popkin:任意人口结构下亲属关系和FST的估计

提供从大量双等位SNP中估计个体亲属矩阵的函数,并提取近亲繁殖系数和广义FST(Wright固定指数)。Ochoa和Storey(2021)中描述的方法<doi:10.1371/journal.pgen.1009241>.

版本: 1.3.23
取决于: R(≥3.5.0)
进口: R彩色啤酒、图形、grDevices、,
建议: BED矩阵,测试那个,针织物,rmarkdown公司,bnpsd公司
出版: 2023-01-07
作者: 亚历杭德罗·奥乔亚ORCID标识[aut,cre],约翰·D·斯托里ORCID标识[自动]
维护人员: 亚历杭德罗·奥乔亚(Alejandro Ochoa)
错误报告: https://github.com/StoreyLab/popkin/issues网站
许可证: GPL-3公司
网址: https://github.com/StoreyLab/popkin网站/
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引用: popkin引文信息
材料: 自述文件 新闻
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文档:

参考手册: 波普金.pdf
渐晕图: 用“popkin”估计任意人口结构下的亲属关系和FST

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Windows二进制文件: r-devel公司:popkin_1.3.23.zip拉链,r-释放:popkin_1.3.23.zip拉链,r-oldrel:popkin_1.3.23.zip拉链
macOS二进制文件: r释放(arm64):popkin_1.3.23.tgz系列,r-oldrel(arm64):popkin_1.3.23.tgz系列,r-版本(x86_64):popkin_1.3.23.tgz系列,r-oldrel(x86_64):popkin_1.3.23.tgz系列
旧来源: 波普金档案

反向依赖关系:

反向建议: bnpsd公司,ggmix公司,国际货币基金组织,simtract公司

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