bakR：分析和比较核苷酸编码RNA序列数据集

核苷酸贝叶斯层次统计模型的几种实现记录RNA-seq实验（NR-seq；TimeLapse-seq、SLAM-seq和TUC-seq等）用于分析和比较NR-seq数据集（参见“Vock and Simon”（2023））<doi:10.1261/rna.079451.122>).NR-seq是RNA-seq的强大扩展，它提供了有关动力学的信息RNA代谢（例如，RNA降解速率常数），明显缺乏在标准RNA-seq数据中。统计模型最大限度地利用了这些高吞吐量通过跨转录本共享信息来显著提高数据集不确定性量化和增加统计能力。”bakR’最多包括此模型的有效实施用于保守的数据集初始调查。”bakR’还提供了使用概率编程语言的更强大的实现“Stan”从完整的后向分布中取样bakR’执行多次测试使用这些模型实现的输出调整统计推断帮助生物学家从背景中分离信号。自动可视化密钥的方法还提供了结果和检测批量效应。

版本：	1.0.1
取决于：	R（≥3.5.0）
进口：	呜呜声、方法、，卢比(≥ 0.12.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥ 2.26.0),甾醇(≥ 2.1.1),数字播放器,第三年，统计，马格里特,Hmisc公司,ggplot2,数据表
链接到：	伯克希尔哈撒韦(≥ 1.66.0),卢比(≥ 0.12.0),Rcpp特征(≥ 0.3.3.3.0),Rcpp并行(≥ 5.0.1),rstan公司(≥ 2.26.0),StanHeaders公司(≥2.26.0)
建议：	rmarkdown公司,针织物,设计2,情势图,Ckmeans.1d.dp,校正图
出版：	2024-01-13
内政部：	10.32614/CRAN.包装.bakR
作者：	艾萨克·沃克[自动，创建]
维护人员：	艾萨克·沃克（Isaac Vock）<Isaac.Vock at gmail.com>
错误报告：	https://github.com/simonlabcode/bakR/issues网站/
许可证：	麻省理工学院+文件许可证
网址：	https://simonlabcode.github.io/bakR/
需要编译：	对
系统要求：	GNU使C++17
材料：	自述 新闻
CRAN检查：	bakR结果

文档：

参考手册：	bakR.pdf格式
渐晕图：	差分合成器 辍学 Getting-Started开始 NSS公司 故障排除 bakR-Fn公司 bakR-快速启动

下载内容：

包源：	巴克R_1.0.1.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：bakR_1.0.1.zip包，r版本：bakR_1.0.1.zip包，r-oldrel：bakR_1.0.1.zip包
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：贝克R_1.0.1.tgz，r-oldrel（arm64）：贝克R_1.0.1.tgz，r-release（x86_64）：贝克R_1.0.1.tgz，r-oldrel（x86_64）：贝克R_1.0.1.tgz
旧来源：	bakR存档

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