netgsa:基于网络的基因集分析

通过结合有关基因间相互作用的外部信息以及从数据中学习到的新交互作用,进行基于网络的基因集分析。实施Shojaie A、Michailidis G(2010)中描述的方法<doi:10.1093/biomet/asq038>、Shojaie A、Michailidis G(2009)<doi:10.1089/cmb.2008.0081>和马J、肖杰伊A、米查利迪斯G(2016)<doi:10.1093/bioinformatics/btw410>.

版本: 4.0.5
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 注释Dbi,公司,数据表,数字播放器,基因过滤器,图表,石墨,格尔姆奈特,glasso快速,高温气冷堆,记录仪,马格里特,矩阵,msigdbr公司,组织Hs.eg.db,二次规划优化函数,随机对照组3,重新整形2,爱尔兰航空公司,卢比(≥ 1.0.2)
链接到: 卢比,Rcpp特征
建议: 针织物,MASS(质量),rmarkdown公司
出版: 2023-11-14
内政部: 10.32614/CRAN.包装.netgsa
作者: 迈克尔·赫尔斯特恩,Ali Shojaie[aut],京马[aut],坤岳[aut]
维护人员: 迈克尔·赫尔斯特恩(Michael Hellstern)<mikeh1 at uw.edu>
许可证: GPL(≥3)
网址: https://github.com/mikehellstern/netgsa网站
需要编译:
材料: 自述 新闻
在视图中: 组学
CRAN检查: netgsa结果

文档:

参考手册: netgsa.pdf格式
渐晕图: netgsa简介

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旧来源: netgsa存档

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