD相位调整。该平台包括一个新设计的无溶液工具和一个用于同步加速器设施的自动冷冻提取机器人。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,946-953
https://doi.org/10.1107/S2059798320011365
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采用冷气流冷却和液氮预冷两种方法对中子衍射实验用大晶体进行厌氧冷却,比较了它们对晶体质量的影响。气流冷却足以抑制整个晶体镶嵌性的增加,从而成功地从普通脱硫弧菌以其有效的简化形式。

研究论文


阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,954-961
https://doi.org/10.1107/S2059798320010499
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TRIM-蛋白环结构域通常存在于弱单体-二聚体结合中;在这里,TRIM69的环结构域形成了一个紧密的二聚体,并且该结构被用来讨论这种高亲和力相互作用的原因。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,962-970
https://doi.org/10.107/S205979832001133X
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螺旋系综通过MR和充足的与理想的螺旋线相比,CPU成本不会更高。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,971-981
https://doi.org/10.1107/S2059798320010700
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描述了用于BioSAXS实验的四种非常有效的清除剂,三种核苷和一种氮碱。添加这些化合物时,受试蛋白质溶液的临界辐射剂量增加了20倍,而不会改变蛋白质的稳定性或降低对比度,从而允许在低分子量和低浓度蛋白质样品上进行BioSAXS实验。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,982-992
https://doi.org/10.1107/S2059798320010992
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配合物的生物化学研究和晶体结构M.污点MutT1与8-oxo-dGTP、GMPPNP和GMPPCP的结合阐明了分子间相互作用、分子可塑性和酶对核苷酸的作用之间的关系,并提供了配体构象对特异性的调节的见解。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,993-1000
https://doi.org/10.107/S2059798320011298
链接到html
血管抑素-1和小血管抑素结合蛋白(SVBP)在晶体中形成分子间异四聚体。异源四聚体通过交换保守的N末端区域而稳定。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,1001-1014
https://doi.org/10.107/S2059798320011341
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来自多个溶剂浸泡晶体结构的数据用于提高模型质量,识别蛋白质-蛋白质相互作用位点的结合有机分子,并识别控制DNA结合的保守水网络。差速器B类-因子分析确定了不同溶剂对蛋白质流动性的区域特异性影响。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,1015-1024
https://doi.org/10.107/S2059798320010906
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CYRI-B的晶体结构被揭示,为理解这种高度保守的真核蛋白在多种肌动蛋白依赖性细胞过程中的作用提供了模板。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,1025-1032
https://doi.org/10.107/S2059798320011729
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确定中子晶体结构中水分子氘原子的方向对晶体学家来说是一项繁琐的任务。提出了一种自动方法,用于系统地重新定向水分子,并确定正确定向的水分子。

阿克塔·克里斯特。(2020年)。D类76,1033-1049
https://doi.org/10.107/S2059798320011687
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趋化因子CXCL13依赖其N末端进行信号传递,但微小的长度和侧链变化仍会导致蛋白质的激动形式。两个晶体结构表明,蛋白质的N端和C端延伸都是高度柔性的,而蛋白质的核心结构域是刚性的。
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