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Entrez编程实用程序帮助[Internet]。贝塞斯达（医学博士）：美国国家生物技术信息中心；2010-.

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Entrez编程实用程序帮助[Internet]。

显示详细信息

深度电子工具：参数、语法和更多

，博士。

作者信息和附属机构

创建：; 上次更新时间：2022年11月30日.

预计阅读时间：20分钟

介绍

本章作为E-utilities支持的所有参数的参考，以及可接受的值和使用指南。以下各节提供了每个E-utility的信息，并在各节中讨论了特定数据库的参数和/或值。除了扩展工具功能的几个附加可选参数外，大多数E-utilities都有一组调用所需的参数。这两组参数在每一节中分别讨论。

一般使用指南

请参阅第2章有关E-utility使用策略的详细讨论。以下两个参数应包含在所有E-utility请求中。

工具

进行E-utility调用的应用程序的名称。值必须是没有内部空格的字符串。

电子邮件

E-utility用户的电子邮件地址。值必须是没有内部空格的字符串，并且应该是有效的电子邮件地址。

如果您希望从单个IP地址每秒发送3个以上的E-utility请求，请考虑包含以下参数：

api密钥

每秒发布3个以上请求的站点的API密钥的值。请参阅第2章以充分讨论这项政策。

电子公用事业DTD

除了EFetch之外，电子实用程序都会生成一个XML输出格式，该格式符合特定于该实用程序的DTD。E-utility返回的XML标题中提供了这些DTD的链接。

ESummary 2.0版为每个Entrez数据库生成唯一的XML DocSum，因此每个Entrex数据库都有一个用于2.0版DocSums的唯一DTD。2.0版XML中提供了指向这些DTD的链接。

EFetch以多种格式生成输出，其中一些是XML。大多数XML格式也符合特定于相关Entrez数据库的DTD或模式。请点击以下PubMed DTD的相应链接：

EInfo（电子信息系统）

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/einfo.fcgi

功能

  • 提供所有有效Entrez数据库的名称列表
  • 提供单个数据库的统计信息，包括索引字段和可用链接名称的列表

所需参数

没有。如果没有数据库参数，einfo将返回所有有效Entrez数据库的名称列表。

可选参数

数据库

收集统计信息的目标数据库。值必须是有效的Entrez数据库名称.

版本

用于指定2.0版EInfo XML。唯一支持的值是“2.0”。如果存在，EInfo将返回包含两个新字段的XML：<IsTruncatable>和<IsRangeable>。可截断的字段允许在术语中使用通配符“*”。通配符将展开以匹配任何一组字符，最多可以有600个唯一展开。可设置范围的字段允许将范围运算符“：”置于所需范围的下限和上限之间（例如2008:2010[pdat]）。

重新调制

检索类型。确定返回输出的格式。EInfo xml的默认值为“xml”，但也支持“json”以json格式返回输出。

示例

返回所有Entrez数据库名称的列表：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/einfo.fcgi

Entrez Protein返回2.0版统计信息：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/einfo.fcgi？db=protein&version=2.0

E搜索

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi

功能

  • 提供与文本查询匹配的UID列表
  • 在历史记录服务器上发布搜索结果
  • 从历史服务器上存储的数据集下载所有UID
  • 组合或限制存储在历史服务器上的UID数据集
  • 对UID集进行排序

API用户应该知道，一些NCBI产品包含搜索工具，这些工具可以通过web界面上的搜索生成ESearch无法使用的内容。例如，PubMed web界面（PubMed.ncbi.nlm.nih.gov）包含只有通过该界面才能使用的引文匹配和拼写更正工具。请参阅下面的ECitMatch和ESpell以了解API等效项。

