序号7A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 序号7A/J公司
姓名: 胁迫响应QTL 7;A/J公司
MGI编号: MGI:3776393
数量限制: 序号7  位置:未知遗传位置:Chr11,同步
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 132037个

使用14个AcB(A=A/J;B=C57BL/6J)和22个BcA重组近交系(RI)菌株进行连锁分析,以鉴定与情绪性和应激反应相关的QTL。使用分辨率为2.6 cM的625个多态性标记进行基因组扫描。每个品系约有7只动物接受了野外活动和应激反应评估(身体约束、体温过低、尿量和高盐饮食下的尿液电解质)。与亲本菌株C57BL/6J相比,亲本菌株A/J表现出更高的情绪性(在旷野和高架正迷宫中的高焦虑和出现潜伏期)。父母菌株A/J在高盐饮食和身体约束引起的应激后也表现出产热、尿量和肌酐清除率下降。

在D1Mit113(93.3 cM)和D1Mit356(95.8 cM)之间的BcA-RI菌株中,定位到小鼠1号染色体的开阔地试验中与情绪性的显著连锁,LOD=4.6。该基因座被命名为Emrq1(情绪反应QTL 1)。Emrq1的潜在候选基因包括Kcnj9(94.2 cM)和Atp1a2(94.2 cM)。与C57BL/6J相比,高焦虑症菌株BcA70的Atp1a2表达下调。Bpq2(81.6 cM)和Emo1(95 cM)是之前确定的位于Emrq1附近的QTL。AcB RI菌株中D1Mit156(32.8 cM)和D1Mit435(36.9 cM)之间的Emrq2(情绪反应QTL 2)定位,LOD=3.4。Emrq2与高架迷宫测试中的情绪反应有关。Abbp1(36 cM)和Bpq1(49.7 cM)是之前确定的位于Emrq2附近的QTL。Emrq2的一个潜在候选基因是Igfbp2(36.1厘米)。

D3Mit216(58.8 cM)和D3Mit199(33.7 cM)之间的BcA RI菌株中小鼠3号染色体的情绪反应性,LOD=3.9。该基因座被命名为Emrq3(情绪反应QTL3)。Emrq3的潜在候选基因包括Pitx2(57.7 cM)和Fabp2(55 cM)。在AcB RI菌株中,在D3Mit224(22 cM)附近绘制了与应激反应期间产热的显著关联,LOD=3.3。该位点被命名为Ssrq3(应力响应QTL 3)。Hspa4l是Ssrq3的潜在候选基因。

D2Mit401(79.7 cM)和D2Mit280(81.7 cM。该位点在AcBRI菌株中鉴定,命名为Ssrq1(胁迫反应QTL 1)。Ssrq1处的A/J衍生等位基因可增强低温应激反应。Insm1是Ssrq1的潜在候选基因。

Ssrq2(应激反应QTL 2)在AcB RI菌株中定位于D15Mit175(9.9 cM)和D15Mit115(24 cM)之间的小鼠15号染色体,LOD=3.9。该位点与应激反应期间的体温过低有关。Ssrq2处的A/J衍生等位基因使低温应激反应增强。Ptger4(6.4 cM)是Ssrq2的一个潜在候选基因。之前确定的QTL Bpq6(20.2 cM)在Ssrq1附近定位。

Ssrq4(应激反应QTL 4)定位于小鼠第10号染色体D10Mit42(44 cM)和D10Mit 231(52 cM)之间,LOD=3.5。该基因座与应激反应期间的产热有显著联系,并在AcB RI菌株中发现。Ssrq4的潜在候选基因包括Cirbp(44 cM)和Igf1(48 cM)。

D4Mit2(6.5 cM)和D4Mit 361(6.75 cM)之间与高盐饮食和应激诱导的小鼠4号染色体低温显著相关,LOD=3.8。该位点在BcA RI菌株中被鉴定,命名为Ssrq5(胁迫反应QTL 5)。Triglq1(6.5 cM)是之前在Ssrq5附近发现的一个QTL定位。第4染色体上的第二个位点被发现用于高盐饮食诱导的D4Mit148(66 cM)和D4Mit54(66 cM)之间的低温反应,LOD=3.6。该位点被命名为Ssrq8(应力响应QTL 8)。Htr1d(66 cM)是该QTL的潜在候选基因。Ssrq5和Ssrq8处的A/J衍生等位基因可增强低温应激反应。AcB RI菌株的D4Mit172(8.6 cM)和D4Mit89(19.8 cM)与高盐饮食24小时后尿钙分泌显著相关(LOD=4.1)。该基因座命名为Ssrq9(应激反应QTL9)。21.5cM的Npr2是Ssrq9的潜在候选基因。

在D12Mit231(48 cM)和D12Mit101(50 cM)之间,高盐饮食诱导的尿钙排泄(LOD=4.6)与小鼠12号染色体最显著的连锁。该位点在AcB RI菌株中鉴定,命名为Ssrq6(胁迫反应QTL 6)。Calm1和Tshr(37 cM)是Ssrq6的潜在候选基因。

Ssrq7(应激反应QTL 7)显示出与24小时高盐饮食后尿量减少显著相关。该基因座在BcARI菌株中得到鉴定,并在小鼠11号染色体D11Mit245附近的44.8 cM上进行了定位(LOD=3.2)。Nos2(45.6cM)和Myo1c(44.1cM)是Ssrq7附近的潜在候选基因。

Ssrq10(胁迫反应QTL 10)定位于20 cM小鼠18号染色体D18Mit17附近(LOD=3.4)。该病与高盐饮食后的低体温反应有关,在BcA RI菌株中发现。Ssrq10处的A/J衍生等位基因使低温反应增强。20 cM的Nr3c1是Ssrq10的潜在候选基因。

24小时高盐饮食后的尿钙排泄显示与D13Mit77(73 cM)和D13Mit 78(75 cM)之间的基因座有关(LOD=4.1)。该QTL命名为Ssrq11(胁迫响应QTL 11),在AcB RI菌株中鉴定。75 cM的Fgf10是Ssrq11的潜在候选基因。

其他几个与高盐饮食诱导的尿钙排泄相关的基因座映射到小鼠染色体1(2个基因座)、2、8、11和17。所有的连接都在AcB RI菌株中被鉴定。

在BcA RI系小鼠第4号染色体(D4Mit181-D4Mit291之间,LOD=3.5,D4Mit336-D4Mit16之间,LOD=3.2)和第7号染色体(在D7Mit187-D7Mit71之间,LOD=3.5)中检测到情绪暗示位点。

在D7Mit247和D7Mit 270之间的小鼠7号染色体(LOD=3.8)、D9Mit67和D9Mit 254之间的小鼠9号染色体(LOD=380)、D11Mit74和D11Mit135之间的小鼠11号染色体(LID=3.9)和D19Mit10处的小鼠19号染色体(L OD=3.9。这些位点在BcARI菌株中被鉴定。

工具书类
原件:  J: 132037个Thifault S等,AcB/BcA重组同源小鼠情绪和应激反应的遗传决定因素,以及与心血管候选基因融合的电子证据。人类分子遗传学。2008年2月1日;17(3):331-44
全部:  1个参考

参与项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
引用这些资源
资金筹措信息
保修免责声明、隐私声明、许可和版权
将问题和评论发送到用户支持.
上次数据库更新
04/23/2024
MGI 6.23标准
杰克逊实验室