灯q1A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 灯q1A/J公司
姓名: 肝甘油三酯QTL1;A/J公司
MGI编号: MGI:3823104
数量限制: 灯q1  位置:Chr10:58237326-58237326基点遗传位置:Chr10,同步
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
注意事项

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 142667人

利用来自C57BL/6J遗传背景上A/J供体染色体的染色体替代菌株,定位与90个表型相关的QTL,包括血液、骨骼和代谢性状。(C57BL/6J-Chr 6)之间的交叉A/J公司/NaJ x C57BL/6J)F2和(C57BL/6J-Chr 10A/J公司/NaJ x C57BL/6J)F2在染色体6和10上定位了几个肥胖和肝甘油三酯QTL。在5周龄时,对动物进行高脂肪饮食,每2周称重一次,持续100天。背景菌株C57BL/6J与供者菌株A/J相比体重和肝甘油三酯水平增加。

在包含从染色体6和10衍生的嵌套片段序列的同源菌株中,研究了两个性状;CSS-6和-10用于饮食诱导肥胖,CSS-10用于肝甘油三酯水平。

Obrq1(肥胖抗性QTL 1)、Obrq2、Obrq3和Obrq4定位于小鼠6号染色体。QTL的顺序为着丝粒-Obrq2-Obrq3-Obrq4-Obrq1-端粒。

Obrq2定位于6C2(B6.A-(D6Mit138-D6Mit159)/6C2Na),并在同源区间内与D6Mit159相连。

Obrq3定位于6C3(B6.A-(D6Mit138-D6Mit223)/6C3Na),并在同源区间内与D6Mit233相连。

Obrq4定位于6C4(B6.A-(D6Mit138-D6Mit274)/6C4/Na,并在同源区间内与D6Mit244相连。

Obrq1被映射到6C12(B6.A-(D6Mit284-D6Mit15)/6C12Na)中,并在同源层段内被D6Mip284和D6Mis287侧翼包围。[图3,SI]

在第10号染色体上鉴定的QTL:

在区间内,Obrq9(肥胖抗性QTL 9)定位于与rs29331213连锁的10C1(B6.A-rs2933123/10C1Na)。

Obrq10被映射到10C2(B6.A-(rs13480792-rs29331213)/10C2Na)中,并在同源区间内与rs1348079 2相连。

Obrq11定位于10C6(B6.A-(D10Mit230-rs29331213)/10C6Na),两侧为同源区间内的标记D10Mit1230和D10Mit_95。

Obrq12定位于10C7(B6.A-(rs13480651-rs29331213)/10C7Na),两侧为同源区间内的标记rs134806501和D10Mit42。

Ltgq1被映射到与rs29359333相连的10C9(B6.A-(rs29359.333-rs29375724)/10C9Na)中。

Ltgq2(肝甘油三酯QTL 1)定位于10C1(B6.A-rs29331213/10C1Na),并与rs29331231连锁。

肝脏甘油三酯和肥胖QTL的顺序为着丝粒-Ltgq1-Obrq12-Obrq11-Obrq10-Obrq9/Ltgq2-端粒。[图S2和SI]。

工具书类
原件:  J: 142667人邵H等,复杂性状的遗传结构:大型表型效应和普遍上位性。美国国家科学院院刊2008年12月16日;105(50):19910-4
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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