资产负债表1A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 资产负债表1A/J公司
姓名: 大疱性表皮松解修饰剂1;A/J公司
MGI编号: MGI:5817917
数量限制: 资产负债表1  位置:Chr19:41988439-41988439基点遗传位置:Chr19,同步
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
继承:    未指定
笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 211010年

大疱性表皮松解症(EB)包括一系列由罕见突变引起的机械性疾病,这些突变会导致皮肤和粘膜的结构减弱。129X1/SvJ小鼠低形态Lamc2纯合喷气发动机突变发展为一种渐进型结合型EB(JEB),最明显的特征是由于皮肤-表皮基底膜(BM)内的分离导致耳朵和尾巴起泡和结疤。

为了研究修饰基因是否影响该综合征,作者对小鼠菌株背景效应进行了调查。他们首先产生了129X1/SvJ纯合小鼠,用于低形态Lamc2杰布突变,称为129X1/SvJ-Lamc2喷气发动机老鼠。这些129X1/SvJ-Lamc2喷气发动机将小鼠回交10代至其他四个菌株背景:C57BL/6J、DBA/1J、FVB/NJ和MRL/MpJ,产生以下同源菌株:B6J.129X1-Lamc2喷气发动机,D1.129X1-灯2杰布,FVB.129X1-灯2杰布和MRL.129X1-Lamc2喷气发动机.

Lamc2团队杰布/杰布每个品系的雄性均进行年龄测定,每周进行目测检查,并对耳朵和尾巴损伤的严重程度进行定量评分。在菌株之间观察到发病年龄和这些病变的强度存在显著差异,MRL/MpJ背景显示发病最早,其次是C57BL/6J和DBA/1J,129X1/SvJ,FVB/NJ耐药率最高。雌性动物也观察到类似的应变模式,尽管发病延迟,对尾部损伤的敏感性较低。

为了确定敏感性和耐药性的遗传模式,作者分析了Lamc2杰布/杰布最敏感(MRL/MpJ)和最抗性(FVB/NJ)菌株背景的F1杂交后代。这些结果与共显性遗传一致。78周龄男性MRL-Lamc2尾部皮肤免疫荧光成像证实在透明层平面分离杰布/杰布小鼠,在FVB-Lamc2这个年龄段不明显杰布/杰布老鼠。

在表型不同的菌株之间进行杂交,以映射修饰物。两组F2 Lamc2杰布/杰布产生纯合子:

(D1.129X1-灯2喷气发动机x 129X1/SvJ-Lamc2喷气发动机)F2-灯2喷气发动机/灯2杰布

(B6J.129X1-灯2喷气发动机x FVB.129X1-灯2喷气发动机)F2-灯2喷气发动机/灯2喷气发动机,

每组200只以上。为了进行分析,将F2数据集合并以提高统计能力。考虑到男性先于女性发病,存在强烈的两性异形(Prob>chi<2>3.9 x 10<-11>)。

最稳健的QTL(prob>chi<2>=7.96 x 10<-7>)位于第19号染色体上,95%置信区间为34.50 cM,在42 cM(GRCm38)处达到峰值。该QTL在两个小鼠杂交组合中重复,与性别无关,可解释5.6%的遗传变异。该QTL名为Ebm1(大疱表皮松解修饰语1),LOD峰值约为8.2。

为了更直接地说明Ebm1 QTL的贡献,Lamc2等位基因被转移到现有的19号染色体B6和B6.Chr19和一个B6.Chr19<129S1/SvImJ>同源菌株。耳朵和尾巴得分以及尾巴张力测试对比表明,Ebm1和Ebm1<129S1/SvImJ>等位基因中度减弱疾病和Ebm1与Ebm1相比,等位基因显著减弱了疾病等位基因。灯2B6.Chr19小鼠杂合子的表型介于B6.Chr19之间和B6.Chr19灯2小鼠,证明Ebm1等位基因以共显性方式相互作用。总的来说,结果表明,限制于19号染色体的等位变异足以区分三种功能性Ebm1单倍型,其中C57BL/6J最易感,129S1/SvImJ和A/J为中间型,PWD/PhJ最具抗性。

为了精细绘制Ebm1 QTL,作者使用了辅音和同源约简方法。在所有测试的遗传背景中,结果与蛋白编码基因Col17a1是Ebm1 QTL的候选基因一致,其中C57BL/6J和129X1/SvJ等位基因最易感,A/J、DBA/1J和129S1/SvImJ为中间基因,PWD/PhJ最具抗性。

工具书类
原件:  J: 211010年Sproule TJ等,《胶原蛋白17a1作为层粘连蛋白γ2突变诱导的小鼠交界性大疱性表皮松解症的主要遗传修饰物的分子鉴定》。公共科学图书馆-遗传学。2014年2月;10(2):e1004068
全部:  1个参考

参与项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
引用这些资源
资金筹措信息
保修免责声明、隐私声明、许可和版权
将问题和评论发送到用户支持.
上次数据库更新
04/23/2024
MGI 6.23标准
杰克逊实验室