MiRKAT：基于微生物组回归的内核关联测试

微生物组分数据之间的总体关联测试通过系统发育核进行表型分析。表型可以是单变量的连续或二进制（Zhao等人（2015））<doi:10.1016/j.ajhg.2015.04.003>), 生存结果（Plantinga等人（2017年）<doi:10.1186/s40168-017-0239-9>), 多元（Zhan等人（2017））<doi:10.1002/gepi.22030>)和结构化表型（Zhan等人（2017））<doi:10.1111/biom.12684>). 该软件包还可以使用稳健回归（未发布的工作）和积分分位数回归（Wang等人（2021）<doi:10.1093/bioinformatics/btab668>). 在每种情况下，微生物组群落效应都是非框架建模的通过一个核函数，它可以合并系统发育树信息。

版本：	1.2.3
取决于：	R（≥3.1.0）
进口：	MASS（质量）,CompQuadForm格式,quantreg公司,GUniFrac公司,皮尔逊DS,lme4公司,矩阵,置换,混合工具,生存，统计信息
建议：	针织物,素食主义者,rmarkdown公司,马格里特,kableExtra（额外）
出版：	2023-02-17
内政部：	10.32614/CRAN.包装。MiRKAT公司
作者：	安娜·普兰廷加[aut，cre]，尼希米·威尔逊〔aut，ctb〕，郑浩天[aut，ctb]，王天英[aut，ctb]，向战[aut，ctb]，Michael Wu[aut]，倪照[aut，ctb]，Jun Chen[作者]
维护人员：	安娜·普兰廷加（Anna Plantinga）<amp9 at williams.edu>
许可证：	GPL-2基因|GPL-3公司[扩展自：GPL（≥2）]
需要编译：	不
CRAN检查：	MiRKAT结果

文档：

参考手册：	MiRKAT.pdf
渐晕图：	MiRKAT包小品

下载内容：

包源：	MiRKAT_1.2.3.tar.gz公司
Windows二进制文件：	r-devel公司：MiRKAT_1.2.3.zip拉链，r版本：MiRKAT_1.2.3.zip拉链，r-oldrel：MiRKAT_1.2.3.zip拉链
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：MiRKAT_1.2.3.tgz公司，r-oldrel（arm64）：MiRKAT_1.2.3.tgz公司，r-release（x86_64）：MiRKAT_1.2.3.tgz公司，r-oldrel（x86_64）：MiRKAT_1.2.3.tgz公司
旧来源：	MiRKAT存档

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