rhierbaps:使用HierBAPS算法聚类遗传序列数据

实现种群结构的层次贝叶斯分析(hierBAPS)Cheng等人(2013)的算法<doi:10.1093/molbev/mst028>用于聚类DNA序列FASTA格式的多序列比对。该实现包括改进的默认值和绘图功能与最初的“MATLAB”版本不同的是,默认情况下会删除单个SNP。

版本: 1.1.4
进口: ,呜呜声,实用程序,ggplot2,矩阵统计,拼凑,方法
建议: 针织物,rmarkdown公司,ggtree(ggtree),植物醇,测试那个,格式R
出版: 2022-11-18
作者: Gerry Tonkin-Hill[创作,创作]
维护人员: Gerry Tonkin-Hill<g.tonkinhill at gmail.com>
错误报告: https://github.com/gtonkinhill/rhierbaps/issues网站
许可证: 麻省理工学院+文件许可证
网址: https://github.com/gtonkinhill/rhierbaps网站
需要编译:
引用: rhierbaps引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: rhierbaps结果

文档:

参考手册: 莱茵巴普.pdf
渐晕图: rhierbap简介

下载内容:

包源: rhierbaps_1.1.4.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:rhierbaps_1.1.4.zip拉链,r-释放:rhierbaps_1.1.4.zip拉链,r-oldrel:rhierbaps_1.1.4.zip拉链
macOS二进制文件: r释放(arm64):rhierbaps1.1.4.tgz型,r-oldrel(arm64):rhierbaps1.1.4.tgz型,r-版本(x86_64):rhierbaps1.1.4.tgz型,r-oldrel(x86_64):水球_1.1.4.tgz
旧来源: rhierbaps档案

链接:

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=rhierbaps链接到此页面。