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2010年7月;10(4):723-7.
doi:10.1111/j.1755-0998.2010.02832.x。 Epub 2010年2月2日。

msABC:修改Hudson的ms以促进多位点ABC分析

附属公司

msABC:修改Hudson的ms以促进多位点ABC分析

P帕夫利迪斯等人。 摩尔生态资源 2010年7月

摘要

有了全基因组序列数据的可用性,生物学家能够检验关于种群人口学的假设。此外,近似贝叶斯计算(ABC)方法的进步允许使用汇总统计在简单的框架中进行人口统计推断。我们在这里介绍了msABC,这是一个基于聚合的软件,有助于模拟多位点数据,适用于ABC分析。msABC基于Hudson的ms算法,该算法广泛用于模拟人口的中性人口历史。原始算法的灵活性得到了扩展,因此样本大小可能因基因座而异,缺失数据可以纳入模拟和计算中,并且生成了单个或多个种群的大量汇总统计数据。msABC的源代码位于http://bio.lmu.de/~pavlidis/msabc或根据作者的要求。

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