尼拉克1A/J公司
QTL变量细节
总结
QTL变体: 尼拉克1A/J公司
姓名: 尼古丁诱导的运动活性1;A/J公司
MGI编号: MGI:3629994
数量限制: 尼拉克1  位置:Chr11:26011780-26011942基点遗传位置:Chr11,cM峰相关区/等位基因位置:15.63 cM
QTL注: 基于与LOD峰值评分相关的标记的基因组坐标
变体
起源
试样应变:  A/J公司
变体
描述
通道类型:    QTL(数量限制)
突变:    未定义
    与C57BL/6J相比,该等位基因降低了烟碱诱导的运动活性。(J: 143889人)
继承:    隐性的
表型
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笔记

该QTL的定位和表型信息,其变体和相关标记

J: 109827人

对13株AcB和22株BcA(A=A/J;B=C57BL/6J)重组同源(RC)菌株进行连锁分析,以确定与烟碱诱导运动活性敏感性相关的QTL。基因组扫描使用了平均分辨率为2.6 cM的625个多态性标记。亲本菌株C57BL/6J对尼古丁诱导的运动活性不敏感,而亲本菌株A/J在尼古丁给药后活性降低。QTL达到统计学意义的P<0.01如下所述。

在BcA-RC系中,与尼古丁诱导的运动活性的连锁在小鼠11号染色体上定位于峰值标记D11Mit82处的14cM和峰值标记D11Mit39处的49cM。这些位点分别命名为Nilac1(尼古丁诱导运动活性1)和Nilac2。Nilac1 QTL区间为1.5 cM至18 cM。该区域附近的潜在候选基因为Gabra1(19 cM)和Gabra6(23 cM)。Nilac1的C57BL/6J-衍生等位基因赋予增加的运动活性。Nilac2 QTL区间为47.67 cM至54 cM。Lore4(49 cM)是Nilac1附近的乙醇敏感性QTL定位。尼古丁给药后,Nilac2的C57BL/6J衍生等位基因导致运动活性降低。

在AcB-RC系中,Nilac3(尼古丁诱导的运动活性3)在小鼠2号染色体上以峰值标记D2Mit311定位到83.1 cM。QTL区间在71 cM到96 cM之间。Nilac3的A/J衍生等位基因赋予尼古丁给药后运动活性增加。84 cM的Sstr4是Nilac2的潜在候选基因。

在AcB-RC系中,Nilac4(尼古丁诱导的运动活性4)在小鼠7号染色体上以峰值标记D7Mit66定位到57.5 cM。QTL区间为57.5至66.6 cM。Nilac4的A/J衍生等位基因赋予尼古丁后运动活性增加。

在AcB-RC系中,Nilac5(尼古丁诱导的运动活性5)用峰值标记D8Mit124定位到小鼠8号染色体上的6cM。尼古丁给药后,Nilac5的A/J衍生等位基因使运动活动增强。

在AcB-RC系中,尼古丁敏感性与小鼠13号染色体上16 cM的峰标记D13Mit59有关。该位点被命名为Nilac6(尼古丁诱导的运动活性6)。QTL区间在16 cM到21 cM之间。Nilac6的A/J衍生等位基因赋予烟碱给药后增加的运动活性。在BcARC系中,与尼古丁敏感性的关联映射到D13Mit218附近的9 cM。该基因座命名为Nilac7。QTL区间从8 cM到11 cM。尼古丁给药后,Nilac7的C57BL/6J衍生等位基因增加了运动激活。

在AcBRC系中,Nilac8(尼古丁诱导的运动活性8)在小鼠14号染色体上定位为25 cM,峰值标记为D14Mit155。尼古丁给药后,Nilac8的A/J衍生等位基因使运动活动增强。

在BcA-RClines中,与尼古丁敏感性的关联映射到52 cM,峰值标记为D14Mit165。该位点命名为Nilac9。QTL区间在52 cM到60 cM之间。Nilac9的C57BL/6J衍生等位基因在尼古丁给药后使运动活动增加。

