人类


Macrogen通过结合高深度测序、无与伦比的读取长度、统一的覆盖范围和采用最新技术的异常准确的结果,提供对人类基因组变异的全面访问。非常适合癌症基因组队列研究、SNP、CNV和SVs发现的对照/肿瘤比较分析以及低深度覆盖。WGS为人群基因组学、药物基因组学和遗传病提供了理想的解决方案。

Macrogen每年能够容纳300000个WGS或同等应用程序,通常的周转时间为4至6周,即使是对于高度复杂的大型项目也是如此。

全基因组测序

站台 照度 Pacbio公司 Pacbio公司
Novaseq6000 150bpPE公司

海赛Xten 150bpPE
(快递服务)***

RSII公司 Sequel系列
样品类型 gDNA、血液***、组织***、FFPE****
库套件类型 无Truseq PCR DNA试剂盒(插入350bp或550bp)

Truseq Nano DNA试剂盒(插入350bp或550bp)

铬基因组文库

10Kb SMRTbell模板

20kb SMRTbell模板

SMRTbell Express模板
样品质量控制要求 浓度:>10-20ng/ul体积:>10-100ul
总量:100ng-2ug纯度(A260/280比率):>1.7 DIN:7.0(仅限Chromimum库)
浓度:>50ng/ul体积:>120-160ul总量:6-8ug 浓度:>50ng/ul容量:>160ul总量:8ug
有关详细的样品要求,请参阅以下链接:
下载“样品质量控制标准”的完整列表
周转时间** 2-4周***或4-6周
数据分析 从头开始

•标准数据分析
–共识序列组合成连续序列

•高级数据分析
–基因预测
–基因注释

数据分析

重新排序

•标准数据分析
–绘制当前植物参考基因组
–地图统计分析
–SNP和InDels呼叫
–文本/Excel格式的变量列表

•高级数据分析
–变体注释:SNP和InDels映射到SNV的当前版本和相关基因组版本
–功能注释:基因、基因结构、氨基酸变化和公共数据库的交叉映射

–映射算法、变异检测算法、注释、映射到公共数据库、组分析和病例对照分析有多种选择


建议覆盖范围/读取长度 15倍、30倍、60倍、90倍 5-10倍 5-10倍

*图书馆建设平台

**样品质控通过的TAT

***TAT 2-4快递服务

****gDNA提取费用适用

服务概述


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