glmmPen:高维惩罚广义线性混合模型(pGLMM)

适合高维惩罚广义线性混合模型使用蒙特卡洛期望条件最小化(MCECM)算法。该包的目的是在固定和广义线性混合模型的随机效应。该软件包支持使用标准链接拟合二项式、高斯和泊松数据,以及支持使用MCP、SCAD或LASSO惩罚进行惩罚。MCECM算法Rashid等人(2020年)对此进行了描述<doi:10.1080/01621459.2019.1671197>.程序的最小化部分(M步骤)中使用的技术如下源自“ncvreg”一揽子计划的程序(Breheny和Huang(2011)<doi:10.1214/10-AOAS388>)和“grpreg”包(Breheny和Huang(2015))<doi:10.1007/s11222-013-9424-2>),使用适当修改以说明随机效应。“ncvreg”和“grpreg”包也描述了MCP、SCAD、,和LASSO处罚。

版本: 1.5.4.4
取决于: lme4公司,大存储器,卢比(≥0.12.0),R(≥3.6.0)
进口: ggplot2,矩阵、方法、,ncvreg公司,重塑2,rstan公司(≥ 2.18.1),字符串,mvtnorm公司,MASS(质量),生存,甾醇,Rcpp并行(≥5.0.1)
链接到: 制动马力(≥ 1.66.0),大存储器,卢比(≥ 0.12.0),RcppArmadillo公司,RcppEigen基因(≥ 0.3.3.3.0),rstan公司(≥ 2.18.1),StanHeaders公司(≥2.18.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1)
建议: 测试那个,针织物,rmarkdown公司
出版: 2024-01-18
内政部: 10.32614/CRAN.包装.glmm钢笔
作者: 希拉里·海林,奈姆·拉希德[aut],李克峰[aut],约瑟夫·易卜拉欣
维护人员: 希拉里·海琳(Hillary Heiling)<hmheiling at gmail.com>
许可证: GPL-2型|GPL-3公司【扩展自:GPL(≥2)】
需要编译:
系统要求: GNU品牌
材料: 自述文件
CRAN检查: glmmPen结果

文档:

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