植物醇：比较生物学（和其他事物）的系统发育工具
广泛的系统发育分析方法-集中在系统发育比较生物学，但也包括许多可视化、分析、操作、阅读或书写，甚至推断系统发育树的技术。在系统发育比较生物学中，包括用于祖先状态重建、模型构建和系统发育和特征数据模拟的各种功能。系统发育和比较数据的一系列绘图方法包括（但不限于）在树上绘制性状进化图的方法，将树投影到表型空间或地理地图上的方法，以及可视化树之间的相关物种形成的方法。最后，设计了许多功能来读取、写入、分析、推断、模拟和操作系统发育树和比较数据。例如，有从集合中计算一致系统发育的功能，有在一系列模型下模拟系统发育树和数据的功能，也有在树上随机或非随机附着物种或分支的功能，还有系统发育生物学家可能会在其研究中发现有用的广泛其他操作和分析功能。
| 版本： |
2.1-1 |
| 取决于： |
R（≥3.5.0），猿(≥ 5.7),地图 |
| 进口： |
集群生成,尾波,组合,do并行,矩阵指数函数,foreach公司、图形、grDevices、，MASS（质量）、方法、，mnormt公司,nlme公司,数字派生,optim并行，平行，潘戈恩(≥ 2.3.1),散点图3d，统计，实用程序 |
| 建议： |
动画,盖革,倍体,RColorBrewer公司,rgl公司 |
| 出版： |
2024年1月9日 |
| 作者： |
利亚姆·雷维尔 |
| 维护人员： |
Liam J.Revell<Liam.revel at umb.edu> |
| 许可证： |
GPL-2型|GPL-3公司[扩展自：GPL（≥2）] |
| 网址： |
https://github.com/liamrevell/phytools网站 |
| 需要编译： |
不 |
| 引用： |
植物醇引文信息 |
| 在视图中： |
系统发育学 |
| CRAN检查： |
植物醇结果 |
文档：
下载内容：
反向依赖关系：
| 反向取决于： |
克拉迪斯,convol公司,盖革,mvMORPH公司,树木引导器,windex公司 |
| 反向进口： |
无线电测速仪,阿拉克诺,阿伏曲,BAT公司,咬,科尔姆,日期期限,尽职调查,深时间,进化风险,鱼类PhyloMaker,娱乐空间,礼品,嘶嘶声,学习pGen,本体论,OUwie公司,古树,PBD（PBD）,佩兹,物理排序R,项目管理委员会,重合闸,Rev小工具,RPANDA公司,Rphylopars公司,RRphylo公司,敏感生理学,丝锥,TML公司,树空间 |
| 反向建议： |
编码器,连续油管维护,戴西,鱼树,独特鱼类,尼切沃,正长岩,古宇宙,系统发育EM,鸭嘴兽,速率矩阵,鼻涕虫,RNeXML,叶肉的,塞西 |
| 反向增强： |
门植物门 |
链接：
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