阿迪普25普华永道/菲律宾
QTL变量细节
总结
QTL变体: 阿迪普25普华永道/菲律宾
姓名: 肥胖25;普华永道/菲律宾
MGI编号: MGI:5635466
QTL基因: 阿迪25  地点:Chr16:5520120-5520318基点遗传位置:Chr16,同步
变体
起源
试样应变:  普华永道/菲律宾
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 152067年

为了确定影响体重的QTL,将C57BL/6J小鼠与PWK/PhJ交配,并将得到的F2杂种用于绘图。共有479只F2小鼠(235只雌性和244只雄性)从两种互惠杂交中繁殖而来:分别从(B6雌性X PWK雄性)F1雌性X(B6女性X PWK男性)F1雄性杂交和(PWK雌性X B6雄性)F1雌鼠与(B6雌鼠X PWK雄鼠)F1雄鼠杂交中获得236只和243只F2鼠。

分析了四种表型,即体重、瘦体重、脂肪重量和脂肪百分比(脂肪重量/体重X 100)。C57BL/6J小鼠比PWK/PhJ小鼠重。

绘制了以下新的和现有的QTL

(QTL后面是与cM位置相连的峰值标记):

脂肪1(D1Mit440-54 cM),

Pbwg1.1(D2Mit285-86 cM),

Adip22(被鉴定为Adip10)(D2Mit293-11cM),

Gnf5(D2Mit285-86 cM),

Wt10q4(被鉴定为Wt10q2)(D3Mit57-55cM),

Btwq13(D3Mit5-25cM),

Afw13(被鉴定为Afw1)(D3Mit5-25 cM),

Afpq8(被鉴定为Afpq1)(D3Mit256-66cM),

Bw6b(D3Mit17-32 cM),

Epb4.1(D4Mit17-32 cM),

Adip23(被鉴定为Adip11)Adip11(D4Mit17-32 cM),

Bwq8(D5Mit123-3cM),

Bwtq14(被鉴定为Bw6d和Bwob)(rs3719351-49 cM),

Afw3(D5Mit314-59 cM),

Bwtq7(被鉴定为Bwtq 10)(D6Mit198-67 cM),

Pfat5(D6Mit284-38 cM),

Pbwg3(D7Mit223-72 cM),

Mtbcq9(识别为Mtbcq 8)(D9Mit129-26 cM),

Adip21(被鉴定为Adip5)(D9Mit123-42 cM),

Adip24(被鉴定为Adip15)(D10Mit96-56 cM),

Bw4(D11Mit285-48 cM),

Adip19(D11Mit285-52 cM),

脂肪垫3(D13Mit144-48 cM),

Bw40(被鉴定为Bw10)(D13Mit144-48 cM),

脂肪1(D16Mit107-3 cM)’

和Adip25(被鉴定为Adip17)(D16Mit107-3 cM)。

本研究中绘制的新QTL为:

重量q13,

Bwq13(别名Bwq8),

Bwq9(别名Pbwq1.1),

Bwq11(别名Pbwq3),

Pfat5(识别为Pfat2),

Gnf5(被识别为Gnf3)

和Adip19。

2014年3月10日馆长注释:

我们最初将此处确定的腹脂重QTL与小鼠Chr 3上的(D3Mit5-25 cM)定位关联为Afw1。Afw1最初是在1998年J:49578中使用DU6-xDUK的远交组合绘制的。我们认为当前的作图研究是一个单独的作图实验,并将此处确定的QTL命名为Afw13。

2015年7月1日馆长注释:

我们最初将这里鉴定的QTL关联起来,映射到D13Mit144-48 cM,即Bw10。然而,Bw10最初是在1998年J:49578中使用一个不同的杂交,即DU6 x DUK的远交组合绘制的。我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将这里鉴定的QTL命名为Bw40。

2015年1月23日策展人备注:

由于Adip5最初是在2001年使用(LG/J x SM/J)杂交在J:62610中定位的,这与这里使用的杂交不同,我们认为当前的研究是一个单独的定位实验,并将该QTL命名为Adip21。

这里提到的Adip10、Adip11、Adip15和Adip17都是2006年使用(SM/J x NZB/BlNJ)F2交叉在J:103841中绘制的,与这里使用的交叉有所不同。基于上述相同原因,我们分别将这些标记命名为Adip22、Adip23、Adip24和Adip25。

2015年11月3日馆长注释:

由于Bwtq10最初于2006年使用(SM/J x NZB/BlNJ)F2杂交在J:103841中绘制,这与此处使用的杂交不同,我们将当前研究视为单独的图谱实验,并将该QTL命名为Bwqt7,(D6Mit198-67 cM)。

2015年2月4日馆长注释:

Mtbcq8最初于2004年在J:93070中使用(NMRI8/Fbn-xDBA/2OlaHsd)F2交叉作图,这与此处使用的交叉不同,我们认为当前研究是一个新的作图实验,并命名为QTL Mtbcq9(D9Mit129-26cM)。

2015年4月14日馆长注释:

由于腹部脂肪百分比QTL 1(Afpq1)于1998年使用DU6-xDUK的外交在J:49578中进行了原始定位,这与此处使用的杂交不同,我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将QTL命名为Afpq8。

2015年4月15日馆长注释:

由于Wt10q2最初于1999年使用(MHxC57BL/6J)F2杂交在J:55483中进行了定位,这与此处使用的杂交不同,因此我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并命名为QTL Wt10q4。

2015年6月16日馆长注释:

Pbwq1.1最初是在J:121981使用B6.Cg同源小鼠绘制的,这与这里使用的C57BL/6J X PWK/PhJ小鼠不同。我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将该QTL命名为D2Mit285,Bwq9定位到Chr 2。

Pbwq3最初是在J:88536中使用(C57BL/6J x M.栗)F1 x M.栗树回交绘制的,这也与此处使用的杂交不同。我们命名了这个QTL,用D7Mit223,Bwq11定位到Chr 7。

工具书类
原件:  J: 152067年Shao H等,影响C57BL/6J x PWK/PhJ小鼠杂交体重和脂肪的遗传位点。哺乳动物基因组。2007年12月;18(12):839-51
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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