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数据库SNP 短遗传变异

欢迎阅读参考SNP(rs)报告

所有等位基因都在前进方向。单击变量详细信息选项卡有关基因组位置、基因和氨基酸变化的详细信息。HGVS名称位于HGVS选项卡

参考SNP(rs)报告

此页面报告来自新重新设计的dbSNP构建的单个dbSNP参考SNP变体(RefSNP或rs)的数据。
页面顶部报告了rs的简要摘要,下面相应的选项卡中包含了更具体的详细信息。
所有等位基因均为正向。使用基因组视图检查变体两侧的核苷酸及其相邻的核苷酸。
有关更多信息,请参阅帮助文档

1553487942卢比

当前版本156

已发布2022年9月21日

有机体
智人
职位
电话:2:177234076(GRCh38.第14页)帮助

此RefSNP的锚定位置。包括所有可能受此变化影响的核苷酸,因此它可能不同于右移的HGVS。请参见在这里了解详细信息。

等位基因
C> A/C>G/C>T
变体类型
SNV公司单核苷酸变异
频率
临床意义
在中报告ClinVar公司
基因:后果
NFE2L2:误读变量
出版物
0引用
基因组视图
在上查看rs基因组
帮助

频率选项卡显示了不同研究和人群报告的参考和替代等位基因频率表。表中的行,其中Population=“Global”指整个研究人群,而行,其中Group=“Sub”指研究特定的人群亚组(即AFR、CAU等)(如果可用)。交替等位基因(Alt allele)的频率是观察到的样本与总数的比率,其中分子(观察到的样品)是研究中存在次要等位基因的染色体数量(见“样本大小”,其中组=“Sub”),分母(总样本)是变体研究中所有染色体的总数(见“样本大小”,其中Group=“study-wide”,Population=“Global”)。

帮助

Variant Details(变量详细信息)选项卡显示基因组序列上的已知变量位置:染色体(NC_)、RefSeqGene、假基因或基因组区域(NG_),并在单独的表中显示:转录物(NM_)和蛋白质序列(NP_)。相应的转录物和蛋白质位置列在相邻行中,以及分子后果序列本体当没有蛋白质放置时,只列出转录本。“Codon[氨基酸]”列显示了“Reference>Alternate”等位基因格式中的实际碱基变化,包括转录物中的核苷酸密码子变化和蛋白质中的氨基酸变化,允许已知的核糖体滑移位点。要查看与变体相邻的核苷酸,请使用页面底部的基因组视图-放大序列,直到变体周围的核苷酸可见。

基因组植入
序列名称 更改
GRCh38.p14第2频道 NC_ 000002.12:g.177234076C>A
GRCh38.p14第2频道 NC_ 000002.12:g.177234076C>g编号
GRCh38.p14第2频道 NC_ 000002.12:g.177234076C>T
GRCh37.p13第2频道 NC_ 000002.11:g.178098804C>A
GRCh37.p13第2频道 NC_ 000002.11:g.178098804C>g
GRCh37.p13第2频道 NC_ 000002.11:g.178098804C>T
基因:NFE2L2型,NFE2样bZIP转录因子2(减股)
分子类型 更改 氨基酸[密码子] SO术语
NFE2L2转录变体7 NM_001313903.2:c.93+148G>T 不适用 内含子变异体
NFE2L2转录变体2 NM_001145412.3:c.193G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001138884.1:p.Gly65Cys G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体2 NM_001145412.3:c.193G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001138884.1:p.Gly65Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体2 NM_001145412.3:c.193G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001138884.1:p.Gly65Ser G(Gly)>S(Ser) 误读变量
NFE2L2转录变体3 NM_001145413.3:c.193G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型3 NP_001138885.1:p.Gly65Cys G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体3 NM_001145413.3:c.193G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型3 NP_001138885.1:p.Gly65Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体3 NM_001145413.3:c.193G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型3 NP_001138885.1:p.Gly65Ser G(Gly)>S(Ser) 误读变量
NFE2L2转录变体4 NM_001313900.1:c.193G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300829.1:p.甘氨酸65Cys G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体4 NM_001313900.1:c.193G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300829.1:p.Gly65Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体4 NM_001313900.1:c.193G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300829.1:p.Gly65Ser G(Gly)>S(Ser) 误读变量
NFE2L2转录变体5 NM_001313901.1:约193G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300830.1:p.甘氨酸65Cys G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体5 NM_001313901.1:c.193G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300830.1:p.Gly65Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体5 NM_001313901.1:c.193G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300830.1:p.Gly65Ser公司 G(Gly)>S(Ser) 误读变量
NFE2L2转录变体8 NM_001313904.1:c.12G>T 问[加利福尼亚州G公司]>高[加利福尼亚州] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型6 NP_001300833.1:p.Gln4His公司 Q(Gln)>H(His) 误读变量
NFE2L2转录变体8 NM_001313904.1:c.12G>c 问[加利福尼亚州G公司]>高[加利福尼亚州C类] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型6 NP_001300833.1:p.Gln4是 Q(Gln)>H(His) 误读变量
NFE2L2转录变体8 NM_001313904.1:c.12G>A 问[加利福尼亚州G公司]>问[加利福尼亚州A类] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型6 NP_001300833.1:第4页= Q(Gln)>Q(Gln) 同义变体
NFE2L2转录变体1 NM_006164.5:c.241G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红系2相关因子2亚型1 NP_006155.2:p.Gly81Cys公司 G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体1 NM_006164.5:c.241G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型1 NP_006155.2:p.Gly81Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体1 NM_006164.5:c.241G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型1 NP_006155.2:p.Gly81Ser G(Gly)>S(Ser) 误读变量
NFE2L2转录变体6 NM_001313902.2:c.241G>T G公司[G公司燃气轮机]>C[燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型4 NP_001300831.1:p.Gly81Cys公司 G(甘氨酸)>C(半胱氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体6 NM_001313902.2:c.241G>c G公司[G公司燃气轮机]>右[C类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型4 NP_001300831.1:p.Gly81Arg G(甘氨酸)>R(精氨酸) 误读变量
NFE2L2转录变体6 NM_001313902.2:c.241G>A G公司[G公司燃气轮机]>S[A类燃气轮机] 编码序列变量
核因子红细胞样2相关因子2亚型4 NP_001300831.1:p.格雷81Ser G(Gly)>S(Ser) 误读变量
帮助

