LDM:使用线性检验微生物组的假设分解模型

一个单一的分析路径,包括基于距离的排序、微生物组任何影响的全局测试,以及通过假发现率(FDR)控制测试单个分类群的影响。它既容纳了连续协变量和离散协变量,也容纳了单独或组合测试的交互项,允许调整混杂协变量,并使用可以控制样本相关性的基于排列的p值。它可以应用于转换后的数据,综合测试可以结合在不同转换尺度上进行的分析的结果。它还可以用于测试基于无限数量稀疏复制的存在-缺失关联,测试微生物组的中介效应,分析删减的时间-事件结果,以及通过将线性模型拟合到中心长比率分类数数据进行成分分析。

版本: 6.0.1
取决于: R(≥3.5.0)
进口: GUniFrac公司,素食主义者,排列,平行,生物并行,矩阵统计,脚轮,潘戈恩,最温和的
建议: R.rsp公司,测试那个,生存
出版: 2023-09-07
内政部: 10.32614/CRAN.包装。LDM公司
作者: 胡一娟[aut,cre],格伦·萨顿
维护人员: 胡一娟<yijuan.Hu at emory.edu>
错误报告: https://github.com/yijuanhu/LDM/issues
许可证: GPL-2型|GPL-3型[扩展自:GPL(≥2)]
网址: https://github.com/yijuanhu/LDM网站
需要编译:
CRAN检查: LDM结果

文档:

参考手册: LDM.pdf格式
渐晕图: R包:LDM

下载内容:

包源: LDM_6.0.1.tar.gz公司
Windows二进制文件: r-devel公司:LDM_6.0.1.zip文件,r版本:LDM_6.0.1.zip文件,r-oldrel:LDM_6.0.1.zip文件
macOS二进制文件: r释放(arm64):LDM_6.0.1.tgz公司,r-oldrel(arm64):LDM_6.0.1.tgz,r-release(x86_64):LDM_6.0.1.tgz公司,r-oldrel(x86_64):LDM_6.0.1.tgz公司
旧来源: LDM存档

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