对包含数百万个提示的大规模系统发育进行有效的系统发育分析。功能包括修剪、重新植树、计算最新的共同祖先、计算距树根的距离和计算成对距离。计算系统发育信号和平均特征深度(特征保守性),离散性状的祖先状态重建和隐藏特征预测,特征进化的模拟和拟合模型,拟合和模拟多样性模型,年代树,比较树,以及Newick格式的读写树。引文:Louca、Stilianos和Doebeli,Michael(2017)<doi:10.1093/bioinformatics/btx701>.
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