“临床意义”选项卡显示以下列表临床意义ClinVar中与每个等位基因变异相关的条目。点击RCV加入(即。RCV000001615.2型)或通道ID(即。12274)以访问完整的ClinVar报告。

等位基因:T(等位基因ID:438545)
ClinVar加入 疾病名称 临床意义
RCV000513668.2号机组 免疫缺陷、发育迟缓和低同型半胱氨酸血症 致病的
帮助

别名选项卡显示HGVS名称,表示每个等位基因在基因组、转录物和蛋白质序列上的变异位置和等位基因变化。HGVS名称是用于报告序列加入和版本、序列类型、位置和等位基因变化的表达式。“注释”列可以有两个值:“diff”表示HGVS名称中报告的位置参考等位基因(变异间隔)与其他HGVSs名称中报告参考等位蛋白之间存在差异,以及“rev”是指HGVS名称中报告的位置处该变化间隔的序列与其他未标记为“rev”的HGVS名称中该变化的序列方向相反。

安置 C类= A类 G公司
GRCh38.p14第2频道 NC_ 000002.12:g.177234076= NC_ 000002.12:g.177234076C>A NC_ 000002.12:g.177234076C>g NC_ 000002.12:g.177234076C>T
GRCh37.p13第2频道 NC_ 000002.11:g.178098804= NC_ 000002.11:g.178098804C>A NC_ 000002.11:g.178098804C>g NC_ 000002.11:g.178098804C>T
NFE2L2转录变体1 NM_006164.5:c.241= NM_006164.5:c.241G>T NM_006164.5:c.241G>c NM_006164.5:c.241G>A
NFE2L2转录变体1 NM_006164.4:约241= NM_006164.4:c.241G>T NM_006164.4:c.241G>c NM_006164.4:c.241G>A
NFE2L2转录变体2 NM_001145412.3:约193= NM_001145412.3:c.193G>T NM_001145412.3:c.193G>c NM_001145412.3:c.193G>A
NFE2L2转录变体2 NM_001145412.2:约193= NM_001145412.2:c.193G>T NM_001145412.2:c.193G>c NM_001145412.2:c.193G>A
NFE2L2转录变体3 NM_001145413.3:c.193= NM_001145413.3:c.193G>T NM_001145413.3:c.193G>c NM_001145413.3:c.193G>A
NFE2L2转录变体3 NM_001145413.2:c.193= NM_001145413.2:c.193G>T NM_001145413.2:c.193G>c NM_001145413.2:c.193G>A
NFE2L2转录变体6 NM_001313902.2:约241= NM_001313902.2:c.241G>T NM_001313902.2:c.241G>c NM_001313902.2:c.241G>A
NFE2L2转录变体6 NM_001313902.1:约241= NM_001313902.1:c.241G>T NM_001313902.1:c.241G>c NM_001313902.1:c.241G>A
NFE2L2转录变体5 NM_001313901.1:约193= NM_001313901.1:c.193G>T NM_001313901.1:c.193G>c NM_001313901.1:c.193G>A
NFE2L2转录变体8 NM_001313904.1:约12= NM_001313904.1:c.12G>T NM_001313904.1:c.12G>c NM_001313904.1:c.12G>A
NFE2L2转录变体4 NM_001313900.1:约193= NM_001313900.1:c.193G>T NM_001313900.1:c.193G>c NM_001313900.1:c.193G>A
核因子红细胞样2相关因子2亚型1 NP_006155.2:第Gly81页= NP_006155.2:p.Gly81Cys公司 NP_006155.2:p.Gly81Arg NP_006155.2:p.Gly81Ser
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001138884.1:第Gly65页= NP_001138884.1:p.Gly65Cys NP_001138884.1:p.Gly65Arg NP_001138884.1:p.Gly65Ser
