coil:COI-5P条码数据的上下文化和评估
专为细胞色素c的清洁、上下文化和评估而设计氧化酶I DNA条形码数据(COI-5P,或COI的五个质数部分)。它包含用于将COI-5P条形码序列放入公共读取框的功能,将DNA序列转换为氨基酸并评估给定的条形码序列包含插入或删除错误。错误评估依赖于输入序列与核苷酸和氨基酸图谱的比较隐马尔可夫模型(PHMMs)(详见Durbin等人1998,ISBN:9780521629713)训练分类上不同的参考序列集。功能如下作为一条完整的管道提供,也可单独提供,以实现高效和有针对性地分析条形码数据。
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