Ckmeans.1d.dp:最优、快速和可重复的单变量聚类

快速、最优和可重复的加权单变量通过动态编程进行聚类。解决了四个问题,包括单变量k均值(Wang和Song,2011)<doi:10.32614/RJ-2011-015>(宋和忠2020)<doi:10.1093/bioinformatics/btaa613>,k中值,k段和多通道加权k均值。动态编程用于最小化簇内距离(加权)之和使用各自的指标。它在以下方面优于启发式聚类当存在多个集群时,效率和准确性显著。多通道加权k-means群多元单变量信号进入k个簇。辅助函数生成直方图适应数据中的模式。此软件包提供了一套功能强大的保证最优的单变量数据分析工具,效率和再现性,适用于临时峰值调用,空间和光谱数据。

版本: 4.3.5
进口: 卢比,Rdpack公司(≥ 0.6-1)
链接到: 卢比
建议: 测试那个,针织物,rmarkdown公司,RColorBrewer公司
出版: 2023-08-19
作者: 乔·宋ORCID标识[自动,cre],华中ORCID标识[aut],王海洲[aut]
维护人员: Joe Song<乔姆松在cs.nmsu.edu>
许可证: LGPL(≥3)
需要编译:
引用: Ckmeans.1d.dp引文信息
材料: 自述文件 新闻
CRAN检查: Ckmeans.d.dp结果

文档:

参考手册: Ckmeans.1d.dp.pdf公司
渐晕图: 教程:最优单变量聚类
注:聚类分析中的权重缩放
教程:自适应直方图与常规直方图

下载:

包源: Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tar.gz(捷克语)
Windows二进制文件: r-预发布:Ckmeans.1d.dp_4.3.5.zip码,r版本:Ckmeans.1d.dp_4.3.5.zip码,r-oldrel:Ckmeans.1d.dp_4.3.5.zip码
macOS二进制文件: r-prerel(arm64):Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tgz(捷克语),r-release(arm64):Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tgz(捷克语),r-oldrel(arm64):Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tgz(捷克语),r-prerel(x86_64):Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tgz(捷克语),r-release(x86_64):Ckmeans.1d.dp_4.3.5.tgz(捷克语)
旧来源: Ckmeans.1d.dp存档

反向依赖关系:

反向取决于: GenomicOZone基因
反向进口: 单元格条形码,集群HD,网格OnClusters,哈曼,kc平均值,OptCirClust公司,斑点,条纹,威特里克斯
反向建议: bakR(巴克尔),DiffXTables(DiffXTable),FunChisq公司,xgboost公司

链接:

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