在AcB-RC系中,Nilac10(尼古丁诱导的运动活性10)在小鼠16号染色体上映射到4.3 cM,以达到峰值标记D16Mit131。QTL范围从4.3 cM到66 cM。Nilac10的A/J衍生等位基因赋予尼古丁给药后运动活性增加。23.3 cM的Drd3是Nilac10的潜在候选基因。

在BcA-RC系中,Nilac11(尼古丁诱导的运动活性11)在小鼠17号染色体上映射到56.7 cM,峰值标记为D17Mit221。尼古丁给药后,Nilac11的C57BL/6J衍生等位基因赋予运动活性增加。在AcB RC线路中检测到Nilac12,并与Nilac11重叠。该位点峰值为54.6 cM,标记为D17Mit76。QTL区间为44.5 cM至56 cM。Nilac12的A/J衍生等位基因使尼古丁给药后运动活性增加。

J: 143889人

利用A/J和C57BL/6J自交系与携带A/J衍生供体DNA的染色体替代株(CSS)在C57BL/6J遗传背景下的F2杂交,证实了先前确定的与烟碱诱导运动活性敏感性相关的QTL。亲本菌株C57BL/6J对尼古丁诱导的运动活性具有抵抗力,而亲本菌株A/J在尼古丁给药后活性降低。单次尼古丁注射后,在露天盒子中对动物进行30分钟的运动活动评估。对351只(A/J x C57BL/6J)F2代动物进行了表型分析,每个CCS系的大约23只动物(除13号和19号染色体外)进行了表型研究。基因型分析针对先前与烟碱诱导的运动QTL相关的区域。

在D11Mit62附近的小鼠11号染色体上证实了Nilac1(尼古丁诱导的运动活性1)。该基因座映射到F2杂交中的1.5cM。Nilac1的A/J衍生等位基因使运动活性降低,以应对隐性遗传的尼古丁施用。

在小鼠16号染色体上,Nilac10(尼古丁诱导的运动活性10)在F2群体中得到确认,在D16Mit131(4.3 cM)处出现峰值连锁。QTL区间在D16Mit131和D16Mit57之间为4.3 cM到21.5 cM。尼古丁给药后,Nilac10的A/J衍生等位基因使运动活动增强。这种等位基因的作用似乎占主导地位。通过对Nilac10区间的候选基因进行搜索,发现A/J和C57BL/6J菌株之间存在9个非保守氨基酸变化的基因。Abat被命名为Nilac10的潜在候选药物,因为Abat在大脑中表达,并与受可卡因和尼古丁影响的行为表型相关。Nilac10也出现在CSS生产线C57BL/6J-Chr 16中A/J公司作为女性特有的基因座。Nilac10的A/J衍生等位基因增加了雌性C57BL/6J-Chr 16的运动激活A/J公司动物。

CSS线C57BL/6J-Chr 2A/J公司证实存在Nilac3(83.1 cM)。尼古丁给药后,Nilac3的A/J衍生等位基因使运动活动增强。

小鼠14号染色体上52 cM的Nilac9(尼古丁诱导的运动活性9)在CSS株C57BL/6J-Chr 14中得到证实A/J公司尼古丁给药后,Nilac9的A/J衍生等位基因使运动活动增强。

小鼠17号染色体上56.7 cM的Nilac11(尼古丁诱导的运动活性11)在CSS株C57BL/6J-Chr 17中得到证实A/J公司Nilac11的A/J衍生等位基因赋予尼古丁给药后运动活性增加。

工具书类
原件:  J: 109827人Gill KJ等人,《尼古丁精神刺激效应的遗传基础:AcB/BcA重组同源小鼠的数量性状位点分析》。基因脑行为。2005年10月;4(7):401-11
全部:  2个参考

参与项目:
小鼠基因组数据库(MGD)、基因表达数据库(GXD)、人类癌症小鼠模型数据库(MMHCdb)(前身为小鼠肿瘤生物学(MTB))、基因本体(GO)
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