核因子红细胞样2相关因子2亚型3 NP_001138885.1:第Gly65页= NP_001138885.1:p.Gly65Cys NP_001138885.1:p.Gly65Arg NP_001138885.1:p.Gly65Ser
核因子红细胞样2相关因子2亚型4 NP_001300831.1:第Gly81页= NP_001300831.1:p.Gly81Cys公司 NP_001300831.1:p.Gly81Arg NP_001300831.1:p.格雷81Ser
核因子红细胞样2相关因子2亚型2 NP_001300830.1:第Gly65页= NP_001300830.1:p.Gly65Cys NP_001300830.1:p.Gly65Arg NP_001300830.1:p.Gly65Ser公司
核因子红细胞样2相关因子2亚型6 NP_001300833.1:第4页= NP_001300833.1:p.Gln4His公司 NP_001300833.1:p.Gln4His公司 NP_001300833.1:第4页=
核因子红系2相关因子2亚型2 NP_001300829.1:第Gly65页= NP_001300829.1:p.甘氨酸65Cys NP_001300829.1:p.Gly65Arg NP_001300829.1:p.Gly65Ser
NFE2L2转录变体7 NM_001313903.2:约93+148= NM_001313903.2:c.93+148G>T NM_001313903.2:c.93+148G>c NM_001313903.2:c.93+148G>A
帮助

Submissions选项卡显示最初提交给dbSNP的变体,现在支持这个RefSNP集群。当提交首次出现时,我们显示提交者句柄、提交标识符、日期和内部版本号。直接提交给dbSNP的Submission ID采用ss-prefixed number(ss#)的形式。表中列出了其他支持变量,但没有ss#。

4 SubSNP,1个ClinVar提交
提交人 提交ID 日期(制造)
1 CSS-BFX系统 ss5442107813号 2022年10月12日(156)
2 CSS-BFX系统 ss5442107814号 2022年10月12日(156)
CSS-BFX系统 ss5442107815号 2022年10月12日(156)
4 经济增加值 编号5935610155 2022年10月12日(156)
5 ClinVar公司 RCV000513668.2号机组 2022年10月12日(156)
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“历史记录”选项卡显示以前版本(Build)中的RefSNP(关联ID),这些版本现在支持当前RefSNP,以及为每个关联ID更新历史记录的日期(历史更新)。

添加到此RefSNP群集:
提交ID 观察SPDI公司 典型的SPDI公司 源RSID
ss5442107813,ss5935610155号 NC_000002.11:178098803:抄送:A NC_ 000002.12:177234075:C:A
ss5442107814,ss5935610155号 NC_000002.11:178098803:C:G NC_ 000002.12:177234075:C:G
ss5442107815,ss5935610155号 NC_000002.11:178098803:抄送 新币000002.12:177234075:C:T
RCV000513668.2号机组 NC_ 000002.12:177234075:C:T NC_ 000002.12:177234075:C:T (自我)
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Publications选项卡显示PubMed文章,引用PMID、Title、Author、Year、Journal等变量,按年份降序排列。

没有rs1553487942的出版物

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Flanks标签提供检索所有有位置的分子上SNP的侧翼序列。

基因组背景:
选择侧面长度:

基因组区域、转录物和产物
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NCBI图形序列查看器显示所报告RefSNP的基因组区域、转录物和蛋白质产物。
使用缩放选项查看RefSNP周围的核苷酸并查找其他相邻的RefSNP。
访问序列查看器有关在显示器内部导航和修改所显示数据轨迹的选择的帮助。

软件版本为:2.0.1.post761+d5e8e07