所需参数

数据库

要搜索的数据库。值必须是有效的Entrez数据库名称（默认设置为pubmed）。

学期

Entrez文本查询。所有特殊字符都必须经过URL编码。空格可以替换为“+”符号。对于很长的查询（长度超过数百个字符），请考虑使用HTTP POST调用。请参阅公共医学或Entrez公司有关搜索字段描述和标记的信息的帮助。搜索字段和标记特定于数据库。

esearch.fcgi？db=pubmed&term=哮喘

PubMed还提供“邻近搜索“对于在[标题]或[标题/摘要]字段中以任意顺序出现在指定字数内的多个术语。

esearch.fcgi？db=pubmed&term=“哮喘治疗”[标题：~3]

可选参数–历史服务器

使用历史记录

什么时候？使用历史记录设置为“y”时，ESearch将把搜索操作产生的UID发布到历史服务器上，以便可以在随后的E-utility调用中直接使用。也，使用历史记录必须设置为“y”，ESearch才能解释中包含的查询键值学期或接受网络环境作为输入。

网络环境

从以前的ESearch、EPost或ELink调用返回的Web环境字符串。提供后，ESearch会将搜索操作的结果发布到这个预先存在的WebEnv，从而将结果附加到现有环境中。此外，提供网络环境允许在中使用查询键学期以便可以组合或限制以前的搜索集。如上所述，如果网络环境使用，使用历史记录必须设置为“y”。

esearch.fcgi？db=pubmed&term=哮喘&WebEnv=<WebEnv string>&usehistory=y

查询键

前一个ESearch、EPost或ELink调用返回的整数查询键。如果提供，ESearch将查找由查询键和中查询检索到的集合学期（即用AND连接两者）。对于查询键功能，网络环境必须分配现有WebEnv字符串，并且使用历史记录必须设置为“y”。

查询键的值也可以在中提供学期如果它们前面有一个“#”（URL中的%23）。虽然只有一个查询键参数可以提供给ESearch，可以在中组合任意数量的查询键学期。此外，如果在中提供了查询键学期，除了AND之外，它们还可以与OR或NOT组合。

以下两个URL在功能上等效：

esearch.fcgi？db=pubmed&term=哮喘&query_key=1&WebEnv=
<webenv string>&usehistory=y

esearch.fcgi？db=pubmed&term=%231+AND+哮喘和WebEnv=
<webenv string>&usehistory=y

可选参数–检索

重新启动

要在XML输出中显示的检索集的第一个UID的顺序索引（默认值=0，对应于整个集的第一条记录）。此参数可以与retmax（最大值）下载从搜索中检索到的任意UID子集。

retmax（最大值）

要在XML输出中显示的检索集的UID总数（默认值=20）。默认情况下，ESearch只包括XML输出中检索到的前20个UID。如果使用历史记录设置为“y”，则检索集的其余部分将存储在历史服务器上；否则这些UID将丢失。增加的retmax（最大值）允许在XML输出中包含更多检索到的UID，最多可以包含10000条记录。

要从PubMed以外的数据库检索10000多个UID，请提交多个搜索请求，同时增加重新启动（见应用3）。对于PubMed，ESearch只能检索与查询匹配的前10000条记录。要获得10000多条PubMed记录，请考虑使用包含附加逻辑的<EDirect>自动批处理PubMeds搜索结果，以便检索任意数字。

翻新

检索类型。ESearch有两个允许的值：“uilist”（默认），它显示标准XML输出；“count”，它只显示<count>标记。

重新调制

检索类型。确定返回输出的格式。ESearch xml的默认值为“xml”，但也支持“json”以json格式返回输出。

分类

指定用于对ESearch输出中的UID进行排序的方法。可用值因数据库而异(数据库)可以在Entrez搜索结果页面的“显示设置”菜单中找到。如果使用历史记录设置为“y”时，UID将按指定的排序顺序加载到历史服务器上，并将按该顺序由ESummary或EFetch检索。示例值包括Gene的“相关性”和“名称”。用户应该知道分类不同的数据库会有所不同，并且ESearch对给定数据库使用的默认值可能与NCBI web搜索页面上使用的值不同。

