bnpsd:从BN-PSD混合模型模拟基因型

Pritchard-Stephens-Donnelly(PSD)混合模型有k个中间亚群,n个个体从中提取由其个体特定混合比例决定的等位基因。BN-PSD模型还将Balding-Nichols(BN)等位基因频率模型应用于中间种群,因此中间种群独立于具有亚种群特异性FST(Wright固定指数)参数的共同祖先种群T进化而来。BN-PSD模型可用于产生复杂的种群结构。这种模拟方法现在扩展到与树相关的子种群。Ochoa和Storey(2021)中描述的方法<doi:10.1371/journal.pgen.1009241>.

版本: 1.3.13
进口: 统计数据,,nnls公司
建议: 胡桃皮(≥ 1.3.9),测试那个,针织物,rmarkdown公司,R彩色啤酒
出版: 2021-08-25
作者: 亚历杭德罗·奥乔亚ORCID标识[aut,cre],约翰·D·斯托里ORCID标识[自动]
维护人员: 亚历杭德罗·奥乔亚(Alejandro Ochoa)
错误报告: https://github.com/StoreyLab/bnpsd/问题
许可证: GPL(≥3)
网址: https://github.com/StoreyLab/bnpsd/
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macOS二进制文件: r-prerel(arm64):bnpsd_1.3.13.tgz,r-release(arm64):bnpsd_1.3.13.tgz,r-oldrel(arm64):bnpsd_1.3.13.tgz,r-prerel(x86_64):bnpsd_1.3.13.tgz,r-release(x86_64):bnpsd_1.3.13.tgz
旧来源: bnpsd档案

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