Vms1型A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: Vms1型A/J公司
姓名: 病毒性心肌炎易感性位点1;A/J公司
MGI编号: MGI:3712475
数量限制: Vms1型  位置:未知遗传位置:Chr3,同步
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
突变:    未定义
 
突变细节与C57BL/10Snsg相比,该等位基因使人更容易感染柯萨奇病毒B3诱导的心肌炎。与C57BL/10SnSg相比,该等位基因还使女性更容易受到柯萨奇病毒B3诱导的肌膜损伤。(J: 121574个)
表型
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注意事项
该等位基因纯合的F2动物中有71%表现为心肌炎。

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 121574个

对384(A/J x B10.A-H2)进行了连锁分析H2-T18型/SgSnJ)F2小鼠鉴定与宿主对柯萨奇病毒B3(CVB3)诱导的心肌炎易感性相关的QTL。基因组扫描使用了146个多态性标记,分辨率为10 cM。父母株A/J在感染后8天易出现严重和广泛的心肌细胞坏死,而父母株B10.A-H2H2-T18型/SgSnJ具有相对抗性,男性比女性更易感染。通过心肌炎严重程度评分和肌膜破裂评估心肌炎表型。

在D3Mit19附近的小鼠3号染色体86.7 cM处检测到与CVB3诱导的心肌炎相关(LOD=4.7;P=0.0046)。该基因座被命名为Vms1(病毒性心肌炎易感基因座1)。1.5 LOD支持间隔跨越16 cM距离。仅在D3Mit128(83.5 cM)时,Vms1与女性的肌膜破裂有显著联系,P=0.00148。Vms1的A/J衍生等位基因使人易患心肌炎(A/J纯合F2小鼠的71%)和肌膜破裂(雌性)。Hrtfm2(76.2 cM)是之前确定的Vms1附近的心力衰竭QTL定位。Vms1的候选基因包括Tnni3k、If1(87.7 cM)和Ifi44。

在D1Mit200附近的小鼠1号染色体上,在80 cM处检测到并证实与雄性肌膜破裂相关(P=0.00005)。该基因座被命名为Vms2(病毒性心肌炎易感性基因座2)。Vms2的1.5 LOD支持间隔跨越40 cM距离。Vms2的C57BL/10SnSg衍生等位基因增加了雄性小鼠的肌膜损伤。Ity3(71.5 cM)、Sle1(103 cM。Ptprc(aka CD45,74 cM)、Daf2(67.6 cM)和Tnnt2(60 cM)是Vms2的潜在候选基因。

Vms3(病毒性心肌炎易感性位点3)定位于D4Mit81附近小鼠4号染色体上的38 cM(P=0.0022)。1.5 LOD支持区间跨越7 cM。Vms3的C57BL/10SgSn衍生等位基因增加雄性小鼠的肌膜损伤。Vms3的潜在候选基因包括42.6 cM的干扰素α基因簇(Ifna)。

工具书类
原件:  J: 121574个Aly M等人,《宿主对柯萨奇病毒B3诱导的心肌炎易感性的复杂遗传控制》。基因免疫。2007年4月;8(3):193-204
全部:  1个参考

贡献项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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