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QTL变体: |
阿迪普25普华永道/菲律宾 |
姓名: |
肥胖25;普华永道/菲律宾 |
MGI编号: |
MGI:5635466 |
QTL基因: |
阿迪25 地点:Chr16:5520120-5520318基点遗传位置:Chr16,同步 |
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该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记
为了确定影响体重的QTL,将C57BL/6J小鼠与PWK/PhJ交配,并将得到的F2杂种用于绘图。共有479只F2小鼠(235只雌性和244只雄性)从两种互惠杂交中繁殖而来:分别从(B6雌性X PWK雄性)F1雌性X(B6女性X PWK男性)F1雄性杂交和(PWK雌性X B6雄性)F1雌鼠与(B6雌鼠X PWK雄鼠)F1雄鼠杂交中获得236只和243只F2鼠。 分析了四种表型,即体重、瘦体重、脂肪重量和脂肪百分比(脂肪重量/体重X 100)。C57BL/6J小鼠比PWK/PhJ小鼠重。绘制了以下新的和现有的QTL(QTL后面是与cM位置相连的峰值标记):脂肪1(D1Mit440-54 cM),Pbwg1.1(D2Mit285-86 cM),Adip22(被鉴定为Adip10)(D2Mit293-11cM),Gnf5(D2Mit285-86 cM),Wt10q4(被鉴定为Wt10q2)(D3Mit57-55cM),Btwq13(D3Mit5-25cM),Afw13(被鉴定为Afw1)(D3Mit5-25 cM),Afpq8(被鉴定为Afpq1)(D3Mit256-66cM),Bw6b(D3Mit17-32 cM),Epb4.1(D4Mit17-32 cM),Adip23(被鉴定为Adip11)Adip11(D4Mit17-32 cM),Bwq8(D5Mit123-3cM),Bwtq14(被鉴定为Bw6d和Bwob)(rs3719351-49 cM),Afw3(D5Mit314-59 cM),Bwtq7(被鉴定为Bwtq 10)(D6Mit198-67 cM),Pfat5(D6Mit284-38 cM),Pbwg3(D7Mit223-72 cM),Mtbcq9(识别为Mtbcq 8)(D9Mit129-26 cM),Adip21(被鉴定为Adip5)(D9Mit123-42 cM),Adip24(被鉴定为Adip15)(D10Mit96-56 cM),Bw4(D11Mit285-48 cM),Adip19(D11Mit285-52 cM),脂肪垫3(D13Mit144-48 cM),Bw40(被鉴定为Bw10)(D13Mit144-48 cM),脂肪1(D16Mit107-3 cM)’和Adip25(被鉴定为Adip17)(D16Mit107-3 cM)。本研究中绘制的新QTL为:重量q13,Bwq13(别名Bwq8),Bwq9(别名Pbwq1.1),Bwq11(别名Pbwq3),Pfat5(识别为Pfat2),Gnf5(被识别为Gnf3)和Adip19。2014年3月10日馆长注释:我们最初将此处确定的腹脂重QTL与小鼠Chr 3上的(D3Mit5-25 cM)定位关联为Afw1。Afw1最初是在1998年J:49578中使用DU6-xDUK的远交组合绘制的。我们认为当前的作图研究是一个单独的作图实验,并将此处确定的QTL命名为Afw13。2015年7月1日馆长注释:我们最初将这里鉴定的QTL关联起来,映射到D13Mit144-48 cM,即Bw10。然而,Bw10最初是在1998年J:49578中使用一个不同的杂交,即DU6 x DUK的远交组合绘制的。我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将这里鉴定的QTL命名为Bw40。2015年1月23日策展人备注:由于Adip5最初是在2001年使用(LG/J x SM/J)杂交在J:62610中定位的,这与这里使用的杂交不同,我们认为当前的研究是一个单独的定位实验,并将该QTL命名为Adip21。这里提到的Adip10、Adip11、Adip15和Adip17都是2006年使用(SM/J x NZB/BlNJ)F2交叉在J:103841中绘制的,与这里使用的交叉有所不同。基于上述相同原因,我们分别将这些标记命名为Adip22、Adip23、Adip24和Adip25。2015年11月3日馆长注释:由于Bwtq10最初于2006年使用(SM/J x NZB/BlNJ)F2杂交在J:103841中绘制,这与此处使用的杂交不同,我们将当前研究视为单独的图谱实验,并将该QTL命名为Bwqt7,(D6Mit198-67 cM)。2015年2月4日馆长注释:Mtbcq8最初于2004年在J:93070中使用(NMRI8/Fbn-xDBA/2OlaHsd)F2交叉作图,这与此处使用的交叉不同,我们认为当前研究是一个新的作图实验,并命名为QTL Mtbcq9(D9Mit129-26cM)。2015年4月14日馆长注释:由于腹部脂肪百分比QTL 1(Afpq1)于1998年使用DU6-xDUK的外交在J:49578中进行了原始定位,这与此处使用的杂交不同,我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将QTL命名为Afpq8。2015年4月15日馆长注释:由于Wt10q2最初于1999年使用(MHxC57BL/6J)F2杂交在J:55483中进行了定位,这与此处使用的杂交不同,因此我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并命名为QTL Wt10q4。2015年6月16日馆长注释:Pbwq1.1最初是在J:121981使用B6.Cg同源小鼠绘制的,这与这里使用的C57BL/6J X PWK/PhJ小鼠不同。我们认为当前的定位研究是一个单独的定位实验,并将该QTL命名为D2Mit285,Bwq9定位到Chr 2。Pbwq3最初是在J:88536中使用(C57BL/6J x M.栗)F1 x M.栗树回交绘制的,这也与此处使用的杂交不同。我们命名了这个QTL,用D7Mit223,Bwq11定位到Chr 7。
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原件: |
J: 152067年Shao H等,影响C57BL/6J x PWK/PhJ小鼠杂交体重和脂肪的遗传位点。哺乳动物基因组。2007年12月;18(12):839-51 |
全部: |
1个参考 |
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