Radiogenomics Profiling for Glioblastoma-related Immune Cells Reveals CD49d Expression Correlation with MRI parameters and Prognosis

doi:10.1038/s41598-018-34242-9

.2018年10月30日；8(1):16022.

doi:10.1038/s41598-018-34242-9。

胶质母细胞瘤相关免疫细胞的放射基因组分析揭示CD49d表达与MRI参数和预后的相关性

Hye Rim Cho公司^1 2, Hyejin Jeon公司^1 2, 楚基公园³, Sung-Hye公园⁴, Seung Hong Choi先生^5 6

附属公司

¹韩国首尔国立大学医院放射科。
²韩国首尔基础科学研究所纳米颗粒研究中心。
³韩国首尔国立大学医院神经外科。
⁴韩国首尔国立大学医院病理科。
⁵韩国首尔国立大学医院放射科。verocay@snuh.org。
⁶韩国首尔基础科学研究所纳米颗粒研究中心。verocay@snuh.org。

PMID： 30375429
预防性维修识别码： PMC6207678型
内政部： 10.1038/s41598-018-34242-9

胶质母细胞瘤相关免疫细胞的放射基因组学图谱揭示CD49d表达与MRI参数和预后的相关性

Hye Rim Cho公司等。科学代表. 2018.

.2018年10月30日；8(1):16022.

doi:10.1038/s41598-018-34242-9。

作者

Hye Rim Cho公司^1 2, Hyejin Jeon公司^1 2, 楚基公园³, Sung-Hye公园⁴, Seung Hong Choi先生^5 6

附属公司

¹韩国首尔国立大学医院放射科。
²韩国首尔基础科学研究所纳米颗粒研究中心。
³韩国首尔国立大学医院神经外科。
⁴韩国首尔国立大学医院病理科。
⁵韩国首尔国立大学医院放射科。verocay@snuh.org。
⁶韩国首尔基础科学研究所纳米颗粒研究中心。verocay@snuh.org。

PMID： 30375429
预防性维修识别码： PMC6207678型
内政部： 10.1038/s41598-018-34242-9

摘要

尽管已有大量与胶质母细胞瘤（GBM）相关的放射基因组学研究，但大多数研究仅使用肿瘤细胞的基因组信息。在这项研究中，我们使用放射基因组分析来确定GBM中MRI相关免疫细胞标记物，这也与预后相关。在总共60例GBM患者中，免疫细胞标记物的表达水平与定量MRI参数相关。选择14个免疫细胞标记物（即骨髓细胞的CD11b、CD68、CSF1R、CD163、CD33、CD123、CD83、CD63、CD49d和CD117，淋巴细胞的CD4、CD3e、CD25和CD8）进行定量RT-PCR的RNA水平分析。对于MRI分析，使用FLAIR、增强T1WI、动态磁化率对比灌注MRI和扩散加权图像的定量MRI参数。此外，通过Kaplan-Meier生存分析进行了与有趣的mRNA数据相关的PFS。标记肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞（TAM）的CD163在GBM患者中表现出最高表达水平。CD68（TAM）、CSF1R（TAMs）、CD33（髓源性抑制细胞）和CD4（辅助性T细胞、调节性T细胞）水平与nCBV值高度正相关，而CD3e（辅助性T细胞、细胞毒性T细胞）和CD49d与表观扩散系数（ADC）值显著负相关。此外，无论任何其他分子特征如何，Cox比例风险回归分析显示CD49d是GBM患者PFS的一个独立因素（P=0.0002）。CD49d表达水平与ADC相关的CD49d可被视为预测GBM患者进展的候选生物标志物。

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数字

图1
说明每个患者的年龄、性别、肿瘤位置、遗传信息和免疫细胞标记物的标准化RNA表达水平。

图2
MRI参数与免疫细胞标记物的相关性说明(A类)和代表性案例(B类). (A类)病例1和病例2分别显示CD68、CSF1R、CD33和CD4的高表达和低表达，与nCBV值显著相关。在病例3和病例4中，CD33、CD123、CD49d和CD3e的高表达和低表达水平与ADC值显著相关。

图3
根据CD49d表达水平对PFS的Kaplan-Meier估计(A类和B类)和代表性案例(C类). CD49d低表达（≤170）的GBM患者的PFS显著长于CD49d高表达（>170）的患者(A类)，与IDH1突变状态无关(B类). 在所有患者中，CD49d低表达和高表达肿瘤的PFS存在显著差异（中位数为25.1[95%CI，12.3-25.1]vs 7.5[95%CI3.5-10.6]个月；*P（P）* = 0.0002，log-rank测试）。IDH1野生型GBM患者在CD49d低表达和高表达肿瘤之间的PFS也有显著差异（中位数为18.7[95%可信区间，11.0-18.7]vs 7.5[95%可信域，3.5-12.3]个月；*P（P）* = 0.0025，对数库测试）。在IDH1突变型GBM患者中，CD49d低表达和高表达肿瘤的PFS也存在显著差异（中位数为25.1[95%可信区间，11.7-25.1]vs 3个月；*P（P）* = 0.0047，对数库测试）。(C类)病例1和病例2分别显示CD49d的高表达和低表达水平，这与基于FLARI和CE T1WI的ADC平均值以及CE T1W上的肿瘤体积呈负相关。(天)CD49d的免疫组织化学结果与CD49d RNA表达水平相关。（胶质纤维酸性蛋白：GFP，CD49d:RFP，细胞核：DAPI）。

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