sccore:单细胞RNA-Seq的核心实用程序

单细胞RNA-seq数据分析的核心实用程序。其中包含用于处理差分表达式(DE)矩阵和计数矩阵的实用函数,一组用于通过“ggplot2”操作和绘制数据的函数,以及用于处理单元格图和单元格嵌入的函数。基于图的方法包括将kNN细胞图嵌入UMAP<doi:10.21105/joss.00861>折叠图中每个簇的顶点,并传播图标签。

版本: 1.0.5
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 数字播放器,ggplot2,gg排斥、图形、grDevices、,记录仪,厄尔巴,马格里特,矩阵,方法,并行,pbmcapply公司,pROC公司,卢比,爱尔兰航空公司,规模,统计,易怒的,实用程序,超高速,用r
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,Rcpp进度,Rcpp特征
建议: ggrastr公司(≥ 0.1.7),jsonlite公司,rmumps泵,测试那个
出版: 2024-02-23
内政部: 10.32614/CRAN.包装
作者: Viktor Petukhov〔aut〕,拉斯穆斯·里德比克[aut],彼得·哈尔琴科[aut],埃文·比德斯特特[aut,cre]
维护人员: Evan Biederstedt在gmail.com>
错误报告: https://github.com/kharchenkolab/sccore/issues
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/kharchenkolab/ccore
需要编译:
材料: 自述
在视图中: 组学
CRAN检查: sccore结果

文档:

参考手册: sccore.pdf文件

下载内容:

包源: sccore_1.0.5.tar.gz标准
Windows二进制文件: r-devel公司:sccore_1.0.5.zip文件,r版本:sccore_1.0.5.zip文件,r-oldrel:sccore_1.0.5.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):sccore1.0.5.tgz标准,r-oldrel(arm64):sccore1.0.5.tgz标准,r-release(x86_64):sccore1.0.5.tgz标准,r-oldrel(x86_64):sccore_1.0.5.tgz标准立方英尺
旧来源: sccore存档

反向依赖关系:

反向进口: 科诺斯,CR指标,莱登阿尔格,宝塔2,scITD公司

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