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人血红素加氧酶与胆绿素配合物的晶体结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.19 Å
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文学类

胆绿素与人血红素加氧酶-1配合物的晶体结构

拉德·L。J.弗里德曼。李,H。巴斯卡,B。Ortiz De Montellano,P.R.公司。普洛斯,T.L。

(2004)生物化学43: 3793-3801

  • 内政部:https://doi.org/10.1021/bi035451l
  • 相关结构的主要引文:
    1S8C公司

  • PubMed摘要:

    血红素加氧酶将血红素氧化分解为胆绿素,通过血红素作为辅因子和底物参与的过程释放铁和CO。在这里,我们报告了产品无铁胆绿素在2.19 a时与人HO-1配合物中的晶体结构。人胆绿素-HO-1结构与其血红素复合物的结构比较,以及最近发表的大鼠HO-1结构与胆绿素铁螯合物的复合物结构比较【Sugishima,M.,Sakamoto,H.,Higashimoto,Y.,Noguchi,M.和Fukuyama,K.(2003)《生物化学杂志》278,32352-32358】显示了两个主要差异。首先,在活性部位缺乏Fe-His键和溶剂结构的情况下,远端和近端螺旋松弛并采用“开放”构象,这很可能会鼓励胆绿素释放。第二,无铁胆绿素相对于血红素和胆绿素铁络合物占据不同的位置和方向。胆绿素采用更线性的构象,从血红素部位移动到内腔。这些结构结果提供了对HO-1催化中速率限制步骤的深入了解,即产物胆绿素释放。


  • 组织附属关系

    美国加州大学欧文分校分子生物学和生物化学系,高分子结构项目,邮编92697-3900。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
血红素加氧酶1233智人突变: 0 
基因名称:HMOX1型HO1公司总公司
欧盟委员会:1.14.99.3
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质P09601 (智人)
探索P09601号 
转到UniProtKB:P09601号
PHAROS公司:P09601号
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序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团P09601
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实验数据与验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.19 Å
  • R值自由:0.280 
  • R值工作:0.240 
  • 空间组:第12页11
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=77.413α = 90
b=56.461β = 100.39
c=109.751γ = 90
软件包:
软件名称目的
HKL-2000数据收集
电子秤组件数据缩放
MOLREP公司定相
中枢神经系统精炼
HKL-2000数据缩减

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