Dpn1号机组普华永道/菲律宾
QTL变量细节
总结
QTL变体: Dpn1号机组普华永道/菲律宾
姓名: Derp-1诱导的肺中性粒细胞;普华永道/菲律宾
MGI编号: MGI:5707070
数量限制: Dpn1号机组  位置:未知遗传位置:Chr2,同步
变体
起源
试样应变:  普华永道/菲律宾
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
继承:    未指定
笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 217088个

QTL参考注释

协作杂交(CC)是一个大型(约1000株系)重组近交系(RI)小鼠菌株小组,正在通过社区努力开发(Churchill等人,2004年)。CC结合了八个遗传多样的创始菌株的基因组——A/J、C57BL/6J、129S1/SvImJ、NOD/ShiLtJ、NZO/HlLtJ、CAST/EiJ、PWK/PhJ和WSB/EiJ——捕获了实验室小鼠中存在的近90%的已知变异。CC菌株是使用独特的漏斗繁殖方案获得的。一旦近交,RI-CC系可以通过重组近交杂交(RIX)产生数千个潜在的“远交”但完全可复制的基因组。名称“PreCC”用于描述仍处于近亲繁殖初期的CC小鼠的绘图群体。CTC(2004),Churchill,G.A.等人。协作交叉,一种用于复杂性状遗传分析的社区资源。自然遗传学。36, 1133-7.

使用181000个标记对151只雄性PreCC#小鼠进行连锁分析,以确定与气道中性粒细胞(PMN)募集相关的QTL。小鼠取自橡树岭国家实验室(田纳西州橡树岭)。每只小鼠都来自一个经过514代近亲繁殖的不同CC系。

QTL Dpn1在第2染色体(构建37)上定位到79.8-98 Mb,LOD峰值为7.54,与多形核中性粒细胞(PMN)募集相关。PWK/PhJ和CAST/EiJ等位基因对Dpn1基因座的表型有贡献。Zfp30被鉴定为潜在候选基因。

工具书类
原件:  J: 217088个Rutledge H等人,Zfp30、CXCL1和小鼠肺部中性粒细胞炎症的基因调控。遗传学。2014年10月;198(2):735-45
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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