grandR:核苷酸转换测序数据的综合分析

核苷酸转换测序实验为RNA-seq和单细胞RNA-seq.增加了时间维度。这样的实验需要专门的工具进行初级处理,例如GRAND-SLAM,(参见“Jürges等人”<doi:10.1093/bioinformatics/bty256>)和专用工具下游分析。”grandR’为质量控制提供了一个全面的工具箱,动力学建模、差异基因表达分析和此类数据的可视化。

版本: 0.2.5
取决于: R(≥3.5.0)
进口: 统计数据,矩阵,拉朗,ggplot2,gr设备,拼凑,RCurl(RCurl),普利尔,平行,重塑2,MASS(质量),规模,奶牛场,最小包装.lm,线性调频,标记、方法、实用程序,数字派生
建议: 针织物,rmarkdown公司,绕圈子,修拉,复杂热图,gg排斥,DESeq2公司,S4载体,数据表,clusterProfiler(群集探查器),生物反应器,msigdbr公司,fgsea公司,遥控滑板,体积,DT公司,闪耀(shinyjs),闪耀的(shinyjqui),RColorBrewer公司,天然气液化,html工具,矩阵统计,单片眼镜,VGAM公司,quantreg公司、图形、,闪亮的,ggrastr公司,绿柱石,解算
出版: 2024-02-15
内政部: 10.32614/CRAN.包装.品牌
作者: 弗洛里安·埃哈德ORCID标识[aut,cre],Teresa Rummel[ctb],Lygeri Sakellaridi[ctb],凯文·伯格
维护人员: Florian Erhard<弗洛里安。埃哈德在informatik.uni-regensburg.de>
错误报告: https://github.com/erhard-lab/grandR/issues
许可证: Apache许可证(≥2)
网址: https://github.com/erhard-lab/grandR
需要编译:
引用: grandR引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: grandR结果

文档:

参考手册: grandR.pdf格式
渐晕图: 入门

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包源: grandR_0.2.5.tar.gz
Windows二进制文件: r-devel公司:grandR_0.2.5.zip,r版本:grandR_0.2.5.zip,r-oldrel:grandR_0.2.5.zip
macOS二进制文件: r释放(arm64):格兰德R_0.2.5.tgz,r-oldrel(arm64):格兰德R_0.2.5.tgz,r-release(x86_64):格兰德R_0.2.5.tgz,r-oldrel(x86_64):格兰德R_0.2.5.tgz
旧来源: grandR存档

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