的值分类PubMed如下：

  • 发布_日期–按发布日期降序排序
  • 作者–按第一作者升序排序
  • 日志名称–按日记帐名称升序排序
  • 关联–web PubMed上的默认排序顺序（“最佳匹配”）

领域

搜索字段。如果使用，整个搜索项将仅限于指定的Entrez字段。以下两个URL是等效的：

esearch.fcgi？db=pubmed&term=哮喘&field=标题

esearch.fcgi？db=pubmed&term=哮喘[标题]

ID类型

指定序列数据库（nuccore、popset、protein）要返回的标识符类型。默认情况下，ESearch在其输出中返回GI编号。如果ID类型设置为“acc”，则ESearch将返回accession.version标识符，而不是GI编号。

可选参数–日期

日期类型

用于限制搜索的日期类型。允许的值在Entrez数据库之间有所不同，但常用值为“mdat”（修改日期）、“pdat”（发布日期）和“edat”（Entrez日期）。通常，Entrez数据库只有两个允许的值日期类型.

重新日期

什么时候？重新日期设置为整数n个，搜索只返回具有指定日期的项目日期类型在最后n个天。

正念，maxdate

用于按指定日期限制搜索结果的日期范围日期类型.这两个参数(正念，maxdate)必须一起使用以指定任意日期范围。一般日期格式为YYYY/MM/DD，也允许使用这些变体：YYYY、YYYY/MM。

示例

使用术语在PubMed中搜索癌症对于过去60天内有Entrez日期的摘要；检索前100个PMID和翻译；将结果发布到历史服务器上并返回网络环境和查询键:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=pubmed&term=cancer&reldate=60&datetype=edat&retmax=100&usehistory=y

在PubMed中搜索PNAS期刊第97卷，检索六个PMID，从列表中的第七个PMID开始：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=pubmed&term=PNAS[ta]+AND+97[vi]&retstart=6&retmax=6&tool=biomed3

在NLM目录中搜索与术语匹配的日记账产科:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=nlmcatalog&term=产科+AND+ncbijournals[过滤器]

在PubMed Central中搜索包含查询的免费全文文章干细胞:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=pmc&term=stem+单元格+与+自由+全文[筛选]

在核苷酸中搜索所有tRNA：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=nucleotide&term=biomol+trna[道具]

在蛋白质中搜索分子量范围：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esearch.fcgi？db=protein&term=70000:90000[分子+重量]

E支柱

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/epost.fcgi

功能

  • 将UID列表上载到Entrez History服务器
  • 将UID列表附加到附加到Web环境的现有UID列表集

所需参数

数据库

输入列表中包含UID的数据库。该值必须是有效的Entrez数据库名称（默认设置为pubmed）。

身份证件

UID列表。可以提供单个UID或以逗号分隔的UID列表。所有UID必须来自指定的数据库数据库对于PubMed，单个URL请求中最多可以包含10000个UID。对于其他数据库，可以传递到epost的UID数量没有设置最大值，但如果要发布的UID超过200个，则应使用HTTP POST方法发出请求。

对于序列数据库（nuccore、popset、protein），UID列表可能是GI编号和附加版本标识符的混合列表。注：使用accession.version标识符时，会发生一个转换步骤，导致大量标识符超时，即使在使用POST时也是如此。因此，我们建议以大约500个UID或更少的大小对这些类型的请求进行批处理，以避免从原始POST输入列表中仅检索部分记录。

epost.fcgi？db=pubmed&id=193930383024220829453458
epost.fcgi？db=蛋白质&id=15718680，NP_001098858.1号,119703751

