The computer program LUDI: a new method for the de novo design of enzyme inhibitors

doi:10.1007/BF00124387

.1992年2月；6(1):61-78.

doi:10.1007/BF00124387。

计算机程序LUDI：酶抑制剂从头设计的新方法

H Jöhm先生¹

附属公司

PMID： 1583540
内政部： 2007年10月10日/BF00124387

计算机程序LUDI：酶抑制剂从头设计的新方法

H Jöhm先生. J计算机辅助模具设计. 1992年2月.

.1992年2月；6(1):61-78.

doi:10.1007/BF00124387。

作者

H Jöhm先生¹

附属

¹德国路德维希港中央研究中心BASF AG。

PMID： 1583540
内政部： 2007年10月10日/BF00124387

摘要

本文描述了一种新的计算机程序，该程序将小分子定位到蛋白质结构的裂缝中（例如酶的活性部位），从而可以与酶形成氢键，疏水囊中充满疏水基团。该程序分为三个步骤。首先，它计算相互作用位点，它们是空间中适合形成氢键或填充疏水口袋的离散位置。交互位点来源于通过剑桥结构数据库搜索生成的非结合接触分布。生成交互站点的另一种方法是使用规则。第二步是将分子片段匹配到相互作用位点。目前，我们使用了一个包含600个碎片的库来进行装配。本程序的最后一步是将部分或全部拟合片段连接到单个分子。这是由桥碎片完成的。介绍了苯甲酸、二氢叶酸还原酶和胰蛋白酶的晶体包装应用。

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[1] J计算机辅助模具设计。1987年10月；1(3):197-210-公共医学

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[9] 医学化学杂志。1988年4月；31(4):722-9-公共医学

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