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QTL变体: |
Hdlq48型A/J公司 |
姓名: |
高密度脂蛋白基因QTL 48;A/J公司 |
MGI编号: |
MGI:3688235 |
数量限制: |
Hdlq48型 位置:未知遗传位置:Chr19,同步 |
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该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记
使用(C57BL/6J x a/J)F2杂交群体和来源于C57BL/6J和染色体替代品系C57BL/6J Chr 3的F2杂交对与血浆高密度脂蛋白胆固醇相关的QTL进行定位和比较A/J公司,C57BL/6J-Chr 8A/J公司和C57BL/6J-Chr 11A/J公司共对578只(C57BL/6J x A/J)F2代动物进行了微卫星标记筛选,这些微卫星标记在整个小鼠基因组中均匀分布。在涉及染色体替代菌株的F2杂交中,雄性筛选了97个SNP,雌性筛选了174个SNP。在采血和分析之前,动物禁食4小时。 在小鼠1号染色体上,(C57BL/6J x A/J)F2杂交中鉴定出三个新的QTL,分别命名为Hdlq40、Hdlq41和Hdlq42。Hdlq40映射到2 cM,LOD=1.5,并在48 cM(LOD=5)与Hdlq41相互作用。Hdlq40的杂合基因型与Hdlq41的A/J等位基因相互作用,导致血浆HDL胆固醇升高。这种相互作用达到了统计学意义上的P=0.00096。Hdlq42定位于76 cM(LOD=6.4),置信区间为54 cM-92 cM。Hdlq42A/J衍生等位基因导致血浆HDL胆固醇升高,具有显性遗传。Hdlq42还与小鼠8号染色体上的Hdlq44相互作用。当Hdlq42至少存在1个C57BL/6J-衍生等位基因时,可以观察到Hdlq44(chr8)的作用。动物Hdlq44的A/J衍生等位基因纯合子和Hdlq42的C57BL/6J衍生等位点均显著降低血浆HDL胆固醇。这种相互作用达到了统计学意义上的P=0.0035。先前确定的104 cM高密度脂蛋白胆固醇QTL Hdlq15位于Hdlq42附近。在小鼠3号染色体上,在(C57BL/6J x C57BL/6J-Chr 3)中鉴定出一个新的QTL,命名为Hdlq49A/J公司)F2交叉(n=146)。Hdlq49定位于16 cM(LOD=4.2),置信区间跨越10 cM-28 cM。该位点与C57BL/6J衍生等位基因具有加性遗传,导致血浆HDL胆固醇升高。在(C57BL/6J x A/J)F2群体中,Hdlq43在小鼠4号染色体上定位为52 cM(LOD=4.4),置信区间跨越34 cM-66 cM。该位点与C57BL/6J衍生的等位基因呈隐性遗传,导致血浆HDL胆固醇升高。在(C57BL/6J x A/J)F2群体中,Hdlq44在小鼠8号染色体上定位到30 cM(LOD=9.4),置信区间为20 cM-40 cM。该基因座显示出显性遗传,C57BL/6J衍生的等位基因导致血浆HDL胆固醇升高。如上所述,Hdlq44与Hdlq42相互作用。在(C57BL/6J x C57BL/6J-Chr8)中一个新的基因座Hdlq50定位于50 cM(LOD=10.8)A/J公司)F2交叉(n=150),置信区间为44 cM-54 cM。Hdlq50与C57BL/6J衍生等位基因呈显性遗传,导致血浆HDL胆固醇升高。小鼠11号染色体,一个名为Hdlq51的新基因座,定位于(C57BL/6J x C57BL/6J-Chr 11)中的22 cM(LOD=2.3)A/J公司)F2交叉(n=179)。Hdlq51置信区间跨度为6 cM至32 cM。该基因座在(C57BL/6J x A/J)F2群体中达到提示连锁。Hdlq51表现出显性遗传,C57BL/6J衍生等位基因导致血浆HDL胆固醇升高。在(C57BL/6J x A/J)F2杂交中,Hdlq45在小鼠15号染色体(LOD=2.6)上定位到22 cM,置信区间跨越2 cM-30 cM。Hldq46在(C57BL/6J x A/J)F2杂交中定位于小鼠17号染色体上的26cM(LOD=3.4),置信区间为12cM-42cM。Hdlq46表现出与C57BL/6J衍生的等位基因的隐性遗传,这些等位基因赋予血浆高密度脂蛋白胆固醇增加。在小鼠18号染色体上,一个名为Hdlq47的新基因座在(C57BL/6J x a/J)F2群体中定位到26 cM,LOD=3。Hdlq47置信区间跨越16 cM-34 cM。Hdlq47C57BL/6J衍生的等位基因以隐性遗传方式导致血浆HDL胆固醇升高。在小鼠19号染色体上,Hdlq48在(C57BL/6J x A/J)F2群体中定位为4 cM(LOD=2.1),置信区间跨越0 cM-14 cM。
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原件: |
J: 114073个Stylianou IM等,染色体替代株和F2杂交中高密度脂蛋白胆固醇分析揭示的复杂遗传结构。遗传学。2006年10月;174(2):999-1007 |
全部: |
1个参考 |
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