阿兹dm2A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 阿兹dm2A/J公司
姓名: 阿尔茨海默病调节剂2;A/J公司
MGI编号: MGI:3817482
数量限制: 阿兹dm2  位置:未知遗传位置:峰值相关区/等位基因的Chr4,cM位置:69.05 cM
QTL注: 基于与LOD峰值评分相关的标记的基因组坐标
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
突变:    未定义
 
突变细节与C57BL/6J相比,该等位基因导致淀粉样斑块数量减少,淀粉样物质负担降低。(J: 112037个)
继承:    其他(见注释)
表型
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注意事项
Azdm2是Tg(PRNP-APPSweInd)8Dwst的修饰语,表现出加性遗传。

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 112037个

对178只(A/J-Tg(PRNP-APPSweInd)8Dwst x C57BL/6J)F2杂交动物进行连锁分析,以确定早发性阿尔茨海默病的遗传修饰物。Tg(PRNP-APPSweInd)8Dwst转基因在C57BL/6J背景下导致侵袭性早发性阿尔茨海默病,但在a/J背景下减弱,生存时间更长,脑斑块中淀粉样β沉积更少。亲本菌株A/J-Tg(PRNP-APPSweInd)8Dwst具有以下遗传结构-94%A/J、5.5%FVB和0.5%C3H。80个多态性标记以20 cM的分辨率用于基因组扫描。

Azdm1(阿尔茨海默病修饰语1)是小鼠11号染色体上与几种大脑表型相关的49 Mb间隔。与D11Mit242附近小鼠11号染色体31.7 cM上的斑块数(LOD=5.5)、可溶性淀粉样β40(LOD=4.9)和可溶性淀粉样贝塔42(LOD=0.2)显著相关。与淀粉样蛋白斑块负荷的显著联系在D11Mit4处定位为36.1 cM(LOD=5.4)。Azdm1占斑块表型变异的13%、淀粉样蛋白负荷变异的12%、淀粉样β42变异的17%和淀粉样β40变异的12%。Azdm1的A/J衍生等位基因通过加性遗传降低斑块数量和淀粉样蛋白负荷,通过共显性遗传降低大脑淀粉样蛋白40和42。Azdm1区间有840个基因。潜在候选基因包括Scpep1、Abcc3、Rnf130和Cias1。先前鉴定的Azdm1附近的QTL Pid3(34cM)图谱。与不溶性淀粉样β42的连锁在D11Mit213附近达到53.6 cM的峰值(LOD=4.9),可能代表一个单独的QTL。我们暂时将该基因座命名为Azdm5(阿尔茨海默病修饰基因5)。

斑块数(LOD=8.1)和淀粉样蛋白负荷(LOD=2.2)与D4Mit251附近66.7 cMon小鼠4号染色体显著相关。该基因座被命名为Azdm2(阿尔茨海默病修饰基因2),解释了19%的斑块数量变异和12%的淀粉样蛋白负荷变异。Azdm2的A/J衍生等位基因通过加性遗传降低斑块数量和淀粉样蛋白负荷。Azdm2 QTL区间跨度为24Mb,包含350个基因。一个潜在的候选基因是Hspg2。(71.4立方厘米)。

在D9Mit336附近的小鼠9号染色体上,斑块数(LOD=5)和淀粉样蛋白负荷(LOD=0.2)与33.9 cM显著相关。该基因座被命名为Azdm3(阿尔茨海默病修饰基因3),解释了12%的斑块数量变异和17%的淀粉样蛋白负荷变异。Azdm3的A/J衍生等位基因通过加性遗传降低斑块数量和淀粉样蛋白负担。Azmd3 QTL间隔跨越50 Mb。之前在Azdm3附近发现的QTL Appd1(21 cM)图谱。

与D8Mit223附近小鼠8号染色体上8.7 cM的斑块数显著相关(LOD=4.5)。该基因座被命名为Azdm4(阿尔茨海默病修饰语4),占变异的13%。Azdm4的A/J衍生等位基因通过加性遗传降低斑块数量。Azdm4 QTL区间跨越9 Mb,包含67个基因。潜在候选基因包括Wrn(20cM)和Atp7b(10cM)。

在D1Mit102(75.4 cM,LOD=3.6)、D1Mit159(82 cM,LOD=3.4)和D1Mit291(103 cM,LOD=3)与小鼠1号染色体上的血清淀粉样β40的潜在联系。提示与血清淀粉样β40和42的连锁映射到小鼠第6染色体D6Mit209(分别为21.9 cM,LOD=3.3和2.9)。在D6Mit188(21.9 cM,LOD=3.2)定位到小鼠6号染色体的血清淀粉样β42的暗示连锁。

工具书类
原件:  J: 112037个Sebastiani G等人,绘制TgCRND8转基因小鼠淀粉样斑块沉积的遗传调节剂。人类分子遗传学。2006年8月1日;15(15):2313-23
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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