Ckmeans.1d.dp:最优、快速和可重复的单变量聚类
快速、最优和可重复的加权单变量通过动态编程进行聚类。解决了四个问题,包括单变量k均值(Wang和Song,2011)<doi:10.32614/RJ-2011-015>(宋和忠2020)<doi:10.1093/bioinformatics/btaa613>,k中值,k段和多通道加权k均值。动态编程用于最小化簇内距离(加权)之和使用各自的指标。它在以下方面优于启发式聚类当存在多个集群时,效率和准确性显著。多通道加权k-means群多元单变量信号进入k个簇。辅助函数生成直方图适应数据中的模式。此软件包提供了一套功能强大的保证最优的单变量数据分析工具,效率和再现性,适用于临时峰值调用,空间和光谱数据。
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反向依赖关系:
反向取决于: |
GenomicOZone基因 |
反向进口: |
单元格条形码,集群HD,网格OnClusters,哈曼,kc平均值,OptCirClust公司,斑点,条纹,威特里克斯 |
反向建议: |
bakR(巴克尔),DiffXTables(DiffXTable),FunChisq公司,xgboost公司 |
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