可选参数

网络环境

Web环境。如果提供，此参数指定将接收通过post发送的UID列表的Web环境。EPost将创建与该Web环境关联的新查询键。通常，此WebEnv值是从以前的ESearch、EPost或ELink调用的输出中获得的。如果没有网络环境参数，EPost将创建一个新的Web环境并将UID列表发布到查询键1

epost.fcgi？db=蛋白质&id=15718680157427902119703751&WebEnv=
<webenv字符串>

E摘要

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/esummary.fcgi

功能

  • 返回输入UID列表的文档摘要（DocSums）
  • 返回存储在Entrez History服务器上的一组UID的DocSums

所需参数

数据库

从中检索DocSum的数据库。该值必须是有效的Entrez数据库名称（默认设置为pubmed）。

必需参数–仅当输入来自UID列表时使用

身份证件

UID列表。可以提供单个UID或以逗号分隔的UID列表。所有UID必须来自指定的数据库数据库。对于可以传递给ESummary的UID数量没有设置最大值，但如果要提供大约200个UID，则应使用HTTP POST方法发出请求。

对于序列数据库（nuccore、popset、protein），UID列表可能是GI编号和附加版本标识符的混合列表。

summary.fcgi？db=pubmed&id=193930383024220829453458
summary.fcgi？db=蛋白质&id=15718680，NP_001098858.1号,119703751

必需参数–仅当输入来自Entrez History服务器时使用

查询键

查询键。此整数指定附加到给定Web环境的UID列表中的哪一个将用作ESummary的输入。查询键是从以前的ESearch、EPost或ELink调用的输出中获得的。这个查询键参数必须与一起使用网络环境.

网络环境

Web环境。此参数指定包含要作为ESummary输入提供的UID列表的Web环境。通常，此WebEnv值是从以前的ESearch、EPost或ELink调用的输出中获得的。这个网络环境参数必须与一起使用查询键.

summary.fcgi？db=蛋白质&query_key=<key>&WebEnv=<WebEnv-string>

可选参数–检索

重新启动

要检索的第一个DocSum的顺序索引（默认值=1，对应于整个集合的第一条记录）。此参数可以与retmax（最大值）从输入集中下载DocSum的任意子集。

retmax（最大值）

要检索的输入集中的DocSum总数，最多10000个。如果总集合大于此最大值重新启动可以在按住时进行迭代retmax（最大值）常数，从而批量下载整个集合retmax（最大值）.

重新调制

检索类型。确定返回输出的格式。ESummary xml的默认值为“xml”，但也支持“json”以json格式返回输出。

版本

用于指定2.0版ESummary XML。唯一支持的值是“2.0”。如果存在，ESummary将返回每个Entrez数据库所特有的2.0版DocSum XML，它通常包含比默认DocSumXML更多的数据。

E蚀刻

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi

功能

  • 返回输入UID列表的格式化数据记录
  • 返回存储在Entrez History服务器上的一组UID的格式化数据记录

所需参数

数据库

从中检索记录的数据库。该值必须是有效的Entrez数据库名称（默认值=pubmed）。目前EFetch不支持所有Entrez数据库。请参阅表1有关可用数据库的列表，请参阅第2章。

必需参数–仅当输入来自UID列表时使用

身份证件

UID列表。可以提供单个UID或以逗号分隔的UID列表。所有UID必须来自指定的数据库数据库。对于可以传递给EFetch的UID数量没有设定最大值，但如果要提供大约200个UID，则应使用HTTP POST方法发出请求。

对于序列数据库（nuccore、popset、protein），UID列表可能是GI编号和附加版本标识符的混合列表。

efetch.fcgi？db=pubmed&id=193930383024220829453458
efetch.fcgi？db=蛋白质&id=15718680，NP_001098858.1号,119703751

序列数据库的特别说明。

NCBI不再为越来越多的新序列记录分配GI编号。因此，这些记录在Entrez中没有索引，因此无法使用ESearch或ESummary检索，并且ELink无法访问Entrez链接。E蚀刻可以通过在身份证件参数。

必需参数–仅当输入来自Entrez History服务器时使用

查询键

查询键。此整数指定附加到给定Web环境的哪个UID列表将用作EFetch的输入。查询键是从以前的ESearch、EPost或ELInk调用的输出中获得的。这个查询键参数必须与一起使用网络环境.

