速率矩阵:进化速率矩阵的贝叶斯估计

进化速率矩阵是一个方差-方差矩阵,它描述了性状进化速率和多个性状之间的进化相关性。该软件包具有使用贝叶斯MCMC估计这些参数的功能。在沿着系统发育树的分支绘制的预测体系之间,可以测试性状之间的进化相关性模式是否发生了变化。可以先验地创建方案,也可以在联合估计方法下作为MCMC的一部分进行估计。该软件包具有运行MCMC链、绘制结果、评估收敛性和总结后验分布的功能。

版本: 1.2.4
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 盖革尾波公司MASS(质量)藻门阅读器mvMORPH公司卢比椭圆
链接到: 卢比RcppArmadillo公司
建议: 针织物rmarkdown公司植物醇降价
出版: 2022-06-03
作者: 丹尼尔·卡塔诺,卢克·哈蒙
维护人员: 丹尼尔·卡塔诺(Daniel Caetano)<caetanods1 at gmail.com>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司[扩展自:GPL(≥2.0)]
网址: https://github.com/Caetanods/ratematrix网站
需要编译:
CRAN检查: 比率矩阵结果

文档:

参考手册: 速率矩阵.pdf
渐晕图: 费率矩阵简介
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旧来源: 速率矩阵存档

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