aphid：轮廓隐马尔可夫模型分析

设计用于开发和应用用于生物序列分析的隐马尔可夫模型和轮廓HMM。包含用于多重和成对序列对齐的函数，模型构建和参数优化、文件导入/导出、，前向、后向和Viterbi算法的实现条件序列概率，基于树的序列加权，和序列模拟。具有多种潜在应用，包括数据库搜索、基因发现和注释、系统发育分析和序列分类。基于Durbin etal（1998年，国际标准图书编号：9780521629713）。

版本：	1.3.5
取决于：	R（≥3.0.0）
进口：	绘图，开放SSL,公里(≥ 1.0.0),卢比（≥0.12.5），统计
链接到：	卢比
建议：	猿(≥ 4.0),针织物,qpdf格式,rmarkdown公司,测试那个
出版：	2022-12-05
作者：	肖恩·威尔金森[aut，cre]
维护人员：	肖恩·威尔金森
错误报告：	https://github.com/shaunpwilkinson/aphid/issues
许可证：	GPL-3公司
网址：	https://github.com/shaunpvilkinson/aphid
需要编译：	对
系统要求：	GNU品牌
引用：	蚜虫引文信息
材料：	自述
在视图中：	系统发育学
CRAN检查：	蚜虫结果

文档：

参考手册：	aphid.pdf格式
渐晕图：	蚜虫包装简介

下载内容：

包源：	蚜虫_1.3.5.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：aphid_1.3.5.zip，r-释放：aphid_1.3.5.zip，r-oldrel：aphid_1.3.5.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：蚜虫-1.3.5.tgz，r-oldrel（arm64）：蚜虫-1.3.5.tgz，r-版本（x86_64）：蚜虫-1.3.5.tgz，r-oldrel（x86_64）：蚜虫-1.3.5.tgz
旧来源：	蚜虫档案

反向依赖关系：

反向进口：

线圈,德巴,昆虫

链接：

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