网络环境

Web环境。此参数指定包含要作为EFetch输入提供的UID列表的Web环境。通常，此WebEnv值是从以前的ESearch、EPost或ELink调用的输出中获得的。这个网络环境参数必须与一起使用查询键.

efetch.fcgi？db=蛋白质&query_key=<key>&WebEnv=<WebEnv-string>

可选参数–检索

重新调制

检索模式。此参数指定返回记录的数据格式，例如纯文本、HMTL或XML。请参见表1获取每个数据库的允许值的完整列表。

表格图标

表1

–EFetch的&retmode和&rettype的有效值（null=空字符串）

翻新

检索类型。此参数指定返回的记录视图，例如PubMed中的Abstract或MEDLINE，或蛋白质中的GenPept或FASTA。请参阅表1获取每个数据库的允许值的完整列表。

重新启动

要检索的第一条记录的顺序索引（默认值=0，对应于整个集合的第一条纪录）。此参数可以与retmax（最大值）从输入集中下载任意记录子集。

retmax（最大值）

要检索的输入集中的记录总数，最多10000条。（可选）对于大型集合重新启动可以在按住时进行迭代retmax（最大值）常数，从而批量下载整个集合retmax（最大值）.

可选参数–序列数据库

搁浅

要检索的DNA链。可用值为“1”表示正股，“2”表示负股。

seq_启动

要检索的第一个序列基。该值应为第一个所需基数的整数坐标，“1”表示序列的第一个基数。

顺序停止（_S）

要检索的最后一个序列基。该值应为最后一个所需基数的整数坐标，“1”表示序列的第一个基数。

复杂性

要返回的数据内容。许多序列记录是较大数据结构或“blob”的一部分复杂性参数确定要返回的blob数量。例如，mRNA可以与其蛋白质产品一起存储。可用值如下：

复杂性的价值为每个请求的GI返回的数据

0

整个blob

1

bioseq公司

2

最小bioseq集

3

最小核保护

4

最小公共场所

示例

公共医学

获取PMID 17284678和9997作为文本摘要：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=pubmed&id=17284678，9997&retmode=文本&rettype=摘要

在XML中获取PMID:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=pubmed&id=11748933，11700088&retmode=xml

公共医学中心

获取PubMed Central ID 212403的XML：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=pmc&id=212403

核苷酸/Nuccore

以FASTA格式获取GI 21614549正链的前100个碱基：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nuccore&id=21614549&strand=1&seq_start=1&seque_stop=100&rettype=fasta&retmode=text

以FASTA格式获取GI 21614549负链的前100个碱基：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nuccore&id=21614549&strand=2&req_start=1&seq_stop=100&rettype=fasta&retmode=text

获取GI 21614549的nuc-prot对象：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nuccore&id=21614549&complexty=3

获取GI 5的完整ASN.1记录：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nucleotide&id=5

获取GI 5的FASTA：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nucleotide&id=5&rettype=fasta

获取GI 5的GenBank平面文件：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nucleotide&id=5&rettype=gb

获取GI 5的GBSeqXML:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nucleotide&id=5&rettype=gb&retmode=xml

获取GI 5的TinySeqXML：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=nucleotide&id=5&rettype=fasta&retmode=xml

波普塞特

获取Popset ID 12829836的GenPept平面文件：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=popset&id=12829836&rettype=gp

蛋白质

获取GI 8的GenPept平面文件：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=protein&id=8&rettype=gp

获取GI 8的GBSeqXML:

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=protein&id=8&rettype=gp&retmode=xml

序列

获取FASTA的转录本及其蛋白产物（GIs 312836839和34577063）

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=sequences&id=312836839，34577063&rettype=fasta&retmode=text

