leidenAlg:通过R接口实现Leiden算法

Leiden算法的R接口,这是一种网络上的迭代社区检测算法。该算法被设计为收敛到一个分区,在该分区中,所有社区的所有子集都被局部最优分配,从而保证社区是连通的。该实现被证明是快速的、可扩展的,并且可以在数百万个节点的图上运行(只要它们可以容纳在内存中)。最初的实现是作为一个python接口“leidenalg”构建的,可以在这里找到:<https://github.com/vtraag/leidenalg>. 该算法最初在Traag,V.A.、Waltman,L.和van Eck,N.J.《从鲁汶到莱顿:保障良好连接的社区》中描述。科学代表9,5233(2019)<doi:10.1038/s41598-019-41695-z>.

版本: 1.1.3
取决于: R(≥3.5.0),矩阵
进口: 图形、gr设备、,记录仪,方法,并行,卢比(≥1.0.5),sccore公司,统计信息
链接到: 卢比,RcppArmadillo公司,RcppEigen基因
建议: pbapply(应用程序),测试那个(≥ 3.1.0)
出版: 2024-02-27
内政部: 10.32614/CRAN.包装.leidenAlg
作者: 彼得·哈尔琴科[aut],Viktor Petukhov〔aut〕,王一晨[aut],V.A.特拉格[ctb],加博尔·查尔迪,塔马斯·内普斯,Minh Van Nguyen[ctb],Evan Biederstedt[创作,创作]
维护人员: Evan Biederstedt在gmail.com>
错误报告: https://github.com/kharchenkolab/leidenAlg/issues
许可证: GPL-3公司
版权: 有关各种leidenAlg版权,请参阅文件COPYRIGHTS细节
leidenAlg版权详细信息
网址: https://github.com/kharchenkolab/leidenAlg
需要编译:
系统要求: GNU make(可选)、libxml2(可选)和glpk(>=4.57,可选)
材料: 自述文件
CRAN检查: leidenAlg结果

文档:

参考手册: 莱登阿尔格.pdf

下载内容:

包源: 莱登阿尔格_1.1.3.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:莱登阿尔格_1.1.3.zip,r版本:莱登阿尔格_1.1.3.zip,r-oldrel:莱登阿尔格_1.1.3.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):莱登阿尔格_1.1.3.tgz,r-oldrel(arm64):莱登阿尔格_1.1.3.tgz,r-release(x86_64):莱登阿尔格_1.1.3.tgz,r-oldrel(x86_64):莱登阿尔格_1.1.3.tgz
旧来源: leidenAlg档案

反向依赖关系:

反向进口: Banksy银行,科诺斯,里格

链接:

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