CRMetrics:Cell Ranger输出筛选和度量可视化

Grace X.Y.Zheng等人的样本和细胞过滤以及“细胞游骑兵”输出指标的可视化（2017）<doi:10.1038/ncomms14049>. 'CRMetrics“允许轻松绘制多个样本的输出指标以及比较图，包括这些的统计评估。”《CRMetrics》允许使用Matthew D Young和Sam Behjati的“SoupX”轻松去除环境RNA（2020年）<doi:10.1093/gigascience/gia151>或Stephen J Fleming等人的《CellBender》（2022年）<doi:10.1101/791699>. 此外，Nikolas Barkas等人（2021年）还可以使用“Pagoda2”预处理数据<https://github.com/kharchenkolab/pagoda2>或Yuhan Hao等人（2021）的《修拉》<doi:10.1016/j.cell.2021.04.048>随后，Nikolas Barkas等人（2019年）使用“Conos”嵌入细胞<doi:10.1038/s41592-019-0466-z>. 最后，Samuel L.Wolock等人（2019）使用“scrublet”可以检测到双重<doi:10.1016/j.cels.2018.11.005>或Gayoso等人（2020年）的“双重检测”<doi:10.5281/zenodo.2678041>. 最后，根据用户输入对单元格进行过滤，以便在下游应用程序中使用。

版本：	0.3.0
取决于：	R（≥4.0.0）
进口：	奶牛场,数字播放器,蜂群,ggplot2,ggpmisc公司,ggpubr公司,gg排斥,马格里特,矩阵、方法、，R6级,规模,sccore公司,稀疏矩阵统计，统计，易怒的,第三年，实用程序
建议：	科诺斯,数据表,降价,宝塔2,网状的,rhdf5型,修拉,SoupX系列,测试那个(≥ 3.0.0)
出版：	2023-09-01
内政部：	10.32614/CRAN.包装。CR指标
作者：	拉斯穆斯·里德比克[aut，cre]，Fabienne踢[aut]，亨丽埃塔·霍尔泽[aut]，西安新银行
维护人员：	Rasmus Rydbirk<在bmb.sdu.dk>
错误报告：	https://github.com/khodosevichab/CRMetrics/issues
许可证：	GPL-3公司
网址：	https://github.com/khodosevichab/CRMetrics网站
需要编译：	不
材料：	自述文件 新闻
CRAN检查：	CRMetrics结果 [问题需要在2024-09-30年之前解决]

文档：

参考手册：

CRMetrics.pdf

下载内容：

包源：	CR度量_0.3.0.tar.gz
Windows二进制文件：	r-devel公司：CR度量值_0.3.0.zip，r版本：CR度量值_0.3.0.zip，r-oldrel：CR度量_0.3.0.zip
macOS二进制文件：	r释放（arm64）：CR度量=0.3.0.tgz，r-oldrel（arm64）：CR度量=0.3.0.tgz，r-release（x86_64）：CR度量=0.3.0.tgz，r-oldrel（x86_64）：CR度量=0.3.0.tgz
旧来源：	CRMetrics存档

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