阿拉卡扎姆：免疫球蛋白克隆世系和多样性分析

提供高通量自适应免疫方法受体序列测定（AIRR-Seq；Rep-Seq）分析。在特别是免疫球蛋白（Ig）序列谱系重建，谱系拓扑分析、多样性分析、氨基酸性质分析和基因使用。引文：Gupta和Vander Heiden等人（2017年）<doi:10.1093/bioinformatics/btv359>,Stern、Yaari和Vander Heiden等人（2014）<doi:10.1126/scitranslmed.3008879>.

版本：	1.3.0
取决于：	R（≥4.0），ggplot2(≥ 3.4.0)
进口：	空气调节器（≥1.4.1），猿，数字播放器（≥1.0），图形，网格，记录仪(≥ 1.5.0),矩阵（≥1.3-0），方法，进步，卢比(≥0.12.12),阅读器，爱尔兰航空公司，规模，顺序，统计，斯特林吉，易怒的，第三年（≥1.0），实用程序，生物串(≥ 2.56.0),基因组比对(≥ 1.24.0),I范围(≥ 2.22.2)
链接到：	卢比
建议：	针织物，rmarkdown公司，测试那个
出版：	2023-09-30
作者：	苏珊娜·马尔克斯，纳米塔·古普塔[aut]，尼马·努里[aut]，姜若义[aut]，朱利安·周[aut]，肯尼思·霍恩，丹尼尔·加达拉·马里亚，Edel Aron[ctb]，科尔·延森，杰森·范德·海登，史蒂文·克莱恩斯坦
维护人员：	苏珊娜·马尔克斯（Susanna Marquez）<Susanna.Marquez at yale.edu>
错误报告：	https://bitbucket.org/kleinstein/alakazam/issues网站
许可证：	AGPL-3型
网址：	https://alakazam.readthedocs.io/
需要编译：	对
引用：	阿拉卡扎姆引文信息
材料：	自述文件 新闻
在视图中：	组学
CRAN检查：	阿拉卡扎姆结果

文档：

参考手册：	alakazam.pdf格式
渐晕图：	氨基酸性质分析 多样性分析 Fastq公司 文件输入和输出 基因使用分析 世系重建 拓扑分析

下载内容：

包源：	阿拉卡扎姆-1.3.0.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：阿拉卡扎姆-1.3.0.zip，r版本：阿拉卡扎姆-1.3.0.zip，r-oldrel：阿拉卡扎姆-1.3.0.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：阿拉卡扎姆-1.3.0.tgz，r-oldrel（arm64）：阿拉卡扎姆-1.3.0.tgz，r-release（x86_64）：阿拉卡扎姆-1.3.0.tgz，r-oldrel（x86_64）：阿拉卡扎姆-1.3.0.tgz
旧来源：	阿拉卡扎姆档案

反向依赖关系：

反向进口：

嫁妆，ogrdbstats公司，范围界定者，沙扎姆，老虎，UniprotR公司

链接：

请使用规范形式https://CRAN.R-project.org/package=alakazam链接到此页面。