基因

获取基因ID 2的完整XML记录：

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/efetch.fcgi？db=gene&id=2&retmode=xml

EGQuery（EGQuery）

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/egquery.fcgi

功能

提供通过单个文本查询在所有Entrez数据库中检索的记录数。

所需参数

学期

Entrez文本查询。所有特殊字符都必须经过URL编码。空格可以替换为“+”符号。对于很长的查询（长度超过数百个字符），请考虑使用HTTP POST调用。请参阅公共医学或Entrez公司有关搜索字段描述和标记的信息的帮助。搜索字段和标记特定于数据库。

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/egquery.fcgi？term=哮喘

ESpell公司

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/espell.fcgi

功能

为给定数据库中单个文本查询中的术语提供拼写建议。

所需参数

数据库

要搜索的数据库。值必须是有效的Entrez数据库名称（默认设置为pubmed）。

学期

Entrez文本查询。所有特殊字符都必须经过URL编码。空格可以替换为“+”符号。对于很长的查询（长度超过数百个字符），请考虑使用HTTP POST调用。请参阅公共医学或Entrez公司有关搜索字段描述和标记的信息的帮助。搜索字段和标记特定于数据库。

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/espell.fcgi？db=pubmed&term=asthmaa+手术+手术

ECitMatch（ECit匹配）

基本URL

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/ecitmatch.cgi网址

功能

检索与一组输入引文字符串相对应的PubMed ID（PMID）。

所需参数

数据库

要搜索的数据库。唯一支持的值是“pubmed”。

翻新

检索类型。唯一支持的值是“xml”。

bdata数据

引文字符串。每个输入引文必须由以下格式的引文字符串表示：

journal_title|year|volume|first_page|author_name|your_key|

通过用回车符（%0D）分隔字符串，可以提供多个引用字符串。这个您的密钥（_K）value是用户提供的任意标签，可以用作引文的本地标识符，它将包含在输出中。请注意，所有空格都必须替换为“+”符号，引用字符串应以最后一个竖线“|”结束。

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/enterz/eutils/ecitmatch.cgi？db=pubmed&retmode=xml&bdata=proc+natl+acad+sci+u+s+a|1991|88|3248|mann+bj|Art1|%0Dscience|1987|235|182|palmenberg+ac|Art2|

发行说明

E搜索&排序；JSON输出格式：2014年2月14日

  • ESearch现在提供了受支持的分类参数
  • EInfo、ESearch和ESummary现在以JSON格式提供输出数据

ECitMatch，EInfo 2.0版，EFetch:2013年8月9日

  • ECitMatch是一种新的电子实用程序，用作PubMed的API批引用匹配器
  • EInfo具有更新的XML输出，其中包含两个新字段：<IsTruncatable>和<IsRangeable>
  • EFetch现在支持BioProject数据库。

EFetch 2.0版。目标发布日期：2012年2月15日

  • EFetch现在支持以下数据库：biosample、biosystems和sra
  • EFetch现在为所有支持的数据库定义了&retmode和&rettype的默认值（请参见表1这些参数的所有支持值）
  • EFetch不再支持&retmode=html；包含&retmode=html的请求将使用指定数据库（&db）的默认&retmode值返回数据
  • 包含&rettype=docsum的EFetch请求返回与ESummary输出等效的XML数据

新基因组数据库发布：2011年11月9日

ESummary 2.0版。2011年11月4日

  • ESummary现在支持Entrez文档摘要（DocSums）的新的替代XML表示。新的XML对于每个Entrez数据库都是唯一的，通常包含比原始DocSum XML更广泛的记录数据。
  • 目前还没有停止使用原始DocSum XML的计划，因此开发人员可以继续使用此演示文稿，它仍将是默认的。
  • 当ESummary URL中包含&Version=2.0时，将返回2.0版XML。

示范项目

请参阅第1章用于示例Perl脚本。

有关更多信息

请参阅第1章获取有关电子实用程序的更多信息。

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